RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565224.5

SMG1-210, Transcript of SMG1, nonsense mediated mRNA decay associated PI3K related kinase, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SMG1, Length 2,372 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1-210ENST00000565224 SH3GL1Q99961 368 aa7.13□□□□□ -1.27
SMG1-210ENST00000565224 BEGAINQ9BUH8 593 aa7.13□□□□□ -1.27
SMG1-210ENST00000565224 GPR62Q9BZJ7 368 aa7.13□□□□□ -1.27
SMG1-210ENST00000565224 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa7.13□□□□□ -1.27
SMG1-210ENST00000565224 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
SMG1-210ENST00000565224 SMURF2Q9HAU4 748 aa7.13□□□□□ -1.27
SMG1-210ENST00000565224 GNPTGQ9UJJ9 305 aa7.13□□□□□ -1.27
SMG1-210ENST00000565224 AP3M1Q9Y2T2 418 aa7.13□□□□□ -1.27
SMG1-210ENST00000565224 SH3GLB1Q9Y371 365 aa7.13□□□□□ -1.27
SMG1-210ENST00000565224 PKP3Q9Y446 797 aa7.13□□□□□ -1.27
SMG1-210ENST00000565224 ZNF711Q9Y462 761 aa7.13□□□□□ -1.27
SMG1-210ENST00000565224 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa7.13□□□□□ -1.27
SMG1-210ENST00000565224 A0A0U1RQS6 177 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG1-210ENST00000565224 SLC28A1O00337 649 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG1-210ENST00000565224 CXCR6O00574 342 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG1-210ENST00000565224 NOBOXO60393 691 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG1-210ENST00000565224 CLPXO76031 633 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG1-210ENST00000565224 IL6P05231 212 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG1-210ENST00000565224 OCM2P0CE71 109 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG1-210ENST00000565224 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
SMG1-210ENST00000565224 PIGAP37287 484 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG1-210ENST00000565224 HSPA7P48741 367 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG1-210ENST00000565224 CD97P48960 835 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG1-210ENST00000565224 RGS4P49798 205 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG1-210ENST00000565224 SGSHP51688 502 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG1-210ENST00000565224 PLA2G16P53816 162 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG1-210ENST00000565224 IST1P53990 364 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG1-210ENST00000565224 FAM189BP81408 668 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG1-210ENST00000565224 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
SMG1-210ENST00000565224 MEP1AQ16819 746 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG1-210ENST00000565224 CACHD1Q5VU97 1274 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG1-210ENST00000565224 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
SMG1-210ENST00000565224 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
SMG1-210ENST00000565224 GALNT18Q6P9A2 607 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG1-210ENST00000565224 NCEH1Q6PIU2 408 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG1-210ENST00000565224 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
SMG1-210ENST00000565224 CERS6Q6ZMG9 384 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG1-210ENST00000565224 RNF165Q6ZSG1 346 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG1-210ENST00000565224 MSRB3Q8IXL7 192 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG1-210ENST00000565224 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
SMG1-210ENST00000565224 SGCDQ92629 289 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG1-210ENST00000565224 CCDC138Q96M89 665 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG1-210ENST00000565224 TTLL2Q9BWV7 592 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG1-210ENST00000565224 DPY30Q9C005 99 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG1-210ENST00000565224 CLPBQ9H078 707 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG1-210ENST00000565224 RAD21L1Q9H4I0 556 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG1-210ENST00000565224 ELOVL2Q9NXB9 296 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG1-210ENST00000565224 IL17CQ9P0M4 197 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG1-210ENST00000565224 OARD1Q9Y530 152 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG1-210ENST00000565224 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG1-210ENST00000565224 GBF1Q92538 1859 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG1-210ENST00000565224 A0A1B0GVM2 712 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG1-210ENST00000565224 J3QRK9 145 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG1-210ENST00000565224 FFAR3O14843 346 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG1-210ENST00000565224 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
SMG1-210ENST00000565224 GPR42O15529 346 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG1-210ENST00000565224 TAPBPO15533 448 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG1-210ENST00000565224 PRKD3O94806 890 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG1-210ENST00000565224 WDR47O94967 919 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG1-210ENST00000565224 GUCA1CO95843 209 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG1-210ENST00000565224 PGRP06401 933 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG1-210ENST00000565224 RETP07949 1114 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG1-210ENST00000565224 HTR1AP08908 422 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG1-210ENST00000565224 SLC10A3P09131 477 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG1-210ENST00000565224 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
SMG1-210ENST00000565224 ATF6P18850 670 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG1-210ENST00000565224 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP7.12□□□□□ -1.27
SMG1-210ENST00000565224 GNPDA1P46926 289 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG1-210ENST00000565224 NRIP1P48552 1158 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG1-210ENST00000565224 ARF5P84085 180 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG1-210ENST00000565224 CD47Q08722 323 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG1-210ENST00000565224 TWF1Q12792 350 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG1-210ENST00000565224 KCNAB2Q13303 367 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG1-210ENST00000565224 LAPTM5Q13571 262 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG1-210ENST00000565224 SPIDRQ14159 915 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG1-210ENST00000565224 NR1D2Q14995 579 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG1-210ENST00000565224 IMPG1Q17R60 797 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG1-210ENST00000565224 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
SMG1-210ENST00000565224 RUNDC3AQ59EK9 446 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG1-210ENST00000565224 SPANXN4Q5MJ08 99 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG1-210ENST00000565224 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
SMG1-210ENST00000565224 SPESP1Q6UW49 350 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG1-210ENST00000565224 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
SMG1-210ENST00000565224 ZBTB46Q86UZ6 589 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG1-210ENST00000565224 ADHFE1Q8IWW8 467 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG1-210ENST00000565224 MICU2Q8IYU8 434 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG1-210ENST00000565224 EID3Q8N140 333 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG1-210ENST00000565224 CENPSQ8N2Z9 138 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG1-210ENST00000565224 LIX1Q8N485 282 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG1-210ENST00000565224 SLC15A4Q8N697 577 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG1-210ENST00000565224 OR5K1Q8NHB7 308 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG1-210ENST00000565224 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
SMG1-210ENST00000565224 CHPT1Q8WUD6 406 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG1-210ENST00000565224 NCLNQ969V3 563 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG1-210ENST00000565224 MUL1Q969V5 352 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG1-210ENST00000565224 PLD4Q96BZ4 506 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG1-210ENST00000565224 FBXL8Q96CD0 374 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG1-210ENST00000565224 CSF3RQ99062 836 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG1-210ENST00000565224 EGFL8Q99944 293 aa7.12□□□□□ -1.27
SMG1-210ENST00000565224 TBCDQ9BTW9 1192 aa7.12□□□□□ -1.27
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