Protein–RNA interactions for Protein: A6NJU9

NPIPB13, Nuclear pore complex-interacting protein family member B13, humanhuman

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB13A6NJU9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPIPB13A6NJU9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPIPB13A6NJU9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPIPB13A6NJU9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPIPB13A6NJU9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPIPB13A6NJU9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPIPB13A6NJU9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPIPB13A6NJU9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPIPB13A6NJU9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPIPB13A6NJU9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPIPB13A6NJU9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NPIPB13A6NJU9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NPIPB13A6NJU9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NPIPB13A6NJU9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NPIPB13A6NJU9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NPIPB13A6NJU9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPIPB13A6NJU9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPIPB13A6NJU9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPIPB13A6NJU9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPIPB13A6NJU9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPIPB13A6NJU9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPIPB13A6NJU9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPIPB13A6NJU9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPIPB13A6NJU9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPIPB13A6NJU9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPIPB13A6NJU9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPIPB13A6NJU9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPIPB13A6NJU9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPIPB13A6NJU9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPIPB13A6NJU9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPIPB13A6NJU9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPIPB13A6NJU9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPIPB13A6NJU9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPIPB13A6NJU9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPIPB13A6NJU9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPIPB13A6NJU9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPIPB13A6NJU9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPIPB13A6NJU9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NPIPB13A6NJU9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NPIPB13A6NJU9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NPIPB13A6NJU9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NPIPB13A6NJU9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NPIPB13A6NJU9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NPIPB13A6NJU9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NPIPB13A6NJU9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NPIPB13A6NJU9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NPIPB13A6NJU9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NPIPB13A6NJU9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NPIPB13A6NJU9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NPIPB13A6NJU9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NPIPB13A6NJU9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NPIPB13A6NJU9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NPIPB13A6NJU9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NPIPB13A6NJU9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NPIPB13A6NJU9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NPIPB13A6NJU9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NPIPB13A6NJU9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NPIPB13A6NJU9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NPIPB13A6NJU9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NPIPB13A6NJU9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NPIPB13A6NJU9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NPIPB13A6NJU9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NPIPB13A6NJU9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NPIPB13A6NJU9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NPIPB13A6NJU9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NPIPB13A6NJU9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NPIPB13A6NJU9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NPIPB13A6NJU9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NPIPB13A6NJU9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NPIPB13A6NJU9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NPIPB13A6NJU9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NPIPB13A6NJU9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NPIPB13A6NJU9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NPIPB13A6NJU9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NPIPB13A6NJU9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NPIPB13A6NJU9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPIPB13A6NJU9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NPIPB13A6NJU9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPIPB13A6NJU9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPIPB13A6NJU9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NPIPB13A6NJU9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NPIPB13A6NJU9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NPIPB13A6NJU9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NPIPB13A6NJU9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NPIPB13A6NJU9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NPIPB13A6NJU9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NPIPB13A6NJU9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NPIPB13A6NJU9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NPIPB13A6NJU9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NPIPB13A6NJU9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NPIPB13A6NJU9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NPIPB13A6NJU9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NPIPB13A6NJU9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NPIPB13A6NJU9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NPIPB13A6NJU9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NPIPB13A6NJU9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NPIPB13A6NJU9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NPIPB13A6NJU9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NPIPB13A6NJU9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NPIPB13A6NJU9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms