RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000024779.14

Usp49-201, Transcript of Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Usp49, Length 8,252 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49-201ENSMUST00000024779 Rhox8Q6VSS7 320 aa28.78■■■□□ 2.2
Usp49-201ENSMUST00000024779 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa26.36■■□□□ 1.81
Usp49-201ENSMUST00000024779 Cngb1E1AZ71 1325 aa26.33■■□□□ 1.81
Usp49-201ENSMUST00000024779 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.77
Usp49-201ENSMUST00000024779 Ube2uB1AUC4 352 aa25.9■■□□□ 1.74
Usp49-201ENSMUST00000024779 Las1lA2BE28 776 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
Usp49-201ENSMUST00000024779 Ehmt2Q9Z148 1263 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
Usp49-201ENSMUST00000024779 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.71
Usp49-201ENSMUST00000024779 Wdr66E9Q743 1299 aa25.68■■□□□ 1.7
Usp49-201ENSMUST00000024779 Zeb1Q64318 1117 aa25.49■■□□□ 1.67
Usp49-201ENSMUST00000024779 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa25.26■■□□□ 1.63
Usp49-201ENSMUST00000024779 Npm2Q80W85 207 aa25.24■■□□□ 1.63
Usp49-201ENSMUST00000024779 Amer1Q7TS75 1132 aa25.03■■□□□ 1.6
Usp49-201ENSMUST00000024779 Gab3Q8BSM5 595 aa24.93■■□□□ 1.58
Usp49-201ENSMUST00000024779 Myt1lP97500 1187 aa24.87■■□□□ 1.57
Usp49-201ENSMUST00000024779 Trim41Q5NCC3 630 aa24.82■■□□□ 1.56
Usp49-201ENSMUST00000024779 Stra8P70278 393 aa24.63■■□□□ 1.53
Usp49-201ENSMUST00000024779 4930567H17RikQ3V0K5 233 aa24.49■■□□□ 1.51
Usp49-201ENSMUST00000024779 CenpbP27790 599 aa24.43■■□□□ 1.5
Usp49-201ENSMUST00000024779 Slc24a1Q91WD8 1130 aa24.4■■□□□ 1.5
Usp49-201ENSMUST00000024779 Rtl1Q7M732 1744 aa24.34■■□□□ 1.49
Usp49-201ENSMUST00000024779 UbtfP25976 765 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
Usp49-201ENSMUST00000024779 NefmP08553 848 aa24.12■■□□□ 1.45
Usp49-201ENSMUST00000024779 Ccdc180J3QNE4 1664 aa24.05■■□□□ 1.44
Usp49-201ENSMUST00000024779 Anp32bQ9EST5 272 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
Usp49-201ENSMUST00000024779 NischQ80TM9 1593 aa24■■□□□ 1.43
Usp49-201ENSMUST00000024779 NeflP08551 543 aa23.96■■□□□ 1.43
Usp49-201ENSMUST00000024779 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa23.95■■□□□ 1.42
Usp49-201ENSMUST00000024779 Os9Q8K2C7 672 aa23.91■■□□□ 1.42
Usp49-201ENSMUST00000024779 4933416C03RikQ3V063 378 aa23.88■■□□□ 1.41
Usp49-201ENSMUST00000024779 NrdcQ8BHG1 1161 aa23.87■■□□□ 1.41
Usp49-201ENSMUST00000024779 Il27Q8K3I6 234 aa23.79■■□□□ 1.4
Usp49-201ENSMUST00000024779 Acin1Q9JIX8 1338 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
Usp49-201ENSMUST00000024779 Neurod1Q60867 357 aa23.69■■□□□ 1.38
Usp49-201ENSMUST00000024779 Fam50aQ9WV03 339 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
Usp49-201ENSMUST00000024779 NclP09405 707 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
Usp49-201ENSMUST00000024779 Cdk11bP24788 784 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
Usp49-201ENSMUST00000024779 Eif5bQ05D44 1216 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
Usp49-201ENSMUST00000024779 Tnnt3Q9QZ47 272 aa23.52■■□□□ 1.36
Usp49-201ENSMUST00000024779 Ap3b1Q9Z1T1 1105 aa23.48■■□□□ 1.35
Usp49-201ENSMUST00000024779 HrcG5E8J6 738 aa23.42■■□□□ 1.34
Usp49-201ENSMUST00000024779 Myt1Q8CFC2 1127 aa23.27■■□□□ 1.32
Usp49-201ENSMUST00000024779 Gm13697A2AK42 830 aa23.25■■□□□ 1.31
Usp49-201ENSMUST00000024779 Nop58Q6DFW4 536 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
Usp49-201ENSMUST00000024779 Zbtb7cQ8VCZ7 619 aa23.06■■□□□ 1.28
Usp49-201ENSMUST00000024779 Rtl5Q5DTT4 599 aa23.05■■□□□ 1.28
Usp49-201ENSMUST00000024779 Chic1Q8CBW7 227 aa23.05■■□□□ 1.28
Usp49-201ENSMUST00000024779 TonslQ6NZL6 1363 aa23.05■■□□□ 1.28
Usp49-201ENSMUST00000024779 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
Usp49-201ENSMUST00000024779 Hnrnpul2Q00PI9 745 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
Usp49-201ENSMUST00000024779 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa22.97■■□□□ 1.27
Usp49-201ENSMUST00000024779 DiexfQ8BTT6 772 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
Usp49-201ENSMUST00000024779 Atp1b4Q99ME6 356 aa22.96■■□□□ 1.27
Usp49-201ENSMUST00000024779 Nlrp6Q91WS2 869 aa22.89■■□□□ 1.25
Usp49-201ENSMUST00000024779 Ppargc1bQ8VHJ7 1014 aa22.88■■□□□ 1.25
Usp49-201ENSMUST00000024779 Gm13695A2AK44 830 aa22.84■■□□□ 1.25
Usp49-201ENSMUST00000024779 Ifnlr1Q8CGK5 535 aa22.83■■□□□ 1.25
Usp49-201ENSMUST00000024779 Abcc9P70170 1546 aa22.8■■□□□ 1.24
Usp49-201ENSMUST00000024779 Erich6D3Z6S9 713 aa22.79■■□□□ 1.24
Usp49-201ENSMUST00000024779 Pcgf6Q99NA9 353 aa22.79■■□□□ 1.24
Usp49-201ENSMUST00000024779 Hdac5Q9Z2V6 1113 aa22.77■■□□□ 1.23
Usp49-201ENSMUST00000024779 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
Usp49-201ENSMUST00000024779 Polr3glQ8R0C0 218 aa22.74■■□□□ 1.23
Usp49-201ENSMUST00000024779 DaxxO35613 739 aa22.73■■□□□ 1.23
Usp49-201ENSMUST00000024779 Zbtb4Q5F293 982 aa22.64■■□□□ 1.21
Usp49-201ENSMUST00000024779 Plppr3Q7TPB0 716 aa22.59■■□□□ 1.21
Usp49-201ENSMUST00000024779 Lmod2Q3UHZ5 550 aa22.59■■□□□ 1.21
Usp49-201ENSMUST00000024779 Prdm10Q3UTQ7 1184 aa22.58■■□□□ 1.2
Usp49-201ENSMUST00000024779 CatipB9EKE5 520 aa22.56■■□□□ 1.2
Usp49-201ENSMUST00000024779 Anp32aO35381 247 aa22.46■■□□□ 1.19
Usp49-201ENSMUST00000024779 ArxO35085 564 aa22.46■■□□□ 1.19
Usp49-201ENSMUST00000024779 Hsp90aa1P07901 733 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
Usp49-201ENSMUST00000024779 Mier1Q5UAK0 511 aa22.42■■□□□ 1.18
Usp49-201ENSMUST00000024779 Supt5hO55201 1082 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
Usp49-201ENSMUST00000024779 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa22.39■■□□□ 1.17
Usp49-201ENSMUST00000024779 Upf2A2AT37 1269 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
Usp49-201ENSMUST00000024779 ClspnQ80YR7 1315 aa22.33■■□□□ 1.16
Usp49-201ENSMUST00000024779 Rangap1P46061 589 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
Usp49-201ENSMUST00000024779 Fkbp15Q6P9Q6 1216 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
Usp49-201ENSMUST00000024779 Safb2Q80YR5 991 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
Usp49-201ENSMUST00000024779 Znf326O88291 580 aa22.13■■□□□ 1.13
Usp49-201ENSMUST00000024779 Csrnp3P59055 597 aa22.07■■□□□ 1.12
Usp49-201ENSMUST00000024779 Mapk8ip2Q9ERE9 830 aa22.06■■□□□ 1.12
Usp49-201ENSMUST00000024779 Fgd1P52734 960 aa22.05■■□□□ 1.12
Usp49-201ENSMUST00000024779 Lmod3E9QA62 571 aa22.02■■□□□ 1.12
Usp49-201ENSMUST00000024779 DekQ7TNV0 380 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
Usp49-201ENSMUST00000024779 Ythdc1E9Q5K9 736 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
Usp49-201ENSMUST00000024779 P3h3Q8CG70 732 aa21.95■■□□□ 1.1
Usp49-201ENSMUST00000024779 Ccer2J3QPU5 274 aa21.93■■□□□ 1.1
Usp49-201ENSMUST00000024779 Eid3Q3V124 375 aa21.91■■□□□ 1.1
Usp49-201ENSMUST00000024779 Rad21Q61550 635 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
Usp49-201ENSMUST00000024779 Clip1Q922J3 1391 aa21.89■■□□□ 1.1
Usp49-201ENSMUST00000024779 Clstn2Q9ER65 966 aa21.84■■□□□ 1.09
Usp49-201ENSMUST00000024779 Vsig10D3YX43 558 aa21.83■■□□□ 1.09
Usp49-201ENSMUST00000024779 Ppp4r2Q0VGB7 417 aa21.83■■□□□ 1.09
Usp49-201ENSMUST00000024779 Trim44Q9QXA7 346 aa21.83■■□□□ 1.08
Usp49-201ENSMUST00000024779 Calr4Q3TQS0 420 aa21.79■■□□□ 1.08
Usp49-201ENSMUST00000024779 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
Usp49-201ENSMUST00000024779 Ubl4bQ9CQ84 188 aa21.74■■□□□ 1.07
Usp49-201ENSMUST00000024779 Trim26Q99PN3 545 aa21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 58.7 ms