RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261266.9

PTPRB-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 6,110 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PTPRB-201ENST00000261266 CEP162Q5TB80 1403 aa12.2□□□□□ -0.46
PTPRB-201ENST00000261266 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP12.17□□□□□ -0.46
PTPRB-201ENST00000261266 SLC24A1O60721 1099 aa12.16□□□□□ -0.46
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PTPRB-201ENST00000261266 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa12.12□□□□□ -0.47
PTPRB-201ENST00000261266 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP12.11□□□□□ -0.47
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PTPRB-201ENST00000261266 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP12.08□□□□□ -0.48
PTPRB-201ENST00000261266 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP12.08□□□□□ -0.48
PTPRB-201ENST00000261266 PDS5BQ9NTI5 1447 aa12.08□□□□□ -0.48
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PTPRB-201ENST00000261266 ANP32EQ9BTT0 268 aa12.02□□□□□ -0.49
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