Protein–RNA interactions for Protein: P70660

Neurog1, Neurogenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurog1P70660 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC39.03■■■■□ 3.84
Neurog1P70660 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Neurog1P70660 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Neurog1P70660 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Neurog1P70660 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
Neurog1P70660 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Neurog1P70660 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
Neurog1P70660 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
Neurog1P70660 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Neurog1P70660 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Neurog1P70660 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Neurog1P70660 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Neurog1P70660 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
Neurog1P70660 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Neurog1P70660 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Neurog1P70660 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
Neurog1P70660 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Neurog1P70660 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Neurog1P70660 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
Neurog1P70660 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Neurog1P70660 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Neurog1P70660 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Neurog1P70660 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Neurog1P70660 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Neurog1P70660 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Neurog1P70660 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Neurog1P70660 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
Neurog1P70660 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
Neurog1P70660 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Neurog1P70660 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Neurog1P70660 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Neurog1P70660 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Neurog1P70660 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Neurog1P70660 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Neurog1P70660 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Neurog1P70660 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Neurog1P70660 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Neurog1P70660 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
Neurog1P70660 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Neurog1P70660 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Neurog1P70660 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Neurog1P70660 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Neurog1P70660 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Neurog1P70660 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Neurog1P70660 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Neurog1P70660 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Neurog1P70660 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Neurog1P70660 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Neurog1P70660 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Neurog1P70660 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Neurog1P70660 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Neurog1P70660 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
Neurog1P70660 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Neurog1P70660 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Neurog1P70660 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Neurog1P70660 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Neurog1P70660 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Neurog1P70660 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Neurog1P70660 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Neurog1P70660 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Neurog1P70660 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Neurog1P70660 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Neurog1P70660 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Neurog1P70660 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Neurog1P70660 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Neurog1P70660 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Neurog1P70660 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Neurog1P70660 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Neurog1P70660 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Neurog1P70660 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Neurog1P70660 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Neurog1P70660 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Neurog1P70660 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Neurog1P70660 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Neurog1P70660 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Neurog1P70660 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Neurog1P70660 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Neurog1P70660 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Neurog1P70660 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Neurog1P70660 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Neurog1P70660 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Neurog1P70660 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Neurog1P70660 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Neurog1P70660 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Neurog1P70660 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Neurog1P70660 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Neurog1P70660 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Neurog1P70660 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Neurog1P70660 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Neurog1P70660 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Neurog1P70660 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Neurog1P70660 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Neurog1P70660 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Neurog1P70660 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Neurog1P70660 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Neurog1P70660 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Neurog1P70660 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Neurog1P70660 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Neurog1P70660 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Neurog1P70660 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms