Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PQ09

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PQ09 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
A0A1W2PQ09 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
A0A1W2PQ09 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A1W2PQ09 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A1W2PQ09 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A1W2PQ09 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A1W2PQ09 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A1W2PQ09 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A1W2PQ09 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A1W2PQ09 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A1W2PQ09 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A1W2PQ09 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A1W2PQ09 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A1W2PQ09 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A1W2PQ09 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A1W2PQ09 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A1W2PQ09 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A1W2PQ09 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A1W2PQ09 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A1W2PQ09 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A1W2PQ09 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A1W2PQ09 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A1W2PQ09 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A1W2PQ09 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A1W2PQ09 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A1W2PQ09 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A1W2PQ09 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A1W2PQ09 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A1W2PQ09 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A1W2PQ09 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A1W2PQ09 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A1W2PQ09 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A1W2PQ09 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A1W2PQ09 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A1W2PQ09 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A1W2PQ09 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A1W2PQ09 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A1W2PQ09 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A1W2PQ09 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A1W2PQ09 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A1W2PQ09 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A1W2PQ09 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A1W2PQ09 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A1W2PQ09 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A1W2PQ09 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A1W2PQ09 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A1W2PQ09 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A1W2PQ09 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A1W2PQ09 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A1W2PQ09 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A1W2PQ09 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A1W2PQ09 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A1W2PQ09 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A1W2PQ09 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A1W2PQ09 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A1W2PQ09 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A1W2PQ09 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A1W2PQ09 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A1W2PQ09 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A1W2PQ09 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A1W2PQ09 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A1W2PQ09 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A1W2PQ09 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A1W2PQ09 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A1W2PQ09 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A1W2PQ09 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A1W2PQ09 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A1W2PQ09 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A1W2PQ09 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A1W2PQ09 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A1W2PQ09 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A1W2PQ09 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A1W2PQ09 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A1W2PQ09 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A1W2PQ09 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
A0A1W2PQ09 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
A0A1W2PQ09 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A0A1W2PQ09 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A1W2PQ09 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A1W2PQ09 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A1W2PQ09 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A1W2PQ09 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A1W2PQ09 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A1W2PQ09 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A1W2PQ09 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A1W2PQ09 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A1W2PQ09 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A1W2PQ09 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A1W2PQ09 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A1W2PQ09 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A1W2PQ09 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A1W2PQ09 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A1W2PQ09 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A1W2PQ09 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A1W2PQ09 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A1W2PQ09 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A1W2PQ09 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A1W2PQ09 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A1W2PQ09 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A1W2PQ09 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.9 ms