Protein–RNA interactions for Protein: P27612

Plaa, Phospholipase A-2-activating protein, mousemouse

Predictions only

Length 794 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PlaaP27612 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC38.08■■■■□ 3.69
PlaaP27612 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
PlaaP27612 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
PlaaP27612 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
PlaaP27612 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
PlaaP27612 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PlaaP27612 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PlaaP27612 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
PlaaP27612 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
PlaaP27612 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
PlaaP27612 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
PlaaP27612 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PlaaP27612 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
PlaaP27612 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
PlaaP27612 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PlaaP27612 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
PlaaP27612 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PlaaP27612 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PlaaP27612 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PlaaP27612 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PlaaP27612 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PlaaP27612 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PlaaP27612 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PlaaP27612 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
PlaaP27612 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
PlaaP27612 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PlaaP27612 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
PlaaP27612 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
PlaaP27612 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PlaaP27612 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PlaaP27612 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PlaaP27612 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PlaaP27612 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PlaaP27612 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
PlaaP27612 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PlaaP27612 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PlaaP27612 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PlaaP27612 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
PlaaP27612 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PlaaP27612 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PlaaP27612 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PlaaP27612 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PlaaP27612 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PlaaP27612 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
PlaaP27612 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PlaaP27612 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PlaaP27612 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
PlaaP27612 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PlaaP27612 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PlaaP27612 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.58■■■□□ 2.16
PlaaP27612 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
PlaaP27612 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
PlaaP27612 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PlaaP27612 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PlaaP27612 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PlaaP27612 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PlaaP27612 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PlaaP27612 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PlaaP27612 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PlaaP27612 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PlaaP27612 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PlaaP27612 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PlaaP27612 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PlaaP27612 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PlaaP27612 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PlaaP27612 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PlaaP27612 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PlaaP27612 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PlaaP27612 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PlaaP27612 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PlaaP27612 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
PlaaP27612 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PlaaP27612 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PlaaP27612 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PlaaP27612 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PlaaP27612 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PlaaP27612 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PlaaP27612 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PlaaP27612 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PlaaP27612 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PlaaP27612 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PlaaP27612 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PlaaP27612 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PlaaP27612 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PlaaP27612 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PlaaP27612 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PlaaP27612 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PlaaP27612 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PlaaP27612 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PlaaP27612 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PlaaP27612 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PlaaP27612 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PlaaP27612 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PlaaP27612 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PlaaP27612 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PlaaP27612 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
PlaaP27612 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PlaaP27612 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
PlaaP27612 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PlaaP27612 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.6 ms