Protein–RNA interactions for Protein: A0A087X1B8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087X1B8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
A0A087X1B8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
A0A087X1B8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
A0A087X1B8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
A0A087X1B8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
A0A087X1B8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
A0A087X1B8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
A0A087X1B8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
A0A087X1B8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
A0A087X1B8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
A0A087X1B8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
A0A087X1B8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
A0A087X1B8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
A0A087X1B8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
A0A087X1B8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
A0A087X1B8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
A0A087X1B8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
A0A087X1B8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
A0A087X1B8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
A0A087X1B8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
A0A087X1B8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
A0A087X1B8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
A0A087X1B8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
A0A087X1B8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
A0A087X1B8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
A0A087X1B8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
A0A087X1B8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
A0A087X1B8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
A0A087X1B8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
A0A087X1B8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
A0A087X1B8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
A0A087X1B8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
A0A087X1B8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
A0A087X1B8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
A0A087X1B8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
A0A087X1B8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
A0A087X1B8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
A0A087X1B8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
A0A087X1B8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
A0A087X1B8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
A0A087X1B8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
A0A087X1B8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
A0A087X1B8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
A0A087X1B8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
A0A087X1B8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
A0A087X1B8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
A0A087X1B8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
A0A087X1B8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
A0A087X1B8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
A0A087X1B8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
A0A087X1B8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
A0A087X1B8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A087X1B8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A087X1B8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A087X1B8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A087X1B8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A087X1B8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A087X1B8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A087X1B8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A087X1B8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A087X1B8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A087X1B8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
A0A087X1B8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
A0A087X1B8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
A0A087X1B8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
A0A087X1B8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
A0A087X1B8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
A0A087X1B8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
A0A087X1B8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
A0A087X1B8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
A0A087X1B8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
A0A087X1B8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
A0A087X1B8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
A0A087X1B8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
A0A087X1B8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
A0A087X1B8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
A0A087X1B8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
A0A087X1B8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
A0A087X1B8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
A0A087X1B8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
A0A087X1B8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
A0A087X1B8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
A0A087X1B8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
A0A087X1B8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
A0A087X1B8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
A0A087X1B8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
A0A087X1B8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
A0A087X1B8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
A0A087X1B8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
A0A087X1B8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
A0A087X1B8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
A0A087X1B8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
A0A087X1B8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
A0A087X1B8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
A0A087X1B8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
A0A087X1B8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
A0A087X1B8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
A0A087X1B8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
A0A087X1B8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
A0A087X1B8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms