Protein–RNA interactions for Protein: P27612

Plaa, Phospholipase A-2-activating protein, mousemouse

Predictions only

Length 794 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PlaaP27612 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC38,08■■■■□ 3,69
PlaaP27612 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC35,48■■■■□ 3,27
PlaaP27612 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,89■■■■□ 3,18
PlaaP27612 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC33,3■■■□□ 2,92
PlaaP27612 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32,75■■■□□ 2,83
PlaaP27612 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,16■■■□□ 2,74
PlaaP27612 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32,16■■■□□ 2,74
PlaaP27612 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,98■■■□□ 2,71
PlaaP27612 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31,91■■■□□ 2,7
PlaaP27612 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,8■■■□□ 2,68
PlaaP27612 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31,71■■■□□ 2,67
PlaaP27612 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,56■■■□□ 2,64
PlaaP27612 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC31,24■■■□□ 2,59
PlaaP27612 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30,96■■■□□ 2,55
PlaaP27612 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,9■■■□□ 2,54
PlaaP27612 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30,89■■■□□ 2,54
PlaaP27612 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,81■■■□□ 2,52
PlaaP27612 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,81■■■□□ 2,52
PlaaP27612 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,58■■■□□ 2,49
PlaaP27612 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,36■■■□□ 2,45
PlaaP27612 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30,32■■■□□ 2,44
PlaaP27612 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,32■■■□□ 2,44
PlaaP27612 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,28■■■□□ 2,44
PlaaP27612 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC30,26■■■□□ 2,43
PlaaP27612 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC30,22■■■□□ 2,43
PlaaP27612 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,21■■■□□ 2,43
PlaaP27612 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,2■■■□□ 2,43
PlaaP27612 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29,93■■■□□ 2,38
PlaaP27612 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29,56■■■□□ 2,32
PlaaP27612 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC29,54■■■□□ 2,32
PlaaP27612 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,53■■■□□ 2,32
PlaaP27612 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,34■■■□□ 2,29
PlaaP27612 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,28■■■□□ 2,28
PlaaP27612 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC29,22■■■□□ 2,27
PlaaP27612 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,14■■■□□ 2,26
PlaaP27612 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC29,13■■■□□ 2,25
PlaaP27612 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29,11■■■□□ 2,25
PlaaP27612 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29,03■■■□□ 2,24
PlaaP27612 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,22
PlaaP27612 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
PlaaP27612 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,86■■■□□ 2,21
PlaaP27612 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,85■■■□□ 2,21
PlaaP27612 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28,82■■■□□ 2,2
PlaaP27612 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28,78■■■□□ 2,2
PlaaP27612 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28,78■■■□□ 2,2
PlaaP27612 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28,78■■■□□ 2,2
PlaaP27612 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28,72■■■□□ 2,19
PlaaP27612 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,67■■■□□ 2,18
PlaaP27612 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
PlaaP27612 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28,58■■■□□ 2,16
PlaaP27612 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28,57■■■□□ 2,16
PlaaP27612 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC28,51■■■□□ 2,15
PlaaP27612 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
PlaaP27612 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28,48■■■□□ 2,15
PlaaP27612 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
PlaaP27612 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,45■■■□□ 2,15
PlaaP27612 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
PlaaP27612 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28,42■■■□□ 2,14
PlaaP27612 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28,42■■■□□ 2,14
PlaaP27612 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,14
PlaaP27612 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
PlaaP27612 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
PlaaP27612 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28,27■■■□□ 2,12
PlaaP27612 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
PlaaP27612 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
PlaaP27612 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
PlaaP27612 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
PlaaP27612 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
PlaaP27612 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,09
PlaaP27612 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28,07■■■□□ 2,08
PlaaP27612 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2,07
PlaaP27612 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2,07
PlaaP27612 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27,93■■■□□ 2,06
PlaaP27612 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
PlaaP27612 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,9■■■□□ 2,06
PlaaP27612 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,84■■■□□ 2,05
PlaaP27612 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27,83■■■□□ 2,05
PlaaP27612 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27,82■■■□□ 2,04
PlaaP27612 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27,81■■■□□ 2,04
PlaaP27612 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27,71■■■□□ 2,03
PlaaP27612 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,68■■■□□ 2,02
PlaaP27612 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
PlaaP27612 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27,64■■■□□ 2,02
PlaaP27612 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,63■■■□□ 2,01
PlaaP27612 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,59■■■□□ 2,01
PlaaP27612 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
PlaaP27612 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27,54■■■□□ 2
PlaaP27612 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,54■■■□□ 2
PlaaP27612 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27,52■■■□□ 2
PlaaP27612 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27,5■■□□□ 1,99
PlaaP27612 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,48■■□□□ 1,99
PlaaP27612 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,47■■□□□ 1,99
PlaaP27612 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,47■■□□□ 1,99
PlaaP27612 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,41■■□□□ 1,98
PlaaP27612 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,41■■□□□ 1,98
PlaaP27612 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27,39■■□□□ 1,98
PlaaP27612 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,3■■□□□ 1,96
PlaaP27612 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27,26■■□□□ 1,96
PlaaP27612 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27,25■■□□□ 1,95
PlaaP27612 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27,22■■□□□ 1,95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50,9 ms