Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6F4

TRBV21OR9-2, T-cell receptor beta variable 21/OR9-2 (pseudogene) (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
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