RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000047793.5

Hoxd1-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd1, Length 1,862 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ppp1r3eQ8BRJ4 279 aa20.41■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Galnt13Q8CF93 556 aa20.41■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cdc26Q99JP4 85 aa20.41■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cyb5r1Q9DB73 305 aa20.41■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Dpysl5Q9EQF6 564 aa20.41■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Prl5a1Q9JII2 230 aa20.41■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cdh13Q9WTR5 714 aa20.41■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Dthd1E9PZX1 795 aa20.4■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 MaptP10637 733 aa20.4■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tgm2P21981 686 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Il6raP22272 460 aa20.4■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Folr1P35846 255 aa20.4■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gdf5P43027 495 aa20.4■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Neurog1P70660 244 aa20.4■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Alg6Q3TAE8 507 aa20.4■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Fam189bQ5HZJ5 669 aa20.4■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Sdf4Q61112 361 aa20.4■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 FaddQ61160 205 aa20.4■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Pcbp2Q61990 362 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Slc13a5Q67BT3 572 aa20.4■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Kmt5cQ6Q783 468 aa20.4■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Nrn1lQ8C4W3 162 aa20.4■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Pi4k2bQ8CBQ5 469 aa20.4■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Hid1Q8R1F6 788 aa20.4■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Slc6a20aQ8VDB9 592 aa20.4■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Adam33Q923W9 797 aa20.4■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tspan11Q9D1D1 253 aa20.4■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Il1rl2Q9ERS7 574 aa20.4■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Mpp6Q9JLB0 553 aa20.4■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 PtsQ9R1Z7 144 aa20.4■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 PrebQ9WUQ2 417 aa20.4■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Spin2gA0A0N4SW15 236 aa20.39■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Olfr1200A2ATJ4 336 aa20.39■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 FgaE9PV24 789 aa20.39■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Spin2eJ3QNQ0 234 aa20.39■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Coro1aO89053 461 aa20.39■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 LdhcP00342 332 aa20.39■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 F2P19221 618 aa20.39■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tap1P21958 724 aa20.39■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 LchnQ3UHG7 455 aa20.39■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Jak2Q62120 1129 aa20.39■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Dna2Q6ZQJ5 1062 aa20.39■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Zmpste24Q80W54 475 aa20.39■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Krr1Q8BGA5 380 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Mmgt2Q8R3L0 123 aa20.39■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Spred2Q924S7 410 aa20.39■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 MlycdQ99J39 492 aa20.39■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ergic3Q9CQE7 383 aa20.39■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Pbld2Q9CXN7 288 aa20.39■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Vps35Q9EQH3 796 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ddx39bQ9Z1N5 428 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Slc22a4Q9Z306 553 aa20.39■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm3752A6NAT4 150 aa20.39■□□□□ 0.85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Prkag1O54950 330 aa20.39■□□□□ 0.85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Matn4O89029 624 aa20.39■□□□□ 0.85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 DmwdQ08274 665 aa20.39■□□□□ 0.85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tmc5Q32NZ6 967 aa20.39■□□□□ 0.85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Zmat1Q3V0C1 714 aa20.39■□□□□ 0.85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Fndc3aQ8BX90 1198 aa20.39■□□□□ 0.85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Etv3Q8R4Z4 513 aa20.39■□□□□ 0.85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Dio3Q91ZI8 304 aa20.39■□□□□ 0.85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Nck1Q99M51 377 aa20.39■□□□□ 0.85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Lrrc18Q9CQ07 262 aa20.39■□□□□ 0.85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ndufb5Q9CQH3 189 aa20.39■□□□□ 0.85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Nudt17Q9CWD3 296 aa20.39■□□□□ 0.85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 4933425L06RikQ9D3Z8 585 aa20.39■□□□□ 0.85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Pop5Q9DB28 169 aa20.39■□□□□ 0.85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Slco1c1Q9ERB5 715 aa20.39■□□□□ 0.85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Vsig10l2A0A140LHF2 776 aa20.38■□□□□ 0.85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ceacam3E9Q6J4 706 aa20.38■□□□□ 0.85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Polr2jO08740 117 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 CenpcP49452 906 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 LcorlQ3U285 600 aa20.38■□□□□ 0.85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ceacam5Q3UKK2 947 aa20.38■□□□□ 0.85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Sorbs2Q3UTJ2 1180 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 HadhQ61425 314 aa20.38■□□□□ 0.85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Igfbp7Q61581 281 aa20.38■□□□□ 0.85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Mgat5bQ765H6 792 aa20.38■□□□□ 0.85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Fut11Q8BHC9 489 aa20.38■□□□□ 0.85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Zfp719Q8BIV1 735 aa20.38■□□□□ 0.85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Shc2Q8BMC3 573 aa20.38■□□□□ 0.85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Atxn7l2Q8C8K6 696 aa20.38■□□□□ 0.85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cacnb2Q8CC27 655 aa20.38■□□□□ 0.85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tp53bp2Q8CG79 1128 aa20.38■□□□□ 0.85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Slc35c2Q8VCX2 364 aa20.38■□□□□ 0.85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Paip2bQ91W45 136 aa20.38■□□□□ 0.85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Slc22a7Q91WU2 540 aa20.38■□□□□ 0.85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 MpstQ99J99 297 aa20.38■□□□□ 0.85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Shmt2Q9CZN7 504 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Alg14Q9D081 217 aa20.38■□□□□ 0.85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Wdr89Q9D0R9 386 aa20.38■□□□□ 0.85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Sh2d4aQ9D7V1 421 aa20.38■□□□□ 0.85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Il23aQ9EQ14 196 aa20.38■□□□□ 0.85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 PtprdQ64487 1912 aa20.38■□□□□ 0.85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Kat6aQ8BZ21 2003 aa20.38■□□□□ 0.85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm13040A2A8C4 496 aa20.37■□□□□ 0.85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm13101A2ASJ0 481 aa20.37■□□□□ 0.85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm13119B1ARV5 481 aa20.37■□□□□ 0.85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cylc2B1AWN8 422 aa20.37■□□□□ 0.85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 TriqkB2B9E1 86 aa20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 23 ms