RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000378910.9

NPHS1-202, Transcript of NPHS1, nephrin, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NPHS1, Length 4,276 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHS1-202ENST00000378910 PWP1Q13610 501 aa11.63□□□□□ -0.55
NPHS1-202ENST00000378910 CRY2Q49AN0 593 aa11.63□□□□□ -0.55
NPHS1-202ENST00000378910 C10orf120Q5SQS8 335 aa11.63□□□□□ -0.55
NPHS1-202ENST00000378910 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa11.63□□□□□ -0.55
NPHS1-202ENST00000378910 TEX19Q8NA77 164 aa11.63□□□□□ -0.55
NPHS1-202ENST00000378910 OR2T12Q8NG77 320 aa11.63□□□□□ -0.55
NPHS1-202ENST00000378910 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
NPHS1-202ENST00000378910 GHITMQ9H3K2 345 aa11.63□□□□□ -0.55
NPHS1-202ENST00000378910 MUC13Q9H3R2 512 aa11.63□□□□□ -0.55
NPHS1-202ENST00000378910 ZBTB26Q9HCK0 441 aa11.63□□□□□ -0.55
NPHS1-202ENST00000378910 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
NPHS1-202ENST00000378910 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa11.63□□□□□ -0.55
NPHS1-202ENST00000378910 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
NPHS1-202ENST00000378910 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa11.63□□□□□ -0.55
NPHS1-202ENST00000378910 MED16Q9Y2X0 877 aa11.63□□□□□ -0.55
NPHS1-202ENST00000378910 DHX15O43143 795 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
NPHS1-202ENST00000378910 ANGPTL1O95841 491 aa11.63□□□□□ -0.55
NPHS1-202ENST00000378910 IL1BP01584 269 aa11.63□□□□□ -0.55
NPHS1-202ENST00000378910 RPS17P08708 135 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
NPHS1-202ENST00000378910 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
NPHS1-202ENST00000378910 ARL2P36404 184 aa11.63□□□□□ -0.55
NPHS1-202ENST00000378910 LHX1P48742 406 aa11.63□□□□□ -0.55
NPHS1-202ENST00000378910 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
NPHS1-202ENST00000378910 DGKZQ13574 1117 aa11.63□□□□□ -0.55
NPHS1-202ENST00000378910 C1DQ13901 141 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
NPHS1-202ENST00000378910 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
NPHS1-202ENST00000378910 SLC51AQ86UW1 340 aa11.63□□□□□ -0.55
NPHS1-202ENST00000378910 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
NPHS1-202ENST00000378910 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
NPHS1-202ENST00000378910 UBQLN2Q9UHD9 624 aa11.63□□□□□ -0.55
NPHS1-202ENST00000378910 ZNF112Q9UJU3 913 aa11.63□□□□□ -0.55
NPHS1-202ENST00000378910 COPS3Q9UNS2 423 aa11.63□□□□□ -0.55
NPHS1-202ENST00000378910 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
NPHS1-202ENST00000378910 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa11.63□□□□□ -0.55
NPHS1-202ENST00000378910 H3BRB1 525 aa11.63□□□□□ -0.55
NPHS1-202ENST00000378910 TXNL1O43396 289 aa11.63□□□□□ -0.55
NPHS1-202ENST00000378910 RECQL4O94761 1208 aa11.63□□□□□ -0.55
NPHS1-202ENST00000378910 CLIC3O95833 236 aa11.63□□□□□ -0.55
NPHS1-202ENST00000378910 FADS2O95864 444 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
NPHS1-202ENST00000378910 FTH1P02794 183 aa11.63□□□□□ -0.55
NPHS1-202ENST00000378910 HNMTP50135 292 aa11.63□□□□□ -0.55
NPHS1-202ENST00000378910 SNAPC2Q13487 334 aa11.63□□□□□ -0.55
NPHS1-202ENST00000378910 CEACAM7Q14002 265 aa11.63□□□□□ -0.55
NPHS1-202ENST00000378910 CAMK1Q14012 370 aa11.63□□□□□ -0.55
NPHS1-202ENST00000378910 TCEAL6Q6IPX3 200 aa11.63□□□□□ -0.55
NPHS1-202ENST00000378910 KBTBD6Q86V97 674 aa11.63□□□□□ -0.55
NPHS1-202ENST00000378910 HID1Q8IV36 788 aa11.63□□□□□ -0.55
NPHS1-202ENST00000378910 TWIST2Q8WVJ9 160 aa11.63□□□□□ -0.55
NPHS1-202ENST00000378910 HES2Q9Y543 173 aa11.63□□□□□ -0.55
NPHS1-202ENST00000378910 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa11.63□□□□□ -0.55
NPHS1-202ENST00000378910 ACTL7AQ9Y615 435 aa11.63□□□□□ -0.55
NPHS1-202ENST00000378910 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa11.62□□□□□ -0.55
NPHS1-202ENST00000378910 MLYCDO95822 493 aa11.62□□□□□ -0.55
NPHS1-202ENST00000378910 GCAP28676 217 aa11.62□□□□□ -0.55
NPHS1-202ENST00000378910 RORAP35398 523 aa11.62□□□□□ -0.55
NPHS1-202ENST00000378910 SOAT1P35610 550 aa11.62□□□□□ -0.55
NPHS1-202ENST00000378910 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
NPHS1-202ENST00000378910 RAB2AP61019 212 aa11.62□□□□□ -0.55
NPHS1-202ENST00000378910 RPS7P62081 194 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
NPHS1-202ENST00000378910 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP11.62□□□□□ -0.55
NPHS1-202ENST00000378910 RPA4Q13156 261 aa11.62□□□□□ -0.55
NPHS1-202ENST00000378910 ARHGEF7Q14155 803 aa11.62□□□□□ -0.55
NPHS1-202ENST00000378910 NCF4Q15080 339 aa11.62□□□□□ -0.55
NPHS1-202ENST00000378910 DUSP7Q16829 419 aa11.62□□□□□ -0.55
NPHS1-202ENST00000378910 NOMO2Q5JPE7 1267 aa11.62□□□□□ -0.55
NPHS1-202ENST00000378910 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
NPHS1-202ENST00000378910 AKR7LQ8NHP1 331 aa11.62□□□□□ -0.55
NPHS1-202ENST00000378910 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
NPHS1-202ENST00000378910 TOP1MTQ969P6 601 aa11.62□□□□□ -0.55
NPHS1-202ENST00000378910 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
NPHS1-202ENST00000378910 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
NPHS1-202ENST00000378910 SPASTQ9UBP0 616 aa11.62□□□□□ -0.55
NPHS1-202ENST00000378910 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
NPHS1-202ENST00000378910 MAB21L2Q9Y586 359 aa11.62□□□□□ -0.55
NPHS1-202ENST00000378910 C4AP0C0L4 1744 aa11.62□□□□□ -0.55
NPHS1-202ENST00000378910 C4BP0C0L5 1744 aa11.62□□□□□ -0.55
NPHS1-202ENST00000378910 MYH11P35749 1972 aa11.62□□□□□ -0.55
NPHS1-202ENST00000378910 NIPSNAP2O75323 286 aa11.62□□□□□ -0.55
NPHS1-202ENST00000378910 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
NPHS1-202ENST00000378910 RASGRP1O95267 797 aa11.62□□□□□ -0.55
NPHS1-202ENST00000378910 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa11.62□□□□□ -0.55
NPHS1-202ENST00000378910 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
NPHS1-202ENST00000378910 GLDCP23378 1020 aa11.62□□□□□ -0.55
NPHS1-202ENST00000378910 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
NPHS1-202ENST00000378910 CD86P42081 329 aa11.62□□□□□ -0.55
NPHS1-202ENST00000378910 ASPAP45381 313 aa11.62□□□□□ -0.55
NPHS1-202ENST00000378910 WNT3AP56704 352 aa11.62□□□□□ -0.55
NPHS1-202ENST00000378910 RAB5BP61020 215 aa11.62□□□□□ -0.55
NPHS1-202ENST00000378910 DSC1Q08554 894 aa11.62□□□□□ -0.55
NPHS1-202ENST00000378910 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP11.62□□□□□ -0.55
NPHS1-202ENST00000378910 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP11.62□□□□□ -0.55
NPHS1-202ENST00000378910 PMS2P3Q13401 168 aa11.62□□□□□ -0.55
NPHS1-202ENST00000378910 SNTA1Q13424 505 aa11.62□□□□□ -0.55
NPHS1-202ENST00000378910 STARD3Q14849 445 aa11.62□□□□□ -0.55
NPHS1-202ENST00000378910 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
NPHS1-202ENST00000378910 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa11.62□□□□□ -0.55
NPHS1-202ENST00000378910 OR5J2Q8NH18 312 aa11.62□□□□□ -0.55
NPHS1-202ENST00000378910 PTERQ96BW5 349 aa11.62□□□□□ -0.55
NPHS1-202ENST00000378910 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
NPHS1-202ENST00000378910 ENTPD4Q9Y227 616 aa11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.8 ms