Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBQ5

Pi4k2b, Phosphatidylinositol 4-kinase type 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pi4k2bQ8CBQ5 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33,99■■■■□ 3,03
Pi4k2bQ8CBQ5 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,43■■■□□ 2,94
Pi4k2bQ8CBQ5 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,33■■■□□ 2,77
Pi4k2bQ8CBQ5 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,25■■■□□ 2,75
Pi4k2bQ8CBQ5 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31,31■■■□□ 2,6
Pi4k2bQ8CBQ5 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31,23■■■□□ 2,59
Pi4k2bQ8CBQ5 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,81■■■□□ 2,52
Pi4k2bQ8CBQ5 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,76■■■□□ 2,51
Pi4k2bQ8CBQ5 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,48■■■□□ 2,47
Pi4k2bQ8CBQ5 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,44■■■□□ 2,46
Pi4k2bQ8CBQ5 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30,44■■■□□ 2,46
Pi4k2bQ8CBQ5 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,14■■■□□ 2,42
Pi4k2bQ8CBQ5 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,14■■■□□ 2,41
Pi4k2bQ8CBQ5 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29,97■■■□□ 2,39
Pi4k2bQ8CBQ5 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29,92■■■□□ 2,38
Pi4k2bQ8CBQ5 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,92■■■□□ 2,38
Pi4k2bQ8CBQ5 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,89■■■□□ 2,38
Pi4k2bQ8CBQ5 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
Pi4k2bQ8CBQ5 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
Pi4k2bQ8CBQ5 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
Pi4k2bQ8CBQ5 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29,36■■■□□ 2,29
Pi4k2bQ8CBQ5 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,24■■■□□ 2,27
Pi4k2bQ8CBQ5 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
Pi4k2bQ8CBQ5 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,19■■■□□ 2,26
Pi4k2bQ8CBQ5 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,18■■■□□ 2,26
Pi4k2bQ8CBQ5 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
Pi4k2bQ8CBQ5 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Pi4k2bQ8CBQ5 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
Pi4k2bQ8CBQ5 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29,08■■■□□ 2,25
Pi4k2bQ8CBQ5 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
Pi4k2bQ8CBQ5 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Pi4k2bQ8CBQ5 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28,88■■■□□ 2,21
Pi4k2bQ8CBQ5 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,87■■■□□ 2,21
Pi4k2bQ8CBQ5 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,77■■■□□ 2,2
Pi4k2bQ8CBQ5 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28,74■■■□□ 2,19
Pi4k2bQ8CBQ5 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,69■■■□□ 2,18
Pi4k2bQ8CBQ5 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,63■■■□□ 2,17
Pi4k2bQ8CBQ5 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28,61■■■□□ 2,17
Pi4k2bQ8CBQ5 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28,59■■■□□ 2,17
Pi4k2bQ8CBQ5 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28,48■■■□□ 2,15
Pi4k2bQ8CBQ5 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28,37■■■□□ 2,13
Pi4k2bQ8CBQ5 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28,35■■■□□ 2,13
Pi4k2bQ8CBQ5 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
Pi4k2bQ8CBQ5 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Pi4k2bQ8CBQ5 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Pi4k2bQ8CBQ5 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
Pi4k2bQ8CBQ5 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28,2■■■□□ 2,1
Pi4k2bQ8CBQ5 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Pi4k2bQ8CBQ5 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,05■■■□□ 2,08
Pi4k2bQ8CBQ5 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28,03■■■□□ 2,08
Pi4k2bQ8CBQ5 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28■■■□□ 2,07
Pi4k2bQ8CBQ5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
Pi4k2bQ8CBQ5 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27,96■■■□□ 2,07
Pi4k2bQ8CBQ5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
Pi4k2bQ8CBQ5 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,73■■■□□ 2,03
Pi4k2bQ8CBQ5 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,71■■■□□ 2,03
Pi4k2bQ8CBQ5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27,68■■■□□ 2,02
Pi4k2bQ8CBQ5 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,66■■■□□ 2,02
Pi4k2bQ8CBQ5 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,66■■■□□ 2,02
Pi4k2bQ8CBQ5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27,65■■■□□ 2,02
Pi4k2bQ8CBQ5 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,59■■■□□ 2,01
Pi4k2bQ8CBQ5 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,57■■■□□ 2
Pi4k2bQ8CBQ5 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,55■■■□□ 2
Pi4k2bQ8CBQ5 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,54■■■□□ 2
Pi4k2bQ8CBQ5 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27,53■■■□□ 2
Pi4k2bQ8CBQ5 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
Pi4k2bQ8CBQ5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,49■■□□□ 1,99
Pi4k2bQ8CBQ5 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,43■■□□□ 1,98
Pi4k2bQ8CBQ5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,39■■□□□ 1,97
Pi4k2bQ8CBQ5 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27,32■■□□□ 1,96
Pi4k2bQ8CBQ5 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
Pi4k2bQ8CBQ5 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,27■■□□□ 1,96
Pi4k2bQ8CBQ5 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,95
Pi4k2bQ8CBQ5 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27,26■■□□□ 1,95
Pi4k2bQ8CBQ5 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
Pi4k2bQ8CBQ5 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,16■■□□□ 1,94
Pi4k2bQ8CBQ5 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
Pi4k2bQ8CBQ5 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
Pi4k2bQ8CBQ5 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26,99■■□□□ 1,91
Pi4k2bQ8CBQ5 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,99■■□□□ 1,91
Pi4k2bQ8CBQ5 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,96■■□□□ 1,91
Pi4k2bQ8CBQ5 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,96■■□□□ 1,91
Pi4k2bQ8CBQ5 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,95■■□□□ 1,9
Pi4k2bQ8CBQ5 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
Pi4k2bQ8CBQ5 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,89
Pi4k2bQ8CBQ5 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,88■■□□□ 1,89
Pi4k2bQ8CBQ5 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26,87■■□□□ 1,89
Pi4k2bQ8CBQ5 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26,84■■□□□ 1,89
Pi4k2bQ8CBQ5 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
Pi4k2bQ8CBQ5 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
Pi4k2bQ8CBQ5 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,8■■□□□ 1,88
Pi4k2bQ8CBQ5 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,8■■□□□ 1,88
Pi4k2bQ8CBQ5 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,79■■□□□ 1,88
Pi4k2bQ8CBQ5 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26,76■■□□□ 1,87
Pi4k2bQ8CBQ5 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,75■■□□□ 1,87
Pi4k2bQ8CBQ5 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26,75■■□□□ 1,87
Pi4k2bQ8CBQ5 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,75■■□□□ 1,87
Pi4k2bQ8CBQ5 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,73■■□□□ 1,87
Pi4k2bQ8CBQ5 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,73■■□□□ 1,87
Pi4k2bQ8CBQ5 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,72■■□□□ 1,87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,4 ms