RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549143.5

CS-215, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 2,811 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-215ENST00000549143 GTF2H3Q13889 308 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP8.24□□□□□ -1.091e-8■■□□□ 14.4
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CS-215ENST00000549143 FAM91A1Q658Y4 838 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 FNDC5Q8NAU1 212 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 LRCH3Q96II8 777 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 SLC12A9Q9BXP2 914 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 HDAC8Q9BY41 377 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 IL1RL2Q9HB29 575 aa8.24□□□□□ -1.09
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CS-215ENST00000549143 SH3BGRLO75368 114 aa8.23□□□□□ -1.09
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CS-215ENST00000549143 CYP2A7P20853 494 aa8.23□□□□□ -1.09
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CS-215ENST00000549143 C1orf146Q5VVC0 180 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 ZNF547Q8IVP9 402 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 SCUBE1Q8IWY4 988 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 ULK2Q8IYT8 1036 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 OR2T11Q8NH01 316 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 ACTRT2Q8TDY3 377 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 VPS35Q96QK1 796 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 ZNF382Q96SR6 550 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 TRIM39Q9HCM9 518 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 EPS15L1Q9UBC2 864 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 ARHGEF33A8MVX0 844 aa8.23□□□□□ -1.09
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CS-215ENST00000549143 AP2A2O94973 939 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 SLC16A8O95907 504 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 C8GP07360 202 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 CASP2P42575 452 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 INHBCP55103 352 aa8.23□□□□□ -1.09
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CS-215ENST00000549143 NAE1Q13564 534 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 NR6A1Q15406 480 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 CCDC6Q16204 474 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 DNAL1Q4LDG9 190 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
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CS-215ENST00000549143 NUDT8Q8WV74 236 aa8.23□□□□□ -1.09
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CS-215ENST00000549143 SIPA1Q96FS4 1042 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 HIC2Q96JB3 615 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
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CS-215ENST00000549143 LMCD1Q9NZU5 365 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 SLC7A8Q9UHI5 535 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 DOCK9Q9BZ29 2069 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 VPS13AQ96RL7 3174 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 A0A1W2PQF6 199 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 A0A1W2PQU0 124 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 ANHXE9PGG2 379 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 NR5A2O00482 541 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 LBPP18428 481 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 ITGAXP20702 1163 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 HALP42357 657 aa8.22□□□□□ -1.09
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CS-215ENST00000549143 FOPNLQ96NB1 174 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 NRTNQ99748 197 aa8.22□□□□□ -1.09
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