Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R9

Wdr89, WD repeat-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr89Q9D0R9 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,28■■■□□ 2,76
Wdr89Q9D0R9 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2,55
Wdr89Q9D0R9 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,84■■■□□ 2,53
Wdr89Q9D0R9 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,77■■■□□ 2,52
Wdr89Q9D0R9 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30,45■■■□□ 2,46
Wdr89Q9D0R9 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,36■■■□□ 2,45
Wdr89Q9D0R9 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30,05■■■□□ 2,4
Wdr89Q9D0R9 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,27
Wdr89Q9D0R9 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
Wdr89Q9D0R9 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
Wdr89Q9D0R9 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,81■■■□□ 2,2
Wdr89Q9D0R9 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,78■■■□□ 2,2
Wdr89Q9D0R9 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,69■■■□□ 2,18
Wdr89Q9D0R9 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
Wdr89Q9D0R9 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28,56■■■□□ 2,16
Wdr89Q9D0R9 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,53■■■□□ 2,16
Wdr89Q9D0R9 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,48■■■□□ 2,15
Wdr89Q9D0R9 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
Wdr89Q9D0R9 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28,02■■■□□ 2,08
Wdr89Q9D0R9 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,98■■■□□ 2,07
Wdr89Q9D0R9 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,93■■■□□ 2,06
Wdr89Q9D0R9 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,85■■■□□ 2,05
Wdr89Q9D0R9 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,05
Wdr89Q9D0R9 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,79■■■□□ 2,04
Wdr89Q9D0R9 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27,63■■■□□ 2,01
Wdr89Q9D0R9 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,62■■■□□ 2,01
Wdr89Q9D0R9 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27,55■■■□□ 2
Wdr89Q9D0R9 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,55■■■□□ 2
Wdr89Q9D0R9 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27,46■■□□□ 1,99
Wdr89Q9D0R9 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,45■■□□□ 1,98
Wdr89Q9D0R9 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27,44■■□□□ 1,98
Wdr89Q9D0R9 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,41■■□□□ 1,98
Wdr89Q9D0R9 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27,3■■□□□ 1,96
Wdr89Q9D0R9 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
Wdr89Q9D0R9 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27,27■■□□□ 1,96
Wdr89Q9D0R9 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,25■■□□□ 1,95
Wdr89Q9D0R9 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,18■■□□□ 1,94
Wdr89Q9D0R9 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
Wdr89Q9D0R9 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27,02■■□□□ 1,92
Wdr89Q9D0R9 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27,01■■□□□ 1,91
Wdr89Q9D0R9 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,99■■□□□ 1,91
Wdr89Q9D0R9 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26,99■■□□□ 1,91
Wdr89Q9D0R9 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26,98■■□□□ 1,91
Wdr89Q9D0R9 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,95■■□□□ 1,9
Wdr89Q9D0R9 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,91■■□□□ 1,9
Wdr89Q9D0R9 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,91■■□□□ 1,9
Wdr89Q9D0R9 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26,91■■□□□ 1,9
Wdr89Q9D0R9 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,89
Wdr89Q9D0R9 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,87■■□□□ 1,89
Wdr89Q9D0R9 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,77■■□□□ 1,88
Wdr89Q9D0R9 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,67■■□□□ 1,86
Wdr89Q9D0R9 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26,63■■□□□ 1,85
Wdr89Q9D0R9 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,57■■□□□ 1,84
Wdr89Q9D0R9 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26,56■■□□□ 1,84
Wdr89Q9D0R9 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,51■■□□□ 1,83
Wdr89Q9D0R9 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26,43■■□□□ 1,82
Wdr89Q9D0R9 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,41■■□□□ 1,82
Wdr89Q9D0R9 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,4■■□□□ 1,82
Wdr89Q9D0R9 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,39■■□□□ 1,81
Wdr89Q9D0R9 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,38■■□□□ 1,81
Wdr89Q9D0R9 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,31■■□□□ 1,8
Wdr89Q9D0R9 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,31■■□□□ 1,8
Wdr89Q9D0R9 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,31■■□□□ 1,8
Wdr89Q9D0R9 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,27■■□□□ 1,8
Wdr89Q9D0R9 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,26■■□□□ 1,79
Wdr89Q9D0R9 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,24■■□□□ 1,79
Wdr89Q9D0R9 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26,09■■□□□ 1,77
Wdr89Q9D0R9 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26,07■■□□□ 1,76
Wdr89Q9D0R9 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,07■■□□□ 1,76
Wdr89Q9D0R9 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,06■■□□□ 1,76
Wdr89Q9D0R9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26,06■■□□□ 1,76
Wdr89Q9D0R9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,02■■□□□ 1,76
Wdr89Q9D0R9 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1,75
Wdr89Q9D0R9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1,75
Wdr89Q9D0R9 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,99■■□□□ 1,75
Wdr89Q9D0R9 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,95■■□□□ 1,75
Wdr89Q9D0R9 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,94■■□□□ 1,74
Wdr89Q9D0R9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,92■■□□□ 1,74
Wdr89Q9D0R9 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25,91■■□□□ 1,74
Wdr89Q9D0R9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25,87■■□□□ 1,73
Wdr89Q9D0R9 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,79■■□□□ 1,72
Wdr89Q9D0R9 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,79■■□□□ 1,72
Wdr89Q9D0R9 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
Wdr89Q9D0R9 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,75■■□□□ 1,71
Wdr89Q9D0R9 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
Wdr89Q9D0R9 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
Wdr89Q9D0R9 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,71
Wdr89Q9D0R9 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25,62■■□□□ 1,69
Wdr89Q9D0R9 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
Wdr89Q9D0R9 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
Wdr89Q9D0R9 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Wdr89Q9D0R9 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
Wdr89Q9D0R9 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
Wdr89Q9D0R9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
Wdr89Q9D0R9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Wdr89Q9D0R9 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25,45■■□□□ 1,67
Wdr89Q9D0R9 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Wdr89Q9D0R9 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Wdr89Q9D0R9 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25,34■■□□□ 1,65
Wdr89Q9D0R9 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,7 ms