Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY18

Snx7, Sorting nexin-7, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx7Q9CY18 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC38.66■■■■□ 3.78
Snx7Q9CY18 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Snx7Q9CY18 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Snx7Q9CY18 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
Snx7Q9CY18 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
Snx7Q9CY18 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Snx7Q9CY18 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
Snx7Q9CY18 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Snx7Q9CY18 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Snx7Q9CY18 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Snx7Q9CY18 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
Snx7Q9CY18 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Snx7Q9CY18 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Snx7Q9CY18 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
Snx7Q9CY18 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Snx7Q9CY18 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
Snx7Q9CY18 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Snx7Q9CY18 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Snx7Q9CY18 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Snx7Q9CY18 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Snx7Q9CY18 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Snx7Q9CY18 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
Snx7Q9CY18 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Snx7Q9CY18 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Snx7Q9CY18 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
Snx7Q9CY18 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Snx7Q9CY18 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Snx7Q9CY18 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Snx7Q9CY18 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Snx7Q9CY18 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Snx7Q9CY18 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Snx7Q9CY18 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
Snx7Q9CY18 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Snx7Q9CY18 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Snx7Q9CY18 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
Snx7Q9CY18 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Snx7Q9CY18 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Snx7Q9CY18 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Snx7Q9CY18 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Snx7Q9CY18 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Snx7Q9CY18 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Snx7Q9CY18 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Snx7Q9CY18 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Snx7Q9CY18 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Snx7Q9CY18 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Snx7Q9CY18 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Snx7Q9CY18 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Snx7Q9CY18 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Snx7Q9CY18 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Snx7Q9CY18 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Snx7Q9CY18 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Snx7Q9CY18 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Snx7Q9CY18 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Snx7Q9CY18 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Snx7Q9CY18 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Snx7Q9CY18 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Snx7Q9CY18 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Snx7Q9CY18 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Snx7Q9CY18 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Snx7Q9CY18 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Snx7Q9CY18 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Snx7Q9CY18 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Snx7Q9CY18 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Snx7Q9CY18 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Snx7Q9CY18 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Snx7Q9CY18 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Snx7Q9CY18 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Snx7Q9CY18 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Snx7Q9CY18 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Snx7Q9CY18 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Snx7Q9CY18 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Snx7Q9CY18 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Snx7Q9CY18 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Snx7Q9CY18 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Snx7Q9CY18 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Snx7Q9CY18 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Snx7Q9CY18 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Snx7Q9CY18 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Snx7Q9CY18 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Snx7Q9CY18 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Snx7Q9CY18 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Snx7Q9CY18 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Snx7Q9CY18 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Snx7Q9CY18 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Snx7Q9CY18 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Snx7Q9CY18 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Snx7Q9CY18 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Snx7Q9CY18 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Snx7Q9CY18 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Snx7Q9CY18 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Snx7Q9CY18 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Snx7Q9CY18 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Snx7Q9CY18 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Snx7Q9CY18 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Snx7Q9CY18 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Snx7Q9CY18 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Snx7Q9CY18 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Snx7Q9CY18 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Snx7Q9CY18 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Snx7Q9CY18 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 161.6 ms