Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GVM2

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1B0GVM2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
A0A1B0GVM2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
A0A1B0GVM2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
A0A1B0GVM2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
A0A1B0GVM2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
A0A1B0GVM2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
A0A1B0GVM2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
A0A1B0GVM2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
A0A1B0GVM2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
A0A1B0GVM2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
A0A1B0GVM2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
A0A1B0GVM2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
A0A1B0GVM2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
A0A1B0GVM2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
A0A1B0GVM2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
A0A1B0GVM2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
A0A1B0GVM2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
A0A1B0GVM2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
A0A1B0GVM2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
A0A1B0GVM2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
A0A1B0GVM2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
A0A1B0GVM2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
A0A1B0GVM2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
A0A1B0GVM2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
A0A1B0GVM2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
A0A1B0GVM2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
A0A1B0GVM2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
A0A1B0GVM2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
A0A1B0GVM2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
A0A1B0GVM2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
A0A1B0GVM2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
A0A1B0GVM2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
A0A1B0GVM2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
A0A1B0GVM2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
A0A1B0GVM2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
A0A1B0GVM2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
A0A1B0GVM2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
A0A1B0GVM2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
A0A1B0GVM2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
A0A1B0GVM2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
A0A1B0GVM2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
A0A1B0GVM2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
A0A1B0GVM2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
A0A1B0GVM2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
A0A1B0GVM2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
A0A1B0GVM2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
A0A1B0GVM2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
A0A1B0GVM2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
A0A1B0GVM2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
A0A1B0GVM2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
A0A1B0GVM2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
A0A1B0GVM2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
A0A1B0GVM2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
A0A1B0GVM2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
A0A1B0GVM2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
A0A1B0GVM2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
A0A1B0GVM2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
A0A1B0GVM2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
A0A1B0GVM2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
A0A1B0GVM2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
A0A1B0GVM2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
A0A1B0GVM2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
A0A1B0GVM2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
A0A1B0GVM2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
A0A1B0GVM2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
A0A1B0GVM2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
A0A1B0GVM2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
A0A1B0GVM2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
A0A1B0GVM2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
A0A1B0GVM2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
A0A1B0GVM2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
A0A1B0GVM2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
A0A1B0GVM2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
A0A1B0GVM2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
A0A1B0GVM2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
A0A1B0GVM2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
A0A1B0GVM2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
A0A1B0GVM2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
A0A1B0GVM2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
A0A1B0GVM2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
A0A1B0GVM2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
A0A1B0GVM2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
A0A1B0GVM2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
A0A1B0GVM2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
A0A1B0GVM2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
A0A1B0GVM2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
A0A1B0GVM2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
A0A1B0GVM2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
A0A1B0GVM2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
A0A1B0GVM2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
A0A1B0GVM2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
A0A1B0GVM2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
A0A1B0GVM2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
A0A1B0GVM2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
A0A1B0GVM2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
A0A1B0GVM2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
A0A1B0GVM2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
A0A1B0GVM2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
A0A1B0GVM2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
A0A1B0GVM2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms