RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000381223.9_PAR_Y

ZBED1-203, Transcript of zinc finger BED-type containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ZBED1, Length 4,510 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1-203ENST00000381223_PAR_Y NISCHQ9Y2I1 1504 aa26.43■■□□□ 1.82
ZBED1-203ENST00000381223_PAR_Y DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.94■■□□□ 1.74
ZBED1-203ENST00000381223_PAR_Y SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
ZBED1-203ENST00000381223_PAR_Y SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.04■■□□□ 1.6
ZBED1-203ENST00000381223_PAR_Y EHMT2Q96KQ7 1210 aa24.09■■□□□ 1.45
ZBED1-203ENST00000381223_PAR_Y FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
ZBED1-203ENST00000381223_PAR_Y PCGF6Q9BYE7 350 aa23.41■■□□□ 1.34
ZBED1-203ENST00000381223_PAR_Y TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
ZBED1-203ENST00000381223_PAR_Y TRIM41Q8WV44 630 aa23.06■■□□□ 1.28
ZBED1-203ENST00000381223_PAR_Y CHIC1Q5VXU3 224 aa22.87■■□□□ 1.25
ZBED1-203ENST00000381223_PAR_Y LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa22.87■■□□□ 1.25
ZBED1-203ENST00000381223_PAR_Y RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
ZBED1-203ENST00000381223_PAR_Y PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
ZBED1-203ENST00000381223_PAR_Y APLP2Q06481 763 aa22.63■■□□□ 1.21
ZBED1-203ENST00000381223_PAR_Y UBTFP17480 764 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
ZBED1-203ENST00000381223_PAR_Y CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
ZBED1-203ENST00000381223_PAR_Y ABCC9O60706 1549 aa22.35■■□□□ 1.17
ZBED1-203ENST00000381223_PAR_Y HRCP23327 699 aa22.35■■□□□ 1.17
ZBED1-203ENST00000381223_PAR_Y TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
ZBED1-203ENST00000381223_PAR_Y ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
ZBED1-203ENST00000381223_PAR_Y ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
ZBED1-203ENST00000381223_PAR_Y PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP22.18■■□□□ 1.14
ZBED1-203ENST00000381223_PAR_Y ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
ZBED1-203ENST00000381223_PAR_Y YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
ZBED1-203ENST00000381223_PAR_Y HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
ZBED1-203ENST00000381223_PAR_Y HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
ZBED1-203ENST00000381223_PAR_Y ITGAEP38570 1179 aa21.87■■□□□ 1.09
ZBED1-203ENST00000381223_PAR_Y CENPBP07199 599 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
ZBED1-203ENST00000381223_PAR_Y SCRIBQ14160 1630 aa21.68■■□□□ 1.06
ZBED1-203ENST00000381223_PAR_Y MYO15BQ96JP2 1530 aa21.6■■□□□ 1.05
ZBED1-203ENST00000381223_PAR_Y PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
ZBED1-203ENST00000381223_PAR_Y CCDC180Q9P1Z9 1646 aa21.48■■□□□ 1.03
ZBED1-203ENST00000381223_PAR_Y DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.02
ZBED1-203ENST00000381223_PAR_Y CSRNP3Q8WYN3 585 aa21.39■■□□□ 1.01
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ZBED1-203ENST00000381223_PAR_Y FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP21.25■□□□□ 0.99
ZBED1-203ENST00000381223_PAR_Y CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP21.25■□□□□ 0.99
ZBED1-203ENST00000381223_PAR_Y P3H3Q8IVL6 736 aa21.21■□□□□ 0.99
ZBED1-203ENST00000381223_PAR_Y DCAF1Q9Y4B6 1507 aa21.16■□□□□ 0.98
ZBED1-203ENST00000381223_PAR_Y POLR3GLQ9BT43 218 aa21.15■□□□□ 0.98
ZBED1-203ENST00000381223_PAR_Y NEUROD1Q13562 356 aa21.14■□□□□ 0.97
ZBED1-203ENST00000381223_PAR_Y NEFLP07196 543 aa21.06■□□□□ 0.96
ZBED1-203ENST00000381223_PAR_Y ARID3CA6NKF2 412 aa21.05■□□□□ 0.96
ZBED1-203ENST00000381223_PAR_Y CECR2Q9BXF3 1484 aa21.04■□□□□ 0.96
ZBED1-203ENST00000381223_PAR_Y GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa20.98■□□□□ 0.95
ZBED1-203ENST00000381223_PAR_Y ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP20.96■□□□□ 0.95
ZBED1-203ENST00000381223_PAR_Y TRIM52Q96A61 297 aa20.91■□□□□ 0.94
ZBED1-203ENST00000381223_PAR_Y FBLN2P98095 1184 aa20.87■□□□□ 0.93
ZBED1-203ENST00000381223_PAR_Y MYT1LQ9UL68 1186 aa20.86■□□□□ 0.93
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ZBED1-203ENST00000381223_PAR_Y BCANQ96GW7 911 aa20.77■□□□□ 0.91
ZBED1-203ENST00000381223_PAR_Y RB1CC1Q8TDY2 1594 aa20.76■□□□□ 0.91
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ZBED1-203ENST00000381223_PAR_Y MROH2BQ7Z745 1585 aa20.69■□□□□ 0.9
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ZBED1-203ENST00000381223_PAR_Y SOGA1O94964 1423 aa20.63■□□□□ 0.89
ZBED1-203ENST00000381223_PAR_Y WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP20.63■□□□□ 0.89
ZBED1-203ENST00000381223_PAR_Y ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
ZBED1-203ENST00000381223_PAR_Y HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
ZBED1-203ENST00000381223_PAR_Y CHIC2Q9UKJ5 165 aa20.54■□□□□ 0.88
ZBED1-203ENST00000381223_PAR_Y MIER1Q8N108 512 aa20.54■□□□□ 0.88
ZBED1-203ENST00000381223_PAR_Y ANP32CO43423 234 aa20.54■□□□□ 0.88
ZBED1-203ENST00000381223_PAR_Y SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
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ZBED1-203ENST00000381223_PAR_Y CCDC88BA6NC98 1476 aa20.47■□□□□ 0.87
ZBED1-203ENST00000381223_PAR_Y SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
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ZBED1-203ENST00000381223_PAR_Y EEA1Q15075 1411 aa20.4■□□□□ 0.86
ZBED1-203ENST00000381223_PAR_Y TONSLQ96HA7 1378 aa20.33■□□□□ 0.85
ZBED1-203ENST00000381223_PAR_Y CEP164Q9UPV0 1460 aa20.3■□□□□ 0.84
ZBED1-203ENST00000381223_PAR_Y RRP7BPQ9NSQ0 103 aa20.29■□□□□ 0.84
ZBED1-203ENST00000381223_PAR_Y MTUS2Q5JR59 1369 aa20.29■□□□□ 0.84
ZBED1-203ENST00000381223_PAR_Y KIF27Q86VH2 1401 aa20.25■□□□□ 0.83
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ZBED1-203ENST00000381223_PAR_Y RUSC2Q8N2Y8 1516 aa20.21■□□□□ 0.83
ZBED1-203ENST00000381223_PAR_Y HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP20.18■□□□□ 0.82
ZBED1-203ENST00000381223_PAR_Y FAM9BQ8IZU0 186 aa20.17■□□□□ 0.82
ZBED1-203ENST00000381223_PAR_Y SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa20.14■□□□□ 0.81
ZBED1-203ENST00000381223_PAR_Y CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
ZBED1-203ENST00000381223_PAR_Y GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP20.11■□□□□ 0.81
ZBED1-203ENST00000381223_PAR_Y SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
ZBED1-203ENST00000381223_PAR_Y KDM2AQ9Y2K7 1162 aa20.1■□□□□ 0.81
ZBED1-203ENST00000381223_PAR_Y CUX2O14529 1486 aa20.09■□□□□ 0.81
ZBED1-203ENST00000381223_PAR_Y IRX6P78412 446 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
ZBED1-203ENST00000381223_PAR_Y CARMIL1Q5VZK9 1371 aa20.06■□□□□ 0.8
ZBED1-203ENST00000381223_PAR_Y MYT1Q01538 1121 aa20.06■□□□□ 0.8
ZBED1-203ENST00000381223_PAR_Y TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
ZBED1-203ENST00000381223_PAR_Y DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
ZBED1-203ENST00000381223_PAR_Y VPS8Q8N3P4 1428 aa20.04■□□□□ 0.8
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