Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z26

Cntn4, Contactin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn4Q69Z26 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
Cntn4Q69Z26 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Cntn4Q69Z26 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Cntn4Q69Z26 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Cntn4Q69Z26 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Cntn4Q69Z26 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Cntn4Q69Z26 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
Cntn4Q69Z26 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
Cntn4Q69Z26 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Cntn4Q69Z26 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
Cntn4Q69Z26 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Cntn4Q69Z26 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Cntn4Q69Z26 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
Cntn4Q69Z26 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Cntn4Q69Z26 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
Cntn4Q69Z26 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Cntn4Q69Z26 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Cntn4Q69Z26 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Cntn4Q69Z26 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Cntn4Q69Z26 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Cntn4Q69Z26 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Cntn4Q69Z26 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Cntn4Q69Z26 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Cntn4Q69Z26 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Cntn4Q69Z26 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
Cntn4Q69Z26 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Cntn4Q69Z26 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Cntn4Q69Z26 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Cntn4Q69Z26 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Cntn4Q69Z26 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Cntn4Q69Z26 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
Cntn4Q69Z26 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Cntn4Q69Z26 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Cntn4Q69Z26 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Cntn4Q69Z26 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Cntn4Q69Z26 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Cntn4Q69Z26 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Cntn4Q69Z26 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Cntn4Q69Z26 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Cntn4Q69Z26 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Cntn4Q69Z26 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cntn4Q69Z26 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cntn4Q69Z26 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cntn4Q69Z26 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Cntn4Q69Z26 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cntn4Q69Z26 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Cntn4Q69Z26 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cntn4Q69Z26 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cntn4Q69Z26 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cntn4Q69Z26 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cntn4Q69Z26 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cntn4Q69Z26 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cntn4Q69Z26 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cntn4Q69Z26 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Cntn4Q69Z26 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Cntn4Q69Z26 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cntn4Q69Z26 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cntn4Q69Z26 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cntn4Q69Z26 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Cntn4Q69Z26 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cntn4Q69Z26 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cntn4Q69Z26 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cntn4Q69Z26 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Cntn4Q69Z26 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cntn4Q69Z26 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cntn4Q69Z26 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cntn4Q69Z26 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cntn4Q69Z26 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cntn4Q69Z26 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cntn4Q69Z26 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cntn4Q69Z26 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cntn4Q69Z26 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Cntn4Q69Z26 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cntn4Q69Z26 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cntn4Q69Z26 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cntn4Q69Z26 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Cntn4Q69Z26 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cntn4Q69Z26 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cntn4Q69Z26 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cntn4Q69Z26 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cntn4Q69Z26 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cntn4Q69Z26 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cntn4Q69Z26 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cntn4Q69Z26 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cntn4Q69Z26 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cntn4Q69Z26 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cntn4Q69Z26 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cntn4Q69Z26 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cntn4Q69Z26 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cntn4Q69Z26 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cntn4Q69Z26 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cntn4Q69Z26 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cntn4Q69Z26 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cntn4Q69Z26 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cntn4Q69Z26 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cntn4Q69Z26 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cntn4Q69Z26 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cntn4Q69Z26 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cntn4Q69Z26 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cntn4Q69Z26 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms