Protein–RNA interactions for Protein: A6NFY4

NEMP2, Nuclear envelope integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMP2A6NFY4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEMP2A6NFY4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEMP2A6NFY4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEMP2A6NFY4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEMP2A6NFY4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEMP2A6NFY4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEMP2A6NFY4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEMP2A6NFY4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEMP2A6NFY4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEMP2A6NFY4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEMP2A6NFY4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEMP2A6NFY4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEMP2A6NFY4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEMP2A6NFY4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
NEMP2A6NFY4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEMP2A6NFY4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEMP2A6NFY4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEMP2A6NFY4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEMP2A6NFY4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NEMP2A6NFY4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEMP2A6NFY4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEMP2A6NFY4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NEMP2A6NFY4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEMP2A6NFY4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEMP2A6NFY4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEMP2A6NFY4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEMP2A6NFY4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEMP2A6NFY4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEMP2A6NFY4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEMP2A6NFY4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEMP2A6NFY4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEMP2A6NFY4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEMP2A6NFY4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEMP2A6NFY4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEMP2A6NFY4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NEMP2A6NFY4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEMP2A6NFY4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEMP2A6NFY4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEMP2A6NFY4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEMP2A6NFY4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NEMP2A6NFY4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEMP2A6NFY4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEMP2A6NFY4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEMP2A6NFY4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEMP2A6NFY4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEMP2A6NFY4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEMP2A6NFY4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NEMP2A6NFY4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEMP2A6NFY4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEMP2A6NFY4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NEMP2A6NFY4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEMP2A6NFY4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEMP2A6NFY4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEMP2A6NFY4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEMP2A6NFY4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEMP2A6NFY4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NEMP2A6NFY4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NEMP2A6NFY4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEMP2A6NFY4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEMP2A6NFY4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NEMP2A6NFY4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEMP2A6NFY4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEMP2A6NFY4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEMP2A6NFY4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEMP2A6NFY4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEMP2A6NFY4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEMP2A6NFY4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NEMP2A6NFY4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEMP2A6NFY4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEMP2A6NFY4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEMP2A6NFY4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEMP2A6NFY4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEMP2A6NFY4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEMP2A6NFY4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NEMP2A6NFY4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEMP2A6NFY4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEMP2A6NFY4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEMP2A6NFY4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NEMP2A6NFY4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEMP2A6NFY4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEMP2A6NFY4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEMP2A6NFY4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEMP2A6NFY4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEMP2A6NFY4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEMP2A6NFY4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEMP2A6NFY4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEMP2A6NFY4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEMP2A6NFY4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEMP2A6NFY4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEMP2A6NFY4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEMP2A6NFY4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NEMP2A6NFY4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEMP2A6NFY4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NEMP2A6NFY4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NEMP2A6NFY4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NEMP2A6NFY4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NEMP2A6NFY4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NEMP2A6NFY4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NEMP2A6NFY4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NEMP2A6NFY4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms