Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36.87■■■■□ 3.49
Trim35Q8C006 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Trim35Q8C006 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Trim35Q8C006 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Trim35Q8C006 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
Trim35Q8C006 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
Trim35Q8C006 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
Trim35Q8C006 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
Trim35Q8C006 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Trim35Q8C006 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Trim35Q8C006 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Trim35Q8C006 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Trim35Q8C006 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
Trim35Q8C006 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Trim35Q8C006 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Trim35Q8C006 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
Trim35Q8C006 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Trim35Q8C006 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Trim35Q8C006 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Trim35Q8C006 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
Trim35Q8C006 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Trim35Q8C006 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Trim35Q8C006 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Trim35Q8C006 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Trim35Q8C006 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Trim35Q8C006 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Trim35Q8C006 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Trim35Q8C006 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Trim35Q8C006 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Trim35Q8C006 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Trim35Q8C006 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Trim35Q8C006 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Trim35Q8C006 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Trim35Q8C006 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Trim35Q8C006 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Trim35Q8C006 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Trim35Q8C006 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Trim35Q8C006 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Trim35Q8C006 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Trim35Q8C006 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Trim35Q8C006 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Trim35Q8C006 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Trim35Q8C006 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Trim35Q8C006 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Trim35Q8C006 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Trim35Q8C006 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Trim35Q8C006 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Trim35Q8C006 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Trim35Q8C006 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Trim35Q8C006 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Trim35Q8C006 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Trim35Q8C006 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Trim35Q8C006 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Trim35Q8C006 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Trim35Q8C006 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Trim35Q8C006 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Trim35Q8C006 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Trim35Q8C006 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Trim35Q8C006 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Trim35Q8C006 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Trim35Q8C006 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Trim35Q8C006 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Trim35Q8C006 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Trim35Q8C006 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Trim35Q8C006 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Trim35Q8C006 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Trim35Q8C006 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Trim35Q8C006 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Trim35Q8C006 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Trim35Q8C006 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Trim35Q8C006 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Trim35Q8C006 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Trim35Q8C006 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Trim35Q8C006 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Trim35Q8C006 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Trim35Q8C006 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Trim35Q8C006 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Trim35Q8C006 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Trim35Q8C006 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Trim35Q8C006 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Trim35Q8C006 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Trim35Q8C006 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Trim35Q8C006 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Trim35Q8C006 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Trim35Q8C006 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Trim35Q8C006 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Trim35Q8C006 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Trim35Q8C006 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Trim35Q8C006 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Trim35Q8C006 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Trim35Q8C006 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Trim35Q8C006 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Trim35Q8C006 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Trim35Q8C006 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Trim35Q8C006 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Trim35Q8C006 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Trim35Q8C006 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Trim35Q8C006 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Trim35Q8C006 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Trim35Q8C006 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
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