Protein–RNA interactions for Protein: A4D0S4

LAMB4, Laminin subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB4A4D0S4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
LAMB4A4D0S4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
LAMB4A4D0S4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
LAMB4A4D0S4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
LAMB4A4D0S4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC32.44■■■□□ 2.78
LAMB4A4D0S4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
LAMB4A4D0S4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
LAMB4A4D0S4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
LAMB4A4D0S4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
LAMB4A4D0S4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC32.42■■■□□ 2.78
LAMB4A4D0S4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
LAMB4A4D0S4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
LAMB4A4D0S4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
LAMB4A4D0S4 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
LAMB4A4D0S4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
LAMB4A4D0S4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
LAMB4A4D0S4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
LAMB4A4D0S4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
LAMB4A4D0S4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
LAMB4A4D0S4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
LAMB4A4D0S4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
LAMB4A4D0S4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
LAMB4A4D0S4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
LAMB4A4D0S4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
LAMB4A4D0S4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC32.36■■■□□ 2.77
LAMB4A4D0S4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
LAMB4A4D0S4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
LAMB4A4D0S4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
LAMB4A4D0S4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
LAMB4A4D0S4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
LAMB4A4D0S4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
LAMB4A4D0S4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC32.34■■■□□ 2.77
LAMB4A4D0S4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
LAMB4A4D0S4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
LAMB4A4D0S4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
LAMB4A4D0S4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
LAMB4A4D0S4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
LAMB4A4D0S4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
LAMB4A4D0S4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
LAMB4A4D0S4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
LAMB4A4D0S4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
LAMB4A4D0S4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
LAMB4A4D0S4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
LAMB4A4D0S4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
LAMB4A4D0S4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
LAMB4A4D0S4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
LAMB4A4D0S4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
LAMB4A4D0S4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
LAMB4A4D0S4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
LAMB4A4D0S4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
LAMB4A4D0S4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
LAMB4A4D0S4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
LAMB4A4D0S4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
LAMB4A4D0S4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
LAMB4A4D0S4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
LAMB4A4D0S4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
LAMB4A4D0S4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
LAMB4A4D0S4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
LAMB4A4D0S4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.76
LAMB4A4D0S4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
LAMB4A4D0S4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
LAMB4A4D0S4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
LAMB4A4D0S4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
LAMB4A4D0S4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC32.24■■■□□ 2.75
LAMB4A4D0S4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
LAMB4A4D0S4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
LAMB4A4D0S4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC32.24■■■□□ 2.75
LAMB4A4D0S4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
LAMB4A4D0S4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
LAMB4A4D0S4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
LAMB4A4D0S4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
LAMB4A4D0S4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
LAMB4A4D0S4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
LAMB4A4D0S4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
LAMB4A4D0S4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
LAMB4A4D0S4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
LAMB4A4D0S4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
LAMB4A4D0S4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
LAMB4A4D0S4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
LAMB4A4D0S4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
LAMB4A4D0S4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
LAMB4A4D0S4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
LAMB4A4D0S4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
LAMB4A4D0S4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
LAMB4A4D0S4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
LAMB4A4D0S4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
LAMB4A4D0S4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
LAMB4A4D0S4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
LAMB4A4D0S4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
LAMB4A4D0S4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
LAMB4A4D0S4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
LAMB4A4D0S4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
LAMB4A4D0S4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
LAMB4A4D0S4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
LAMB4A4D0S4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
LAMB4A4D0S4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
LAMB4A4D0S4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
LAMB4A4D0S4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.73
LAMB4A4D0S4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
LAMB4A4D0S4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms