RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618610.1

PTPRT-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 3,230 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-211ENST00000618610 SH3RF2Q8TEC5 729 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 COQ8BQ96D53 544 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 COPS4Q9BT78 406 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 WASH6PQ9NQA3 447 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 HCSTQ9UBK5 93 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF112Q9UJU3 913 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 A0A0B4J293 547 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 MAGEB16A2A368 324 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 HMX3A6NHT5 357 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 M0QYT0 321 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 PDPK1O15530 556 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 CELF2O95319 508 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 MLYCDO95822 493 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 ADORA3P0DMS8 318 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 MLNP12872 115 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 SSTR4P31391 388 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 SLC26A3P40879 764 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 NR2C2P49116 596 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 NUDT6P53370 316 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 TTLL4Q14679 1199 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 ACOX1Q15067 660 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 CCL15Q16663 113 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 CLVS2Q5SYC1 327 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF691Q5VV52 312 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 TMEM65Q6PI78 240 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 HACD2Q6Y1H2 254 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 C16orf62Q7Z3J2 963 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 CAMKK1Q8N5S9 505 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 SLAIN1Q8ND83 568 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 ZMIZ2Q8NF64 920 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 HERVK_113Q902F9 699 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 RNF31Q96EP0 1072 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 MID1IP1Q9NPA3 183 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 TAS2R16Q9NYV7 291 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 RNF6Q9Y252 685 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 A0A1W2PQ09 198 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 MYADML2A6NDP7 307 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 BTN3A3O00478 584 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 CCL22O00626 93 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 NPHS1O60500 1241 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 CNMDO75829 334 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 C22orf31O95567 290 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 GRIK1P39086 918 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 ADIGQ0VDE8 80 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 GTF2H3Q13889 308 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 DPYSL2Q16555 572 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 SPDYE7PQ495Y7 208 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 AGAP9Q5VTM2 703 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 AMER2Q8N7J2 671 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 RNF139Q8WU17 664 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 SLC35F5Q8WV83 523 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 EDEM1Q92611 657 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 MED10Q9BTT4 135 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 RHOJQ9H4E5 214 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 RERGLQ9H628 205 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 LRRC4Q9HBW1 653 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 REV1Q9UBZ9 1251 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 ARID2Q68CP9 1835 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 WDR81Q562E7 1941 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 FADS2P1A8MWK0 482 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 MYO1GB0I1T2 1018 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 IPO13O94829 963 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 MYL3P08590 195 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 NUDT1P36639 197 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 SMSP52788 366 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 SH3BP2P78314 561 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 NKX3-2P78367 333 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 SLC35A2P78381 396 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 SMARCB1Q12824 385 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 AGMOQ6ZNB7 445 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 CFAP77Q6ZQR2 320 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 ANKS3Q6ZW76 656 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 OTOP2Q7RTS6 562 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 TMEM135Q86UB9 458 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 CYP4Z1Q86W10 505 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 CLYBLQ8N0X4 340 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 ANKRD49Q8WVL7 239 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP8.03□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 CDCP1Q9H5V8 836 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 SCN3BQ9NY72 215 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 CFL2Q9Y281 166 aa8.03□□□□□ -1.12
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