RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000407997.3

APOBEC3G-201, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3G, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOBEC3G, Length 1,834 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3G-201ENST00000407997 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 TRIM13O60858 407 aa9.77□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 ADAM23O75077 832 aa9.77□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 S1PR4O95977 384 aa9.77□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 MT-CO1P00395 513 aa9.77□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 BMP2P12643 396 aa9.77□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 BCKDHBP21953 392 aa9.77□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 ARNTP27540 789 aa9.77□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 ARRB2P32121 409 aa9.77□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 VIPR1P32241 457 aa9.77□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 MC4RP32245 332 aa9.77□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 RGS4P49798 205 aa9.77□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 NME5P56597 212 aa9.77□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 PRKAA1Q13131 559 aa9.77□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 OLIG2Q13516 323 aa9.77□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 PTK2BQ14289 1009 aa9.77□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 NDUFA5Q16718 116 aa9.77□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 SEL1L3Q68CR1 1132 aa9.77□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 C16orf87Q6PH81 154 aa9.77□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa9.77□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa9.77□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 CLEC14AQ86T13 490 aa9.77□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 C12orf40Q86WS4 652 aa9.77□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 CAMK1DQ8IU85 385 aa9.77□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa9.77□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 EFCAB3Q8N7B9 438 aa9.77□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 OR2A12Q8NGT7 310 aa9.77□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 RHEBL1Q8TAI7 183 aa9.77□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 TFAP2CQ92754 450 aa9.77□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 KCNJ9Q92806 393 aa9.77□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 TRMOQ9BU70 441 aa9.77□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 C1orf50Q9BV19 199 aa9.77□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa9.77□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 ZBTB26Q9HCK0 441 aa9.77□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 ERGIC3Q9Y282 383 aa9.77□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 ARL5AQ9Y689 179 aa9.77□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 ACACBO00763 2458 aa9.76□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa9.76□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 UPK3BL1B0FP48 263 aa9.76□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 UPK3BL2E5RIL1 263 aa9.76□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 H3BMQ9 156 aa9.76□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 K7EPI3 171 aa9.76□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 GIPC1O14908 333 aa9.76□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 STAMBPO95630 424 aa9.76□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 FUCA1P04066 466 aa9.76□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 ALOX5P09917 674 aa9.76□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 CBSLP0DN79 551 aa9.76□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 HOXB2P14652 356 aa9.76□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 ITGB7P26010 798 aa9.76□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 CBSP35520 551 aa9.76□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 NSG1P42857 185 aa9.76□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 CSRP3P50461 194 aa9.76□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 CTBP1Q13363 440 aa9.76□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 INAQ16352 499 aa9.76□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 MAP7D1Q3KQU3 841 aa9.76□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 TRIM61Q5EBN2 209 aa9.76□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa9.76□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 NHSL2Q5HYW2 709 aa9.76□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 DEPDC1Q5TB30 811 aa9.76□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa9.76□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 HECTD2Q5U5R9 776 aa9.76□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 IL23RQ5VWK5 629 aa9.76□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 TTC23LQ6PF05 361 aa9.76□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 SLC23A3Q6PIS1 610 aa9.76□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 HACD2Q6Y1H2 254 aa9.76□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 CHPFQ8IZ52 775 aa9.76□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 ZNF781Q8N8C0 355 aa9.76□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 NAT16Q8N8M0 369 aa9.76□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 FRS2Q8WU20 508 aa9.76□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 MRGPRX3Q96LB0 322 aa9.76□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 CCDC138Q96M89 665 aa9.76□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 COG8Q96MW5 612 aa9.76□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 OR52B2Q96RD2 323 aa9.76□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 PSD2Q9BQI7 771 aa9.76□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa9.76□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 CLPBQ9H078 707 aa9.76□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 CXorf21Q9HAI6 301 aa9.76□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 ARMC1Q9NVT9 282 aa9.76□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 SMOXQ9NWM0 555 aa9.76□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 TMEM216Q9P0N5 145 aa9.76□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 CDYLQ9Y232 598 aa9.76□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 PSAT1Q9Y617 370 aa9.76□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 E5RI56 91 aa9.75□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 AKAP10O43572 662 aa9.75□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 183.9 ms