Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQS6

Gkn2, Gastrokine-2, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gkn2Q9CQS6 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
Gkn2Q9CQS6 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Gkn2Q9CQS6 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Gkn2Q9CQS6 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Gkn2Q9CQS6 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Gkn2Q9CQS6 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Gkn2Q9CQS6 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
Gkn2Q9CQS6 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Gkn2Q9CQS6 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
Gkn2Q9CQS6 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Gkn2Q9CQS6 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
Gkn2Q9CQS6 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Gkn2Q9CQS6 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Gkn2Q9CQS6 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Gkn2Q9CQS6 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Gkn2Q9CQS6 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Gkn2Q9CQS6 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Gkn2Q9CQS6 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Gkn2Q9CQS6 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Gkn2Q9CQS6 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Gkn2Q9CQS6 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Gkn2Q9CQS6 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Gkn2Q9CQS6 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Gkn2Q9CQS6 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Gkn2Q9CQS6 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Gkn2Q9CQS6 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Gkn2Q9CQS6 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
Gkn2Q9CQS6 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Gkn2Q9CQS6 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Gkn2Q9CQS6 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Gkn2Q9CQS6 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Gkn2Q9CQS6 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Gkn2Q9CQS6 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Gkn2Q9CQS6 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Gkn2Q9CQS6 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Gkn2Q9CQS6 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Gkn2Q9CQS6 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Gkn2Q9CQS6 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gkn2Q9CQS6 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Gkn2Q9CQS6 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Gkn2Q9CQS6 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Gkn2Q9CQS6 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gkn2Q9CQS6 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Gkn2Q9CQS6 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Gkn2Q9CQS6 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Gkn2Q9CQS6 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Gkn2Q9CQS6 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Gkn2Q9CQS6 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Gkn2Q9CQS6 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Gkn2Q9CQS6 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Gkn2Q9CQS6 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Gkn2Q9CQS6 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gkn2Q9CQS6 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gkn2Q9CQS6 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gkn2Q9CQS6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gkn2Q9CQS6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Gkn2Q9CQS6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Gkn2Q9CQS6 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Gkn2Q9CQS6 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Gkn2Q9CQS6 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Gkn2Q9CQS6 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gkn2Q9CQS6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gkn2Q9CQS6 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Gkn2Q9CQS6 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Gkn2Q9CQS6 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Gkn2Q9CQS6 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Gkn2Q9CQS6 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Gkn2Q9CQS6 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gkn2Q9CQS6 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Gkn2Q9CQS6 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gkn2Q9CQS6 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gkn2Q9CQS6 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gkn2Q9CQS6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gkn2Q9CQS6 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gkn2Q9CQS6 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gkn2Q9CQS6 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gkn2Q9CQS6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gkn2Q9CQS6 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Gkn2Q9CQS6 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Gkn2Q9CQS6 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gkn2Q9CQS6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gkn2Q9CQS6 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gkn2Q9CQS6 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gkn2Q9CQS6 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Gkn2Q9CQS6 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gkn2Q9CQS6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gkn2Q9CQS6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gkn2Q9CQS6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gkn2Q9CQS6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gkn2Q9CQS6 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gkn2Q9CQS6 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gkn2Q9CQS6 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gkn2Q9CQS6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gkn2Q9CQS6 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gkn2Q9CQS6 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gkn2Q9CQS6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gkn2Q9CQS6 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gkn2Q9CQS6 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gkn2Q9CQS6 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gkn2Q9CQS6 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms