Protein–RNA interactions for Protein: A2RUR9

CCDC144A, Coiled-coil domain-containing protein 144A, humanhuman

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144AA2RUR9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
CCDC144AA2RUR9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
CCDC144AA2RUR9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
CCDC144AA2RUR9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
CCDC144AA2RUR9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
CCDC144AA2RUR9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
CCDC144AA2RUR9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC36.72■■■■□ 3.47
CCDC144AA2RUR9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
CCDC144AA2RUR9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC36.72■■■■□ 3.47
CCDC144AA2RUR9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
CCDC144AA2RUR9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
CCDC144AA2RUR9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
CCDC144AA2RUR9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
CCDC144AA2RUR9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
CCDC144AA2RUR9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
CCDC144AA2RUR9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
CCDC144AA2RUR9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
CCDC144AA2RUR9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
CCDC144AA2RUR9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
CCDC144AA2RUR9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
CCDC144AA2RUR9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
CCDC144AA2RUR9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
CCDC144AA2RUR9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC36.67■■■■□ 3.46
CCDC144AA2RUR9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
CCDC144AA2RUR9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
CCDC144AA2RUR9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
CCDC144AA2RUR9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
CCDC144AA2RUR9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
CCDC144AA2RUR9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
CCDC144AA2RUR9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
CCDC144AA2RUR9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.46
CCDC144AA2RUR9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
CCDC144AA2RUR9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
CCDC144AA2RUR9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
CCDC144AA2RUR9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
CCDC144AA2RUR9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC36.62■■■■□ 3.45
CCDC144AA2RUR9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
CCDC144AA2RUR9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
CCDC144AA2RUR9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
CCDC144AA2RUR9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
CCDC144AA2RUR9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
CCDC144AA2RUR9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC36.61■■■■□ 3.45
CCDC144AA2RUR9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
CCDC144AA2RUR9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC36.61■■■■□ 3.45
CCDC144AA2RUR9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
CCDC144AA2RUR9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
CCDC144AA2RUR9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
CCDC144AA2RUR9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
CCDC144AA2RUR9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
CCDC144AA2RUR9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
CCDC144AA2RUR9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
CCDC144AA2RUR9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
CCDC144AA2RUR9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
CCDC144AA2RUR9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC36.54■■■■□ 3.44
CCDC144AA2RUR9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
CCDC144AA2RUR9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
CCDC144AA2RUR9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
CCDC144AA2RUR9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
CCDC144AA2RUR9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
CCDC144AA2RUR9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
CCDC144AA2RUR9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
CCDC144AA2RUR9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC36.52■■■■□ 3.44
CCDC144AA2RUR9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC36.52■■■■□ 3.44
CCDC144AA2RUR9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
CCDC144AA2RUR9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
CCDC144AA2RUR9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
CCDC144AA2RUR9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
CCDC144AA2RUR9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
CCDC144AA2RUR9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
CCDC144AA2RUR9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
CCDC144AA2RUR9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
CCDC144AA2RUR9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.43
CCDC144AA2RUR9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
CCDC144AA2RUR9 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
CCDC144AA2RUR9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
CCDC144AA2RUR9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
CCDC144AA2RUR9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
CCDC144AA2RUR9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
CCDC144AA2RUR9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
CCDC144AA2RUR9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
CCDC144AA2RUR9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
CCDC144AA2RUR9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
CCDC144AA2RUR9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
CCDC144AA2RUR9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
CCDC144AA2RUR9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
CCDC144AA2RUR9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
CCDC144AA2RUR9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
CCDC144AA2RUR9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
CCDC144AA2RUR9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
CCDC144AA2RUR9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
CCDC144AA2RUR9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
CCDC144AA2RUR9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
CCDC144AA2RUR9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
CCDC144AA2RUR9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
CCDC144AA2RUR9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
CCDC144AA2RUR9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
CCDC144AA2RUR9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
CCDC144AA2RUR9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
CCDC144AA2RUR9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
CCDC144AA2RUR9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.4 ms