Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS7

Cacna1f, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1F, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1fQ9JIS7 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC45,88■■■■■ 4,94
Cacna1fQ9JIS7 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC42,69■■■■■ 4,42
Cacna1fQ9JIS7 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,67■■■■■ 4,26
Cacna1fQ9JIS7 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC40,06■■■■■ 4
Cacna1fQ9JIS7 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC39,98■■■■□ 3,99
Cacna1fQ9JIS7 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC39,39■■■■□ 3,9
Cacna1fQ9JIS7 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,86■■■■□ 3,81
Cacna1fQ9JIS7 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,8■■■■□ 3,8
Cacna1fQ9JIS7 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC38,47■■■■□ 3,75
Cacna1fQ9JIS7 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,39■■■■□ 3,74
Cacna1fQ9JIS7 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,35■■■■□ 3,73
Cacna1fQ9JIS7 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC38,22■■■■□ 3,71
Cacna1fQ9JIS7 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,68■■■■□ 3,62
Cacna1fQ9JIS7 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC37,25■■■■□ 3,55
Cacna1fQ9JIS7 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37,11■■■■□ 3,53
Cacna1fQ9JIS7 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,11■■■■□ 3,53
Cacna1fQ9JIS7 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC36,86■■■■□ 3,49
Cacna1fQ9JIS7 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36,69■■■■□ 3,46
Cacna1fQ9JIS7 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC36,67■■■■□ 3,46
Cacna1fQ9JIS7 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC36,61■■■■□ 3,45
Cacna1fQ9JIS7 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,6■■■■□ 3,45
Cacna1fQ9JIS7 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,59■■■■□ 3,45
Cacna1fQ9JIS7 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,55■■■■□ 3,44
Cacna1fQ9JIS7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,53■■■■□ 3,44
Cacna1fQ9JIS7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,41■■■■□ 3,42
Cacna1fQ9JIS7 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,39■■■■□ 3,42
Cacna1fQ9JIS7 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC36,26■■■■□ 3,4
Cacna1fQ9JIS7 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,26■■■■□ 3,4
Cacna1fQ9JIS7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC36,24■■■■□ 3,39
Cacna1fQ9JIS7 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36,18■■■■□ 3,38
Cacna1fQ9JIS7 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,11■■■■□ 3,37
Cacna1fQ9JIS7 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC36,07■■■■□ 3,37
Cacna1fQ9JIS7 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3,35
Cacna1fQ9JIS7 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,84■■■■□ 3,33
Cacna1fQ9JIS7 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35,64■■■■□ 3,3
Cacna1fQ9JIS7 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,58■■■■□ 3,29
Cacna1fQ9JIS7 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,57■■■■□ 3,28
Cacna1fQ9JIS7 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC35,45■■■■□ 3,27
Cacna1fQ9JIS7 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC35,27■■■■□ 3,24
Cacna1fQ9JIS7 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC35,23■■■■□ 3,23
Cacna1fQ9JIS7 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC35,17■■■■□ 3,22
Cacna1fQ9JIS7 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC35,14■■■■□ 3,22
Cacna1fQ9JIS7 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35,12■■■■□ 3,21
Cacna1fQ9JIS7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC35,04■■■■□ 3,2
Cacna1fQ9JIS7 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,02■■■■□ 3,2
Cacna1fQ9JIS7 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,87■■■■□ 3,17
Cacna1fQ9JIS7 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC34,81■■■■□ 3,16
Cacna1fQ9JIS7 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,71■■■■□ 3,15
Cacna1fQ9JIS7 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC34,61■■■■□ 3,13
Cacna1fQ9JIS7 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC34,58■■■■□ 3,13
Cacna1fQ9JIS7 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,54■■■■□ 3,12
Cacna1fQ9JIS7 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC34,41■■■■□ 3,1
Cacna1fQ9JIS7 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC34,4■■■■□ 3,1
Cacna1fQ9JIS7 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,33■■■■□ 3,09
Cacna1fQ9JIS7 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,32■■■■□ 3,08
Cacna1fQ9JIS7 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,29■■■■□ 3,08
Cacna1fQ9JIS7 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC34,29■■■■□ 3,08
Cacna1fQ9JIS7 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34,27■■■■□ 3,08
Cacna1fQ9JIS7 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC34,27■■■■□ 3,08
Cacna1fQ9JIS7 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC34,18■■■■□ 3,06
Cacna1fQ9JIS7 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC34,18■■■■□ 3,06
Cacna1fQ9JIS7 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,17■■■■□ 3,06
Cacna1fQ9JIS7 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC34,17■■■■□ 3,06
Cacna1fQ9JIS7 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC34,08■■■■□ 3,05
Cacna1fQ9JIS7 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,08■■■■□ 3,05
Cacna1fQ9JIS7 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC34,05■■■■□ 3,04
Cacna1fQ9JIS7 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,05■■■■□ 3,04
Cacna1fQ9JIS7 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3,03
Cacna1fQ9JIS7 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,99■■■■□ 3,03
Cacna1fQ9JIS7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33,99■■■■□ 3,03
Cacna1fQ9JIS7 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC33,91■■■■□ 3,02
Cacna1fQ9JIS7 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC33,9■■■■□ 3,02
Cacna1fQ9JIS7 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,88■■■■□ 3,01
Cacna1fQ9JIS7 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,87■■■■□ 3,01
Cacna1fQ9JIS7 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC33,82■■■■□ 3
Cacna1fQ9JIS7 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,78■■■■□ 3
Cacna1fQ9JIS7 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,76■■■■□ 3
Cacna1fQ9JIS7 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,76■■■□□ 2,99
Cacna1fQ9JIS7 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,74■■■□□ 2,99
Cacna1fQ9JIS7 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC33,74■■■□□ 2,99
Cacna1fQ9JIS7 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33,6■■■□□ 2,97
Cacna1fQ9JIS7 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC33,54■■■□□ 2,96
Cacna1fQ9JIS7 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,53■■■□□ 2,96
Cacna1fQ9JIS7 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,51■■■□□ 2,95
Cacna1fQ9JIS7 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC33,5■■■□□ 2,95
Cacna1fQ9JIS7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33,46■■■□□ 2,95
Cacna1fQ9JIS7 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,45■■■□□ 2,95
Cacna1fQ9JIS7 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,45■■■□□ 2,95
Cacna1fQ9JIS7 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,45■■■□□ 2,94
Cacna1fQ9JIS7 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC33,42■■■□□ 2,94
Cacna1fQ9JIS7 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC33,42■■■□□ 2,94
Cacna1fQ9JIS7 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,35■■■□□ 2,93
Cacna1fQ9JIS7 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC33,34■■■□□ 2,93
Cacna1fQ9JIS7 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,32■■■□□ 2,92
Cacna1fQ9JIS7 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC33,31■■■□□ 2,92
Cacna1fQ9JIS7 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,29■■■□□ 2,92
Cacna1fQ9JIS7 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,22■■■□□ 2,91
Cacna1fQ9JIS7 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC33,2■■■□□ 2,91
Cacna1fQ9JIS7 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,15■■■□□ 2,9
Cacna1fQ9JIS7 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,12■■■□□ 2,89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,4 ms