Protein–RNA interactions for Protein: A4D1U4

LCHN, Protein LCHN, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCHNA4D1U4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
LCHNA4D1U4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
LCHNA4D1U4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
LCHNA4D1U4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LCHNA4D1U4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LCHNA4D1U4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LCHNA4D1U4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
LCHNA4D1U4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LCHNA4D1U4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
LCHNA4D1U4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
LCHNA4D1U4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
LCHNA4D1U4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
LCHNA4D1U4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LCHNA4D1U4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LCHNA4D1U4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LCHNA4D1U4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LCHNA4D1U4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LCHNA4D1U4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LCHNA4D1U4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LCHNA4D1U4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
LCHNA4D1U4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LCHNA4D1U4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LCHNA4D1U4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LCHNA4D1U4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LCHNA4D1U4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LCHNA4D1U4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LCHNA4D1U4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LCHNA4D1U4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LCHNA4D1U4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LCHNA4D1U4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LCHNA4D1U4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LCHNA4D1U4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LCHNA4D1U4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LCHNA4D1U4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LCHNA4D1U4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LCHNA4D1U4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LCHNA4D1U4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LCHNA4D1U4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LCHNA4D1U4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LCHNA4D1U4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LCHNA4D1U4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LCHNA4D1U4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LCHNA4D1U4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LCHNA4D1U4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LCHNA4D1U4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LCHNA4D1U4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LCHNA4D1U4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LCHNA4D1U4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LCHNA4D1U4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LCHNA4D1U4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LCHNA4D1U4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LCHNA4D1U4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LCHNA4D1U4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LCHNA4D1U4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LCHNA4D1U4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LCHNA4D1U4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LCHNA4D1U4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LCHNA4D1U4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LCHNA4D1U4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LCHNA4D1U4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LCHNA4D1U4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LCHNA4D1U4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LCHNA4D1U4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LCHNA4D1U4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LCHNA4D1U4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LCHNA4D1U4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LCHNA4D1U4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LCHNA4D1U4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LCHNA4D1U4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LCHNA4D1U4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LCHNA4D1U4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LCHNA4D1U4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
LCHNA4D1U4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LCHNA4D1U4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LCHNA4D1U4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LCHNA4D1U4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LCHNA4D1U4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
LCHNA4D1U4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LCHNA4D1U4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
LCHNA4D1U4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LCHNA4D1U4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LCHNA4D1U4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LCHNA4D1U4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LCHNA4D1U4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LCHNA4D1U4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LCHNA4D1U4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LCHNA4D1U4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
LCHNA4D1U4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LCHNA4D1U4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LCHNA4D1U4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LCHNA4D1U4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LCHNA4D1U4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
LCHNA4D1U4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LCHNA4D1U4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LCHNA4D1U4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LCHNA4D1U4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LCHNA4D1U4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
LCHNA4D1U4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LCHNA4D1U4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LCHNA4D1U4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms