RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000222550.1

Gm17872-201, mousemouse

BASIC

Gene Gm17872, Length 532 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17872-201ENSMUST00000222550 Chic1Q8CBW7 227 aa37.35■■■■□ 3.57
Gm17872-201ENSMUST00000222550 Mapk8ip2Q9ERE9 830 aa36.83■■■■□ 3.49
Gm17872-201ENSMUST00000222550 Phf23Q8BSN5 401 aa33.53■■■□□ 2.96
Gm17872-201ENSMUST00000222550 Plppr3Q7TPB0 716 aa32.07■■■□□ 2.72
Gm17872-201ENSMUST00000222550 Gab3Q8BSM5 595 aa32.02■■■□□ 2.72
Gm17872-201ENSMUST00000222550 Senp3Q9EP97 568 aaKnown RBP30.6■■■□□ 2.49
Gm17872-201ENSMUST00000222550 Kcna4Q61423 654 aa28.96■■■□□ 2.23
Gm17872-201ENSMUST00000222550 Fam163aQ8CAA5 168 aa27.53■■■□□ 2
Gm17872-201ENSMUST00000222550 Trap1aP19473 224 aa27.08■■□□□ 1.93
Gm17872-201ENSMUST00000222550 Hoxd11P23813 323 aa27.07■■□□□ 1.92
Gm17872-201ENSMUST00000222550 Znf219Q6IQX8 726 aa26.14■■□□□ 1.78
Gm17872-201ENSMUST00000222550 Dmrt2Q8BG36 561 aa25.83■■□□□ 1.73
Gm17872-201ENSMUST00000222550 Chrna2Q91X60 512 aa25.69■■□□□ 1.7
Gm17872-201ENSMUST00000222550 Rsph4aQ8BYM7 716 aa25.52■■□□□ 1.68
Gm17872-201ENSMUST00000222550 ArsiQ32KI9 573 aa25.38■■□□□ 1.65
Gm17872-201ENSMUST00000222550 Rimbp2Q80U40 1072 aa25.15■■□□□ 1.62
Gm17872-201ENSMUST00000222550 Ppargc1bQ8VHJ7 1014 aa25.09■■□□□ 1.61
Gm17872-201ENSMUST00000222550 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa24.79■■□□□ 1.56
Gm17872-201ENSMUST00000222550 Akt1s1Q9D1F4 257 aa24.73■■□□□ 1.55
Gm17872-201ENSMUST00000222550 Atf5O70191 283 aa24.69■■□□□ 1.54
Gm17872-201ENSMUST00000222550 Slc4a1apE9PX68 744 aa24.6■■□□□ 1.53
Gm17872-201ENSMUST00000222550 Ppp4r2Q0VGB7 417 aa24.49■■□□□ 1.51
Gm17872-201ENSMUST00000222550 Hs6st3Q9QYK4 470 aa24.44■■□□□ 1.5
Gm17872-201ENSMUST00000222550 Slc34a2Q9DBP0 697 aa24.18■■□□□ 1.46
Gm17872-201ENSMUST00000222550 Bach1P97302 739 aa23.76■■□□□ 1.39
Gm17872-201ENSMUST00000222550 1700123L14RikQ3V2K7 440 aa23.72■■□□□ 1.39
Gm17872-201ENSMUST00000222550 Sox12Q04890 314 aa23.56■■□□□ 1.36
Gm17872-201ENSMUST00000222550 WdpcpQ8C456 722 aa23.1■■□□□ 1.29
Gm17872-201ENSMUST00000222550 Znf704Q9ERQ3 566 aa22.75■■□□□ 1.23
Gm17872-201ENSMUST00000222550 Slc4a5E9Q3M5 1116 aa22.63■■□□□ 1.21
Gm17872-201ENSMUST00000222550 GapdhsQ64467 440 aa22.57■■□□□ 1.2
Gm17872-201ENSMUST00000222550 Ifnlr1Q8CGK5 535 aa22.52■■□□□ 1.2
Gm17872-201ENSMUST00000222550 Egfem1Q8C088 590 aa22.51■■□□□ 1.19
Gm17872-201ENSMUST00000222550 Grwd1Q810D6 446 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
Gm17872-201ENSMUST00000222550 C1qtnf12Q8R2Z0 308 aa22.45■■□□□ 1.18
Gm17872-201ENSMUST00000222550 Zbtb7aO88939 569 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
Gm17872-201ENSMUST00000222550 G430095P16RikE9Q913 147 aa22.4■■□□□ 1.18
Gm17872-201ENSMUST00000222550 Cdca7Q9D0M2 382 aa22.34■■□□□ 1.17
Gm17872-201ENSMUST00000222550 Nlrp6Q91WS2 869 aa22.21■■□□□ 1.15
Gm17872-201ENSMUST00000222550 Fam71e1A1L3C1 212 aa22.17■■□□□ 1.14
Gm17872-201ENSMUST00000222550 Abcb7Q61102 752 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
Gm17872-201ENSMUST00000222550 Rnf216P58283 853 aa21.94■■□□□ 1.1
Gm17872-201ENSMUST00000222550 Zbtb12Q9Z150 459 aa21.94■■□□□ 1.1
Gm17872-201ENSMUST00000222550 Ms4a5Q810P8 197 aa21.93■■□□□ 1.1
Gm17872-201ENSMUST00000222550 Riok3Q9DBU3 519 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
Gm17872-201ENSMUST00000222550 Gtpbp6Q3U6U5 514 aa21.76■■□□□ 1.07
Gm17872-201ENSMUST00000222550 Trim41Q5NCC3 630 aa21.76■■□□□ 1.07
Gm17872-201ENSMUST00000222550 Npm2Q80W85 207 aa21.75■■□□□ 1.07
Gm17872-201ENSMUST00000222550 AcrbpQ3V140 540 aa21.68■■□□□ 1.06
Gm17872-201ENSMUST00000222550 MyclP10166 368 aa21.67■■□□□ 1.06
Gm17872-201ENSMUST00000222550 Nkx1-1G3UXB3 402 aa21.66■■□□□ 1.06
Gm17872-201ENSMUST00000222550 Pde4cQ3UEI1 686 aa21.58■■□□□ 1.05
Gm17872-201ENSMUST00000222550 Prm3Q62100 101 aa21.38■■□□□ 1.01
Gm17872-201ENSMUST00000222550 Fbln2P37889 1221 aa21.2■□□□□ 0.98
Gm17872-201ENSMUST00000222550 Znf703P0CL69 594 aa21.17■□□□□ 0.98
Gm17872-201ENSMUST00000222550 Kcnn1Q9EQR3 537 aa21.17■□□□□ 0.98
Gm17872-201ENSMUST00000222550 Prr29B1ARI9 187 aa21.13■□□□□ 0.97
Gm17872-201ENSMUST00000222550 Ube2uB1AUC4 352 aa21.12■□□□□ 0.97
Gm17872-201ENSMUST00000222550 Styxl1Q9DAR2 321 aa21.12■□□□□ 0.97
Gm17872-201ENSMUST00000222550 Cacnb1Q8R3Z5 597 aa21.11■□□□□ 0.97
Gm17872-201ENSMUST00000222550 Ildr2B5TVM2 661 aa21.05■□□□□ 0.96
Gm17872-201ENSMUST00000222550 Rtn4Q99P72 1162 aaKnown RBP21.02■□□□□ 0.96
Gm17872-201ENSMUST00000222550 Npm3Q9CPP0 175 aaKnown RBP20.98■□□□□ 0.95
Gm17872-201ENSMUST00000222550 MpndQ3TV65 487 aa20.94■□□□□ 0.94
Gm17872-201ENSMUST00000222550 Tshz2Q68FE9 1030 aa20.92■□□□□ 0.94
Gm17872-201ENSMUST00000222550 Skida1Q80YR3 822 aa20.8■□□□□ 0.92
Gm17872-201ENSMUST00000222550 Pitpnm1O35954 1243 aa20.76■□□□□ 0.91
Gm17872-201ENSMUST00000222550 Pip4p2Q9CZX7 257 aa20.66■□□□□ 0.9
Gm17872-201ENSMUST00000222550 Kank3Q9Z1P7 791 aa20.64■□□□□ 0.89
Gm17872-201ENSMUST00000222550 Trim35Q8C006 501 aa20.63■□□□□ 0.89
Gm17872-201ENSMUST00000222550 Clcn6O35454 870 aa20.55■□□□□ 0.88
Gm17872-201ENSMUST00000222550 Tcf3P15806 651 aa20.27■□□□□ 0.84
Gm17872-201ENSMUST00000222550 Ppp1r37Q8BKR5 712 aa20.26■□□□□ 0.83
Gm17872-201ENSMUST00000222550 Cadps2Q8BYR5 1297 aa20.18■□□□□ 0.82
Gm17872-201ENSMUST00000222550 Lrrc43Q3V0L5 667 aa20.17■□□□□ 0.82
Gm17872-201ENSMUST00000222550 Jarid2Q62315 1234 aa20.14■□□□□ 0.81
Gm17872-201ENSMUST00000222550 Nyap1Q6PFX7 833 aa20.1■□□□□ 0.81
Gm17872-201ENSMUST00000222550 SnphQ80U23 495 aa19.81■□□□□ 0.76
Gm17872-201ENSMUST00000222550 Dok7Q18PE0 504 aa19.78■□□□□ 0.76
Gm17872-201ENSMUST00000222550 Hnrnpul2Q00PI9 745 aaKnown RBP19.74■□□□□ 0.75
Gm17872-201ENSMUST00000222550 Ehmt2Q9Z148 1263 aaKnown RBP19.69■□□□□ 0.74
Gm17872-201ENSMUST00000222550 Sra1Q80VJ2 232 aa19.65■□□□□ 0.74
Gm17872-201ENSMUST00000222550 Ecm2Q5FW85 670 aa19.58■□□□□ 0.72
Gm17872-201ENSMUST00000222550 Foxp4Q9DBY0 795 aaKnown RBP19.57■□□□□ 0.72
Gm17872-201ENSMUST00000222550 MycnP03966 462 aaKnown RBP19.46■□□□□ 0.71
Gm17872-201ENSMUST00000222550 Hdac5Q9Z2V6 1113 aa19.39■□□□□ 0.69
Gm17872-201ENSMUST00000222550 ArntlQ9WTL8 632 aa19.38■□□□□ 0.69
Gm17872-201ENSMUST00000222550 Pde4dQ01063 747 aa19.32■□□□□ 0.68
Gm17872-201ENSMUST00000222550 PygbQ8CI94 843 aaKnown RBP19.26■□□□□ 0.67
Gm17872-201ENSMUST00000222550 Repin1Q5U4E2 545 aa19.22■□□□□ 0.67
Gm17872-201ENSMUST00000222550 CrebzfQ91ZR3 358 aa19.22■□□□□ 0.67
Gm17872-201ENSMUST00000222550 Fam117bQ3U3E2 584 aa19.21■□□□□ 0.67
Gm17872-201ENSMUST00000222550 Zbtb7bQ64321 544 aa19.2■□□□□ 0.66
Gm17872-201ENSMUST00000222550 Zranb1Q7M760 708 aa19.19■□□□□ 0.66
Gm17872-201ENSMUST00000222550 Gm13697A2AK42 830 aa19.16■□□□□ 0.66
Gm17872-201ENSMUST00000222550 Gjc2Q8BQU6 440 aa19.16■□□□□ 0.66
Gm17872-201ENSMUST00000222550 Atad2Q8CDM1 1040 aa19.11■□□□□ 0.65
Gm17872-201ENSMUST00000222550 Map3k10Q66L42 940 aa19.09■□□□□ 0.65
Gm17872-201ENSMUST00000222550 Spock2Q9ER58 423 aa19.08■□□□□ 0.64
Gm17872-201ENSMUST00000222550 Pdap1Q3UHX2 181 aaKnown RBP19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 11.1 ms