RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000046206.3

Rprd1a-201, Transcript of Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Rprd1a, Length 4,297 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Fastkd5Q7TMV3 762 aa15.16■□□□□ 0.02
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Lrch3Q8BVU0 778 aa15.16■□□□□ 0.02
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Ston1Q8CDJ8 730 aa15.16■□□□□ 0.02
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 GaleQ8R059 347 aa15.16■□□□□ 0.02
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Ppp1r14cQ8R4S0 164 aa15.16■□□□□ 0.02
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Nsmce2Q91VT1 247 aa15.16■□□□□ 0.02
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Acbd7Q9D258 88 aa15.16■□□□□ 0.02
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Fndc8Q9D2H8 321 aa15.16■□□□□ 0.02
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 1700080O16RikQ9D9G4 284 aa15.16■□□□□ 0.02
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Rnf11Q9QYK7 154 aa15.16■□□□□ 0.02
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 NfkbiaQ9Z1E3 314 aa15.16■□□□□ 0.02
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Gm7792A0A0J9YU01 481 aa15.16■□□□□ 0.02
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Skint11A7XV14 364 aa15.16■□□□□ 0.02
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Gm3183D3YUJ6 481 aa15.16■□□□□ 0.02
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Vmn2r38G3UYA8 861 aa15.16■□□□□ 0.02
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Gm3139J3QK78 481 aa15.16■□□□□ 0.02
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Gm3106J3QPH3 481 aa15.16■□□□□ 0.02
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Vmn2r33K7N705 861 aa15.16■□□□□ 0.02
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 NagluO88325 739 aa15.16■□□□□ 0.02
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Zfp14P10755 501 aa15.16■□□□□ 0.02
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Hsd11b2P51661 386 aa15.16■□□□□ 0.02
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 DbtP53395 482 aa15.16■□□□□ 0.02
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Nudt2P56380 147 aa15.16■□□□□ 0.02
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Hpcal1P62748 193 aa15.16■□□□□ 0.02
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Cxcr5Q04683 374 aa15.16■□□□□ 0.02
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Tmem202Q80W35 275 aa15.16■□□□□ 0.02
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Cnpy4Q8BQ47 245 aa15.16■□□□□ 0.02
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Ptgr1Q91YR9 329 aa15.16■□□□□ 0.02
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Msh4Q99MT2 958 aa15.16■□□□□ 0.02
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Use1Q9CQ56 270 aa15.16■□□□□ 0.02
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Ephx1Q9D379 455 aa15.16■□□□□ 0.02
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Vmn2r2L7N2E9 908 aa15.16■□□□□ 0.02
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Fzd1O70421 642 aa15.16■□□□□ 0.02
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Resp18P47939 175 aa15.16■□□□□ 0.02
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Hoxd13P70217 339 aa15.16■□□□□ 0.02
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Ap2m1P84091 435 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Clca4bQ3UW98 925 aa15.16■□□□□ 0.02
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Inppl1Q6P549 1257 aa15.16■□□□□ 0.02
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Myl12aQ6ZWQ9 172 aa15.16■□□□□ 0.02
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Hfe2Q7TQ32 420 aa15.16■□□□□ 0.02
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Klhl26Q8BGY4 606 aa15.16■□□□□ 0.02
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Vmn1r205Q8R276 316 aa15.16■□□□□ 0.02
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Olfr1208Q8VG47 308 aa15.16■□□□□ 0.02
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Asf1aQ9CQE6 204 aa15.16■□□□□ 0.02
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Fbxl20Q9CZV8 436 aa15.16■□□□□ 0.02
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Fgf22Q9ESS2 162 aa15.16■□□□□ 0.02
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Abhd1Q9QZC8 412 aa15.16■□□□□ 0.02
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Mia3Q8BI84 1930 aa15.16■□□□□ 0.02
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 BC049352E9Q2Z6 85 aa15.15■□□□□ 0.02
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 NumblO08919 604 aa15.15■□□□□ 0.02
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 TpmtO55060 240 aa15.15■□□□□ 0.02
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Slc7a2P18581 657 aa15.15■□□□□ 0.02
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Gdf5P43027 495 aa15.15■□□□□ 0.02
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Mthfd1lQ3V3R1 977 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 FaddQ61160 205 aa15.15■□□□□ 0.02
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Mterf1aQ8CHZ9 379 aa15.15■□□□□ 0.02
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 KptnQ8VCX6 430 aa15.15■□□□□ 0.02
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Chil4Q91Z98 402 aa15.15■□□□□ 0.02
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Bbs2Q9CWF6 721 aa15.15■□□□□ 0.02
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Q9CXL3 195 aa15.15■□□□□ 0.02
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Prorsd1Q9D820 169 aa15.15■□□□□ 0.02
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Abcb9Q9JJ59 762 aa15.15■□□□□ 0.02
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Noa1Q9JJG9 693 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Adam24Q9R160 761 aa15.15■□□□□ 0.02
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 FarsbQ9WUA2 589 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Gm11239E9Q5Z9 360 aa15.15■□□□□ 0.02
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Pate1E9Q658 125 aa15.15■□□□□ 0.02
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Gm10639E9Q6L7 222 aa15.15■□□□□ 0.02
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Vmn2r22E9Q7S8 853 aa15.15■□□□□ 0.02
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Gm11237F2Z3W5 360 aa15.15■□□□□ 0.02
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Gm11238F2Z478 360 aa15.15■□□□□ 0.02
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Gm3383J3QQ59 259 aa15.15■□□□□ 0.02
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Gm3239L7N2D9 227 aa15.15■□□□□ 0.02
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Gsta2P10648 222 aa15.15■□□□□ 0.02
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 PlaaP27612 794 aa15.15■□□□□ 0.02
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Gm428Q3UTE2 360 aa15.15■□□□□ 0.02
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Gm11487Q5RIS0 354 aa15.15■□□□□ 0.02
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Shkbp1Q6P7W2 704 aa15.15■□□□□ 0.02
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Ppp2r1bQ7TNP2 601 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Rnf144aQ925F3 292 aa15.15■□□□□ 0.02
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Gkn2Q9CQS6 184 aa15.15■□□□□ 0.02
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 TesclQ9DAJ7 231 aa15.15■□□□□ 0.02
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Slc19a2Q9EQN9 498 aa15.15■□□□□ 0.02
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Cldn7Q9Z261 211 aa15.15■□□□□ 0.02
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Cldn2O88552 230 aa15.15■□□□□ 0.02
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Neurog1P70660 244 aa15.15■□□□□ 0.02
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Znrf3Q5SSZ7 913 aa15.15■□□□□ 0.02
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Itga2Q62469 1178 aa15.15■□□□□ 0.02
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Cntn4Q69Z26 1026 aa15.15■□□□□ 0.02
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Olfr1037Q7TR84 321 aa15.15■□□□□ 0.02
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Ccdc59Q8R2N0 240 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Pdia5Q921X9 517 aa15.15■□□□□ 0.02
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Snx7Q9CY18 387 aa15.15■□□□□ 0.02
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 MispQ9D279 648 aa15.15■□□□□ 0.02
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Uba7Q9DBK7 977 aa15.15■□□□□ 0.02
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Ap3m1Q9JKC8 418 aa15.15■□□□□ 0.02
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Galk1Q9R0N0 392 aa15.15■□□□□ 0.02
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Cacna1fQ9JIS7 1985 aa15.15■□□□□ 0.02
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Kif28pD3YXS5 1028 aa15.14■□□□□ 0.02
Rprd1a-201ENSMUST00000046206 Slc28a1E9PXX9 648 aa15.14■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 41.9 ms