Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQF3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQF3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
A0A0U1RQF3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
A0A0U1RQF3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
A0A0U1RQF3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
A0A0U1RQF3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
A0A0U1RQF3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
A0A0U1RQF3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
A0A0U1RQF3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
A0A0U1RQF3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
A0A0U1RQF3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
A0A0U1RQF3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
A0A0U1RQF3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
A0A0U1RQF3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
A0A0U1RQF3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
A0A0U1RQF3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
A0A0U1RQF3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
A0A0U1RQF3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
A0A0U1RQF3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
A0A0U1RQF3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
A0A0U1RQF3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
A0A0U1RQF3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
A0A0U1RQF3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
A0A0U1RQF3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
A0A0U1RQF3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
A0A0U1RQF3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
A0A0U1RQF3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
A0A0U1RQF3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
A0A0U1RQF3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
A0A0U1RQF3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
A0A0U1RQF3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
A0A0U1RQF3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
A0A0U1RQF3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
A0A0U1RQF3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
A0A0U1RQF3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
A0A0U1RQF3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
A0A0U1RQF3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
A0A0U1RQF3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
A0A0U1RQF3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
A0A0U1RQF3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
A0A0U1RQF3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
A0A0U1RQF3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
A0A0U1RQF3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
A0A0U1RQF3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
A0A0U1RQF3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
A0A0U1RQF3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
A0A0U1RQF3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
A0A0U1RQF3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
A0A0U1RQF3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
A0A0U1RQF3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
A0A0U1RQF3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
A0A0U1RQF3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
A0A0U1RQF3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
A0A0U1RQF3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
A0A0U1RQF3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
A0A0U1RQF3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
A0A0U1RQF3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
A0A0U1RQF3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
A0A0U1RQF3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
A0A0U1RQF3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
A0A0U1RQF3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
A0A0U1RQF3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
A0A0U1RQF3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
A0A0U1RQF3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
A0A0U1RQF3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
A0A0U1RQF3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
A0A0U1RQF3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
A0A0U1RQF3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
A0A0U1RQF3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
A0A0U1RQF3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
A0A0U1RQF3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
A0A0U1RQF3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
A0A0U1RQF3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
A0A0U1RQF3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
A0A0U1RQF3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
A0A0U1RQF3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
A0A0U1RQF3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
A0A0U1RQF3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
A0A0U1RQF3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
A0A0U1RQF3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
A0A0U1RQF3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
A0A0U1RQF3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
A0A0U1RQF3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
A0A0U1RQF3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
A0A0U1RQF3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
A0A0U1RQF3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
A0A0U1RQF3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
A0A0U1RQF3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
A0A0U1RQF3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
A0A0U1RQF3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
A0A0U1RQF3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
A0A0U1RQF3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
A0A0U1RQF3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
A0A0U1RQF3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
A0A0U1RQF3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
A0A0U1RQF3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
A0A0U1RQF3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
A0A0U1RQF3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
A0A0U1RQF3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
A0A0U1RQF3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
A0A0U1RQF3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms