RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000024779.14

Usp49-201, Transcript of Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Usp49, Length 8,252 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49-201ENSMUST00000024779 Rhox8Q6VSS7 320 aa28,78■■■□□ 2,2
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Usp49-201ENSMUST00000024779 Las1lA2BE28 776 aaKnown RBP25,87■■□□□ 1,73
Usp49-201ENSMUST00000024779 Ehmt2Q9Z148 1263 aaKnown RBP25,78■■□□□ 1,72
Usp49-201ENSMUST00000024779 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP25,7■■□□□ 1,71
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Usp49-201ENSMUST00000024779 Amer1Q7TS75 1132 aa25,03■■□□□ 1,6
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Usp49-201ENSMUST00000024779 Myt1lP97500 1187 aa24,87■■□□□ 1,57
Usp49-201ENSMUST00000024779 Trim41Q5NCC3 630 aa24,82■■□□□ 1,56
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Usp49-201ENSMUST00000024779 Ccdc180J3QNE4 1664 aa24,05■■□□□ 1,44
Usp49-201ENSMUST00000024779 Anp32bQ9EST5 272 aaKnown RBP24,04■■□□□ 1,44
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Usp49-201ENSMUST00000024779 NeflP08551 543 aa23,96■■□□□ 1,43
Usp49-201ENSMUST00000024779 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa23,95■■□□□ 1,42
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Usp49-201ENSMUST00000024779 4933416C03RikQ3V063 378 aa23,88■■□□□ 1,41
Usp49-201ENSMUST00000024779 NrdcQ8BHG1 1161 aa23,87■■□□□ 1,41
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Usp49-201ENSMUST00000024779 Ap3b1Q9Z1T1 1105 aa23,48■■□□□ 1,35
Usp49-201ENSMUST00000024779 HrcG5E8J6 738 aa23,42■■□□□ 1,34
Usp49-201ENSMUST00000024779 Myt1Q8CFC2 1127 aa23,27■■□□□ 1,32
Usp49-201ENSMUST00000024779 Gm13697A2AK42 830 aa23,25■■□□□ 1,31
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Usp49-201ENSMUST00000024779 Chic1Q8CBW7 227 aa23,05■■□□□ 1,28
Usp49-201ENSMUST00000024779 TonslQ6NZL6 1363 aa23,05■■□□□ 1,28
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Usp49-201ENSMUST00000024779 Gm13695A2AK44 830 aa22,84■■□□□ 1,25
Usp49-201ENSMUST00000024779 Ifnlr1Q8CGK5 535 aa22,83■■□□□ 1,25
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Usp49-201ENSMUST00000024779 Pcgf6Q99NA9 353 aa22,79■■□□□ 1,24
Usp49-201ENSMUST00000024779 Hdac5Q9Z2V6 1113 aa22,77■■□□□ 1,23
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Usp49-201ENSMUST00000024779 Polr3glQ8R0C0 218 aa22,74■■□□□ 1,23
Usp49-201ENSMUST00000024779 DaxxO35613 739 aa22,73■■□□□ 1,23
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Usp49-201ENSMUST00000024779 Plppr3Q7TPB0 716 aa22,59■■□□□ 1,21
Usp49-201ENSMUST00000024779 Lmod2Q3UHZ5 550 aa22,59■■□□□ 1,21
Usp49-201ENSMUST00000024779 Prdm10Q3UTQ7 1184 aa22,58■■□□□ 1,2
Usp49-201ENSMUST00000024779 CatipB9EKE5 520 aa22,56■■□□□ 1,2
Usp49-201ENSMUST00000024779 Anp32aO35381 247 aa22,46■■□□□ 1,19
Usp49-201ENSMUST00000024779 ArxO35085 564 aa22,46■■□□□ 1,19
Usp49-201ENSMUST00000024779 Hsp90aa1P07901 733 aaKnown RBP22,45■■□□□ 1,18
Usp49-201ENSMUST00000024779 Mier1Q5UAK0 511 aa22,42■■□□□ 1,18
Usp49-201ENSMUST00000024779 Supt5hO55201 1082 aaKnown RBP22,4■■□□□ 1,18
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Usp49-201ENSMUST00000024779 Znf326O88291 580 aa22,13■■□□□ 1,13
Usp49-201ENSMUST00000024779 Csrnp3P59055 597 aa22,07■■□□□ 1,12
Usp49-201ENSMUST00000024779 Mapk8ip2Q9ERE9 830 aa22,06■■□□□ 1,12
Usp49-201ENSMUST00000024779 Fgd1P52734 960 aa22,05■■□□□ 1,12
Usp49-201ENSMUST00000024779 Lmod3E9QA62 571 aa22,02■■□□□ 1,12
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Usp49-201ENSMUST00000024779 Ccer2J3QPU5 274 aa21,93■■□□□ 1,1
Usp49-201ENSMUST00000024779 Eid3Q3V124 375 aa21,91■■□□□ 1,1
Usp49-201ENSMUST00000024779 Rad21Q61550 635 aaKnown RBP21,9■■□□□ 1,1
Usp49-201ENSMUST00000024779 Clip1Q922J3 1391 aa21,89■■□□□ 1,1
Usp49-201ENSMUST00000024779 Clstn2Q9ER65 966 aa21,84■■□□□ 1,09
Usp49-201ENSMUST00000024779 Vsig10D3YX43 558 aa21,83■■□□□ 1,09
Usp49-201ENSMUST00000024779 Ppp4r2Q0VGB7 417 aa21,83■■□□□ 1,09
Usp49-201ENSMUST00000024779 Trim44Q9QXA7 346 aa21,83■■□□□ 1,08
Usp49-201ENSMUST00000024779 Calr4Q3TQS0 420 aa21,79■■□□□ 1,08
Usp49-201ENSMUST00000024779 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP21,79■■□□□ 1,08
Usp49-201ENSMUST00000024779 Ubl4bQ9CQ84 188 aa21,74■■□□□ 1,07
Usp49-201ENSMUST00000024779 Trim26Q99PN3 545 aa21,74■■□□□ 1,07
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