RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000224016.1

Ap3m1-208, Transcript of AP-3 complex subunit mu-1, mouse

BASIC

Gene Ap3m1, Length 764 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Chic1	Q8CBW7	227 aa		22	■■□□□ 1.11
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Mapk8ip2	Q9ERE9	830 aa		21.91	■■□□□ 1.1
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Phf23	Q8BSN5	401 aa		19.65	■□□□□ 0.74
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Gab3	Q8BSM5	595 aa		18.73	■□□□□ 0.59
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Plppr3	Q7TPB0	716 aa		18.65	■□□□□ 0.58
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Senp3	Q9EP97	568 aa	Known RBP	17.85	■□□□□ 0.45
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Kcna4	Q61423	654 aa		16.62	■□□□□ 0.25
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Fam163a	Q8CAA5	168 aa		16.46	■□□□□ 0.23
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Hoxd11	P23813	323 aa		15.91	■□□□□ 0.14
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Trap1a	P19473	224 aa		15.84	■□□□□ 0.13
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Znf219	Q6IQX8	726 aa		15.43	■□□□□ 0.06
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Arsi	Q32KI9	573 aa		15.17	■□□□□ 0.02
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Chrna2	Q91X60	512 aa		15.07	■□□□□ 0
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Rsph4a	Q8BYM7	716 aa		14.96	□□□□□ -0.01
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Dmrt2	Q8BG36	561 aa		14.82	□□□□□ -0.04
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Rimbp2	Q80U40	1072 aa		14.74	□□□□□ -0.05
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Dnajc5b	Q9CQ94	199 aa		14.7	□□□□□ -0.06
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Akt1s1	Q9D1F4	257 aa		14.6	□□□□□ -0.07
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Slc34a2	Q9DBP0	697 aa		14.53	□□□□□ -0.08
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Atf5	O70191	283 aa		14.21	□□□□□ -0.13
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Hs6st3	Q9QYK4	470 aa		14.16	□□□□□ -0.14
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Ppp4r2	Q0VGB7	417 aa		14.14	□□□□□ -0.15
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Ppargc1b	Q8VHJ7	1014 aa		14.14	□□□□□ -0.15
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Slc4a1ap	E9PX68	744 aa		14.03	□□□□□ -0.16
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Gapdhs	Q64467	440 aa		13.89	□□□□□ -0.19
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Bach1	P97302	739 aa		13.81	□□□□□ -0.2
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Sox12	Q04890	314 aa		13.79	□□□□□ -0.2
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	1700123L14Rik	Q3V2K7	440 aa		13.58	□□□□□ -0.24
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Znf704	Q9ERQ3	566 aa		13.57	□□□□□ -0.24
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Slc4a5	E9Q3M5	1116 aa		13.52	□□□□□ -0.25
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Wdpcp	Q8C456	722 aa		13.37	□□□□□ -0.27
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Grwd1	Q810D6	446 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.29
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Egfem1	Q8C088	590 aa		13.21	□□□□□ -0.29
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Ifnlr1	Q8CGK5	535 aa		13.17	□□□□□ -0.3
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Zbtb7a	O88939	569 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	G430095P16Rik	E9Q913	147 aa		13.05	□□□□□ -0.32
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	C1qtnf12	Q8R2Z0	308 aa		12.91	□□□□□ -0.34
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Abcb7	Q61102	752 aa	Known RBP	12.9	□□□□□ -0.34
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Rnf216	P58283	853 aa		12.89	□□□□□ -0.35
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Zbtb12	Q9Z150	459 aa		12.83	□□□□□ -0.36
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Cacnb1	Q8R3Z5	597 aa		12.73	□□□□□ -0.37
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Cdca7	Q9D0M2	382 aa		12.72	□□□□□ -0.37
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Gtpbp6	Q3U6U5	514 aa		12.68	□□□□□ -0.38
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Nkx1-1	G3UXB3	402 aa		12.67	□□□□□ -0.38
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Znf703	P0CL69	594 aa		12.67	□□□□□ -0.38
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Kcnn1	Q9EQR3	537 aa		12.61	□□□□□ -0.39
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Ms4a5	Q810P8	197 aa		12.6	□□□□□ -0.39
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Prr29	B1ARI9	187 aa		12.59	□□□□□ -0.39
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Ildr2	B5TVM2	661 aa		12.58	□□□□□ -0.4
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Trim41	Q5NCC3	630 aa		12.55	□□□□□ -0.4
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Nlrp6	Q91WS2	869 aa		12.54	□□□□□ -0.4
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Riok3	Q9DBU3	519 aa	Known RBP	12.51	□□□□□ -0.41
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Npm2	Q80W85	207 aa		12.42	□□□□□ -0.42
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Fam71e1	A1L3C1	212 aa		12.38	□□□□□ -0.43
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Mycl	P10166	368 aa		12.35	□□□□□ -0.43
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Fbln2	P37889	1221 aa		12.24	□□□□□ -0.45
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Clcn6	O35454	870 aa		12.23	□□□□□ -0.45
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Pip4p2	Q9CZX7	257 aa		12.22	□□□□□ -0.45
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Kank3	Q9Z1P7	791 aa		12.2	□□□□□ -0.46
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Pitpnm1	O35954	1243 aa		12.19	□□□□□ -0.46
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Acrbp	Q3V140	540 aa		12.19	□□□□□ -0.46
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Pde4c	Q3UEI1	686 aa		12.1	□□□□□ -0.47
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Trim35	Q8C006	501 aa		12.1	□□□□□ -0.47
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Npm3	Q9CPP0	175 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.48
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Prm3	Q62100	101 aa		12.07	□□□□□ -0.48
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Skida1	Q80YR3	822 aa		12.02	□□□□□ -0.49
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Mpnd	Q3TV65	487 aa		12.01	□□□□□ -0.49
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Styxl1	Q9DAR2	321 aa		11.95	□□□□□ -0.5
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Gm35339	A0A140LHH9	1649 aa		11.85	□□□□□ -0.51
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Rtn4	Q99P72	1162 aa	Known RBP	11.79	□□□□□ -0.52
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Cadps2	Q8BYR5	1297 aa		11.76	□□□□□ -0.53
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Nyap1	Q6PFX7	833 aa		11.72	□□□□□ -0.53
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Tshz2	Q68FE9	1030 aa		11.69	□□□□□ -0.54
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Foxp4	Q9DBY0	795 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Dok7	Q18PE0	504 aa		11.63	□□□□□ -0.55
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Lrrc43	Q3V0L5	667 aa		11.62	□□□□□ -0.55
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Jarid2	Q62315	1234 aa		11.58	□□□□□ -0.56
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Snph	Q80U23	495 aa		11.58	□□□□□ -0.56
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Abcc9	P70170	1546 aa		11.55	□□□□□ -0.56
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Ppp1r37	Q8BKR5	712 aa		11.54	□□□□□ -0.56
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Arntl	Q9WTL8	632 aa		11.52	□□□□□ -0.57
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Nisch	Q80TM9	1593 aa		11.5	□□□□□ -0.57
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Tcf3	P15806	651 aa		11.49	□□□□□ -0.57
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Ube2u	B1AUC4	352 aa		11.46	□□□□□ -0.57
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Hnrnpul2	Q00PI9	745 aa	Known RBP	11.43	□□□□□ -0.58
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Sra1	Q80VJ2	232 aa		11.32	□□□□□ -0.6
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Gjc2	Q8BQU6	440 aa		11.32	□□□□□ -0.6
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Abcc8	B2RUS7	1588 aa		11.25	□□□□□ -0.61
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Zranb1	Q7M760	708 aa		11.23	□□□□□ -0.61
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Map3k10	Q66L42	940 aa		11.22	□□□□□ -0.61
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Znf710	Q3U288	666 aa		11.14	□□□□□ -0.63
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Ehmt2	Q9Z148	1263 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Scrib	Q80U72	1612 aa		11.1	□□□□□ -0.63
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Mycn	P03966	462 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Evx2	P49749	475 aa		11.09	□□□□□ -0.63
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Pygb	Q8CI94	843 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Crebzf	Q91ZR3	358 aa		11.09	□□□□□ -0.63
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Fxr2	Q9WVR4	673 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Hdac5	Q9Z2V6	1113 aa		11.08	□□□□□ -0.64
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Pde4d	Q01063	747 aa		11.02	□□□□□ -0.65

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