Protein–RNA interactions for Protein: Q62469

Itga2, Integrin alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga2Q62469 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
Itga2Q62469 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Itga2Q62469 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Itga2Q62469 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Itga2Q62469 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Itga2Q62469 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Itga2Q62469 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
Itga2Q62469 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
Itga2Q62469 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Itga2Q62469 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Itga2Q62469 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Itga2Q62469 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
Itga2Q62469 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Itga2Q62469 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Itga2Q62469 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Itga2Q62469 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Itga2Q62469 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Itga2Q62469 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Itga2Q62469 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Itga2Q62469 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Itga2Q62469 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Itga2Q62469 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Itga2Q62469 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Itga2Q62469 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Itga2Q62469 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Itga2Q62469 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Itga2Q62469 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Itga2Q62469 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Itga2Q62469 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Itga2Q62469 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Itga2Q62469 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Itga2Q62469 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Itga2Q62469 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Itga2Q62469 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Itga2Q62469 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Itga2Q62469 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Itga2Q62469 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Itga2Q62469 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Itga2Q62469 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Itga2Q62469 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Itga2Q62469 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Itga2Q62469 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Itga2Q62469 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Itga2Q62469 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Itga2Q62469 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Itga2Q62469 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Itga2Q62469 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Itga2Q62469 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Itga2Q62469 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Itga2Q62469 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Itga2Q62469 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Itga2Q62469 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Itga2Q62469 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Itga2Q62469 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Itga2Q62469 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Itga2Q62469 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Itga2Q62469 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Itga2Q62469 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Itga2Q62469 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Itga2Q62469 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Itga2Q62469 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Itga2Q62469 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Itga2Q62469 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Itga2Q62469 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Itga2Q62469 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Itga2Q62469 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Itga2Q62469 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Itga2Q62469 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Itga2Q62469 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Itga2Q62469 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Itga2Q62469 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Itga2Q62469 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Itga2Q62469 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Itga2Q62469 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Itga2Q62469 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Itga2Q62469 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Itga2Q62469 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Itga2Q62469 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Itga2Q62469 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Itga2Q62469 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Itga2Q62469 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Itga2Q62469 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Itga2Q62469 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Itga2Q62469 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Itga2Q62469 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Itga2Q62469 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Itga2Q62469 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Itga2Q62469 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Itga2Q62469 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Itga2Q62469 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Itga2Q62469 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Itga2Q62469 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Itga2Q62469 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Itga2Q62469 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Itga2Q62469 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Itga2Q62469 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Itga2Q62469 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Itga2Q62469 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Itga2Q62469 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Itga2Q62469 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.9 ms