RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514851.1

CTXN3-203, Transcript of cortexin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CTXN3, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3-203ENST00000514851 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
CTXN3-203ENST00000514851 CHIC1Q5VXU3 224 aa21.67■■□□□ 1.06
CTXN3-203ENST00000514851 NISCHQ9Y2I1 1504 aa20.16■□□□□ 0.82
CTXN3-203ENST00000514851 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP19.24■□□□□ 0.67
CTXN3-203ENST00000514851 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP18.58■□□□□ 0.56
CTXN3-203ENST00000514851 PLPPR3Q6T4P5 718 aa17.98■□□□□ 0.47
CTXN3-203ENST00000514851 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa17.93■□□□□ 0.46
CTXN3-203ENST00000514851 ABCC9O60706 1549 aa17.78■□□□□ 0.44
CTXN3-203ENST00000514851 FOXD1Q16676 465 aa17.23■□□□□ 0.35
CTXN3-203ENST00000514851 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa16.98■□□□□ 0.31
CTXN3-203ENST00000514851 DCAF8L2P0C7V8 631 aa16.96■□□□□ 0.31
CTXN3-203ENST00000514851 ADRA2BP18089 450 aa16.93■□□□□ 0.3
CTXN3-203ENST00000514851 NACADO15069 1562 aa16.93■□□□□ 0.3
CTXN3-203ENST00000514851 MYO15BQ96JP2 1530 aa16.77■□□□□ 0.28
CTXN3-203ENST00000514851 EHMT2Q96KQ7 1210 aa16.76■□□□□ 0.27
CTXN3-203ENST00000514851 KCNA4P22459 653 aa16.75■□□□□ 0.27
CTXN3-203ENST00000514851 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
CTXN3-203ENST00000514851 PPP6R1Q9UPN7 881 aa16.69■□□□□ 0.26
CTXN3-203ENST00000514851 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP16.64■□□□□ 0.25
CTXN3-203ENST00000514851 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa16.64■□□□□ 0.25
CTXN3-203ENST00000514851 UNC13AQ9UPW8 1703 aa16.59■□□□□ 0.25
CTXN3-203ENST00000514851 DNAJC5BQ9UF47 199 aa16.55■□□□□ 0.24
CTXN3-203ENST00000514851 BICRAQ9NZM4 1560 aa16.51■□□□□ 0.23
CTXN3-203ENST00000514851 SCRIBQ14160 1630 aa16.4■□□□□ 0.22
CTXN3-203ENST00000514851 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa16.27■□□□□ 0.19
CTXN3-203ENST00000514851 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
CTXN3-203ENST00000514851 CSRNP3Q8WYN3 585 aa16.13■□□□□ 0.17
CTXN3-203ENST00000514851 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
CTXN3-203ENST00000514851 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
CTXN3-203ENST00000514851 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa16.05■□□□□ 0.16
CTXN3-203ENST00000514851 MSH5O43196 834 aa16.05■□□□□ 0.16
CTXN3-203ENST00000514851 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa16.02■□□□□ 0.16
CTXN3-203ENST00000514851 CECR2Q9BXF3 1484 aa15.99■□□□□ 0.15
CTXN3-203ENST00000514851 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP15.79■□□□□ 0.12
CTXN3-203ENST00000514851 NCAPD3P42695 1498 aa15.65■□□□□ 0.1
CTXN3-203ENST00000514851 SMARCA4P51532 1647 aa15.65■□□□□ 0.1
CTXN3-203ENST00000514851 NPM3O75607 178 aaKnown RBP15.65■□□□□ 0.1
CTXN3-203ENST00000514851 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa15.65■□□□□ 0.1
CTXN3-203ENST00000514851 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
CTXN3-203ENST00000514851 SMARCA2P51531 1590 aa15.58■□□□□ 0.08
CTXN3-203ENST00000514851 MROH2BQ7Z745 1585 aa15.55■□□□□ 0.08
CTXN3-203ENST00000514851 HMGXB3Q12766 1538 aa15.53■□□□□ 0.08
CTXN3-203ENST00000514851 PEG3Q9GZU2 1588 aa15.5■□□□□ 0.07
CTXN3-203ENST00000514851 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
CTXN3-203ENST00000514851 ZBTB22O15209 634 aa15.46■□□□□ 0.07
CTXN3-203ENST00000514851 NESP48681 1621 aa15.35■□□□□ 0.05
CTXN3-203ENST00000514851 WIZO95785 1651 aa15.35■□□□□ 0.05
CTXN3-203ENST00000514851 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa15.32■□□□□ 0.04
CTXN3-203ENST00000514851 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP15.32■□□□□ 0.04
CTXN3-203ENST00000514851 ERCC6Q03468 1493 aa15.32■□□□□ 0.04
CTXN3-203ENST00000514851 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa15.23■□□□□ 0.03
CTXN3-203ENST00000514851 CUX2O14529 1486 aa15.2■□□□□ 0.02
CTXN3-203ENST00000514851 CADPSQ9ULU8 1353 aa15.2■□□□□ 0.02
CTXN3-203ENST00000514851 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
CTXN3-203ENST00000514851 PDS5BQ9NTI5 1447 aa15.16■□□□□ 0.02
CTXN3-203ENST00000514851 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
CTXN3-203ENST00000514851 POTEDQ86YR6 584 aa15.14■□□□□ 0.01
CTXN3-203ENST00000514851 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa15.11■□□□□ 0.01
CTXN3-203ENST00000514851 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP15.11■□□□□ 0.01
CTXN3-203ENST00000514851 FOXD4L1Q9NU39 408 aa15.08■□□□□ 0
CTXN3-203ENST00000514851 CFTRP13569 1480 aa15.07■□□□□ 0
CTXN3-203ENST00000514851 CCDC88BA6NC98 1476 aa15.02■□□□□ -0
CTXN3-203ENST00000514851 FANCD2Q9BXW9 1451 aa15.01□□□□□ -0.01
CTXN3-203ENST00000514851 MRC2Q9UBG0 1479 aa15.01□□□□□ -0.01
CTXN3-203ENST00000514851 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa15□□□□□ -0.01
CTXN3-203ENST00000514851 CEP164Q9UPV0 1460 aa14.99□□□□□ -0.01
CTXN3-203ENST00000514851 WDR62O43379 1518 aa14.97□□□□□ -0.01
CTXN3-203ENST00000514851 SLC24A1O60721 1099 aa14.95□□□□□ -0.02
CTXN3-203ENST00000514851 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
CTXN3-203ENST00000514851 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
CTXN3-203ENST00000514851 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
CTXN3-203ENST00000514851 PRDM2Q13029 1718 aa14.85□□□□□ -0.03
CTXN3-203ENST00000514851 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
CTXN3-203ENST00000514851 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
CTXN3-203ENST00000514851 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
CTXN3-203ENST00000514851 TOPBP1Q92547 1522 aa14.76□□□□□ -0.05
CTXN3-203ENST00000514851 DMRT2Q9Y5R5 561 aa14.75□□□□□ -0.05
CTXN3-203ENST00000514851 ABCC8Q09428 1581 aa14.71□□□□□ -0.05
CTXN3-203ENST00000514851 IFT140Q96RY7 1462 aa14.69□□□□□ -0.06
CTXN3-203ENST00000514851 DNMBPQ6XZF7 1577 aa14.69□□□□□ -0.06
CTXN3-203ENST00000514851 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
CTXN3-203ENST00000514851 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CTXN3-203ENST00000514851 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
CTXN3-203ENST00000514851 OSCARQ8IYS5 282 aa14.59□□□□□ -0.07
CTXN3-203ENST00000514851 CUX1P39880 1505 aa14.59□□□□□ -0.07
CTXN3-203ENST00000514851 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa14.58□□□□□ -0.08
CTXN3-203ENST00000514851 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP14.57□□□□□ -0.08
CTXN3-203ENST00000514851 SLC4A2P04920 1241 aa14.57□□□□□ -0.08
CTXN3-203ENST00000514851 SOGA1O94964 1423 aa14.57□□□□□ -0.08
CTXN3-203ENST00000514851 FGD5Q6ZNL6 1462 aa14.56□□□□□ -0.08
CTXN3-203ENST00000514851 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
CTXN3-203ENST00000514851 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
CTXN3-203ENST00000514851 FKBP8Q14318 412 aa14.5□□□□□ -0.09
CTXN3-203ENST00000514851 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
CTXN3-203ENST00000514851 FBLN2P98095 1184 aa14.44□□□□□ -0.1
CTXN3-203ENST00000514851 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP14.43□□□□□ -0.1
CTXN3-203ENST00000514851 ATXN8OSP0DMR3 200 aa14.43□□□□□ -0.1
CTXN3-203ENST00000514851 TRIM41Q8WV44 630 aa14.43□□□□□ -0.1
CTXN3-203ENST00000514851 WDR97A6NE52 1622 aa14.42□□□□□ -0.1
CTXN3-203ENST00000514851 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa14.41□□□□□ -0.1
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