RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367364.5

PTPRC-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 1,017 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-202ENST00000367364 CATSPER2Q96P56 530 aa3.54□□□□□ -1.84
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PTPRC-202ENST00000367364 HGH1Q9BTY7 390 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-202ENST00000367364 TXLNGYQ9BZA5 131 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-202ENST00000367364 KRT23Q9C075 422 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-202ENST00000367364 CARD9Q9H257 536 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-202ENST00000367364 DPH5Q9H2P9 285 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-202ENST00000367364 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
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PTPRC-202ENST00000367364 C3P01024 1663 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-202ENST00000367364 NFAT5O94916 1531 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-202ENST00000367364 CPS1P31327 1500 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-202ENST00000367364 TANC1Q9C0D5 1861 aa3.54□□□□□ -1.84
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PTPRC-202ENST00000367364 DCXO43602 365 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-202ENST00000367364 SNX3O60493 162 aa3.53□□□□□ -1.84
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PTPRC-202ENST00000367364 ACTL6BO94805 426 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-202ENST00000367364 LCA5LO95447 670 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-202ENST00000367364 PARNO95453 639 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
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PTPRC-202ENST00000367364 MYL3P08590 195 aa3.53□□□□□ -1.84
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PTPRC-202ENST00000367364 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
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PTPRC-202ENST00000367364 MORC3Q14149 939 aa3.53□□□□□ -1.84
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PTPRC-202ENST00000367364 SPARCL1Q14515 664 aa3.53□□□□□ -1.84
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PTPRC-202ENST00000367364 CTF1Q16619 201 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-202ENST00000367364 LIN52Q52LA3 116 aa3.53□□□□□ -1.84
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PTPRC-202ENST00000367364 SEPT14Q6ZU15 432 aa3.53□□□□□ -1.84
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PTPRC-202ENST00000367364 TBC1D16Q8TBP0 767 aa3.53□□□□□ -1.84
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PTPRC-202ENST00000367364 TMEM109Q9BVC6 243 aa3.53□□□□□ -1.84
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PTPRC-202ENST00000367364 RAB17Q9H0T7 212 aa3.53□□□□□ -1.84
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PTPRC-202ENST00000367364 C2orf42Q9NWW7 574 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-202ENST00000367364 PTTG2Q9NZH5 202 aa3.53□□□□□ -1.84
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PTPRC-202ENST00000367364 A0A1W2PP64 1363 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 NWD1Q149M9 1564 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 E9PBE3 544 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 E9PQ18 207 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 CYTH3O43739 400 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 JAK2O60674 1132 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 TACC1O75410 805 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 IGHV4-39P01824 125 aa3.52□□□□□ -1.85
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