RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635152.1

BRF1-222, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 2

Gene BRF1, Length 2,876 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-222	ENST00000635152	PDE10A	Q9Y233	779 aa		12.8	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	INVS	Q9Y283	1065 aa		12.8	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	DLGAP4	Q9Y2H0	992 aa		12.8	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	DOCK6	Q96HP0	2047 aa		12.8	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	SLC28A1	O00337	649 aa		12.8	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	TGM5	O43548	720 aa		12.8	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	CLDN9	O95484	217 aa		12.8	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	PDYN	P01213	254 aa		12.8	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	ALB	P02768	609 aa		12.8	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	EBLN1	P0CF75	366 aa		12.8	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	RAP2A	P10114	183 aa		12.8	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	MAPK8	P45983	427 aa		12.8	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	SNRPD1	P62314	119 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	ESRRG	P62508	458 aa		12.8	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	CYP4F3	Q08477	520 aa		12.8	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	NKG7	Q16617	165 aa		12.8	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	KCTD21	Q4G0X4	260 aa		12.8	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	DPY19L3	Q6ZPD9	716 aa		12.8	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	UBE2R2	Q712K3	238 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	PATL1	Q86TB9	770 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	VRK3	Q8IV63	474 aa		12.8	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	RIMKLA	Q8IXN7	391 aa		12.8	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	RNF175	Q8N4F7	328 aa		12.8	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	SELENOM	Q8WWX9	145 aa		12.8	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	SCRN2	Q96FV2	425 aa		12.8	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	MUS81	Q96NY9	551 aa		12.8	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	DCUN1D5	Q9BTE7	237 aa		12.8	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	ACPT	Q9BZG2	426 aa		12.8	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	RNF208	Q9H0X6	261 aa		12.8	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	PARVB	Q9HBI1	364 aa		12.8	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	SPG21	Q9NZD8	308 aa		12.8	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	CCL26	Q9Y258	94 aa		12.8	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	NUP214	P35658	2090 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	DEAF1	O75398	565 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	BMP10	O95393	424 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	BCKDHA	P12694	445 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	MSH3	P20585	1137 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	ELK4	P28324	431 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	CDK9	P50750	372 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	ARSF	P54793	590 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	FXN	Q16595	210 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	SERPINA13P	Q6UXR4	307 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	TPRG1	Q6ZUI0	275 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	ARHGAP22	Q7Z5H3	698 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	MSRB3	Q8IXL7	192 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	C10orf111	Q8N326	155 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	OR8J3	Q8NGG0	315 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	FIBIN	Q8TAL6	211 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	FAM162A	Q96A26	154 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	CORO1B	Q9BR76	489 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	NTMT1	Q9BV86	223 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	SUV39H2	Q9H5I1	410 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	C1orf109	Q9NX04	203 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	KCTD5	Q9NXV2	234 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	CIDEB	Q9UHD4	219 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	UPK3BL1	B0FP48	263 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	UPK3BL2	E5RIL1	263 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	UPK1A	O00322	258 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	AREL1	O15033	823 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	NOBOX	O60393	691 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	LRG1	P02750	347 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	EPOR	P19235	508 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	ITPKA	P23677	461 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	EEF1B2	P24534	225 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	TACR1	P25103	407 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	CTBS	Q01459	385 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	MAD2L1	Q13257	205 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	NEDD8	Q15843	81 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	LYPLAL1	Q5VWZ2	237 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	ANKRD34A	Q69YU3	496 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152		Q6ZVU0	165 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	USP45	Q70EL2	814 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	VOPP1	Q96AW1	172 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	VWCE	Q96DN2	955 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	ATG10	Q9H0Y0	220 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	ELOVL6	Q9H5J4	265 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	SMURF2	Q9HAU4	748 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	PRM3	Q9NNZ6	103 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	HPS4	Q9NQG7	708 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	ZDHHC3	Q9NYG2	299 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	PCDHGA11	Q9Y5H2	935 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	TMX2-CTNND1	H3BSU7	103 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	LEFTY2	O00292	366 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	GNGT2	O14610	69 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	PRKD3	O94806	890 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	WDR47	O94967	919 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	CST1	P01037	141 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	PHC1	P78364	1004 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	PMS2P3	Q13401	168 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	PGS1	Q32NB8	556 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM259	Q4ZIN3	620 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	HTR3D	Q70Z44	454 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	TRIM46	Q7Z4K8	759 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	FAM217A	Q8IXS0	508 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	BEND7	Q8N7W2	519 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	CHST14	Q8NCH0	376 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF548	Q8NEK5	533 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	SCAMP4	Q969E2	229 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	EGLN2	Q96KS0	407 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	HERC2P3	Q9BVR0	1158 aa		12.79	□□□□□ -0.36

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