Protein–RNA interactions for Protein: A4D1N5

Putative uncharacterized protein FLJ40288, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4D1N5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
A4D1N5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
A4D1N5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
A4D1N5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
A4D1N5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
A4D1N5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
A4D1N5 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
A4D1N5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
A4D1N5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
A4D1N5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
A4D1N5 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
A4D1N5 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
A4D1N5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
A4D1N5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
A4D1N5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
A4D1N5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
A4D1N5 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
A4D1N5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
A4D1N5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
A4D1N5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
A4D1N5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
A4D1N5 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
A4D1N5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
A4D1N5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
A4D1N5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
A4D1N5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
A4D1N5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
A4D1N5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
A4D1N5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
A4D1N5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
A4D1N5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
A4D1N5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
A4D1N5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
A4D1N5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
A4D1N5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
A4D1N5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
A4D1N5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
A4D1N5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
A4D1N5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
A4D1N5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
A4D1N5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
A4D1N5 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
A4D1N5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
A4D1N5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
A4D1N5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
A4D1N5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
A4D1N5 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
A4D1N5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
A4D1N5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
A4D1N5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
A4D1N5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
A4D1N5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
A4D1N5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
A4D1N5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
A4D1N5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
A4D1N5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
A4D1N5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
A4D1N5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
A4D1N5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
A4D1N5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
A4D1N5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
A4D1N5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
A4D1N5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
A4D1N5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
A4D1N5 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
A4D1N5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
A4D1N5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
A4D1N5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
A4D1N5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
A4D1N5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
A4D1N5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
A4D1N5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
A4D1N5 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
A4D1N5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
A4D1N5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
A4D1N5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
A4D1N5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
A4D1N5 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
A4D1N5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
A4D1N5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
A4D1N5 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
A4D1N5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
A4D1N5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
A4D1N5 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
A4D1N5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
A4D1N5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
A4D1N5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
A4D1N5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
A4D1N5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
A4D1N5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
A4D1N5 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
A4D1N5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
A4D1N5 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
A4D1N5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
A4D1N5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
A4D1N5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
A4D1N5 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
A4D1N5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
A4D1N5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
A4D1N5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.7 ms