Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBQ5

Pi4k2b, Phosphatidylinositol 4-kinase type 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pi4k2bQ8CBQ5 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
Pi4k2bQ8CBQ5 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Pi4k2bQ8CBQ5 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Pi4k2bQ8CBQ5 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Pi4k2bQ8CBQ5 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Pi4k2bQ8CBQ5 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
Pi4k2bQ8CBQ5 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Pi4k2bQ8CBQ5 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Pi4k2bQ8CBQ5 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Pi4k2bQ8CBQ5 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Pi4k2bQ8CBQ5 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
Pi4k2bQ8CBQ5 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Pi4k2bQ8CBQ5 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Pi4k2bQ8CBQ5 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
Pi4k2bQ8CBQ5 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Pi4k2bQ8CBQ5 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Pi4k2bQ8CBQ5 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Pi4k2bQ8CBQ5 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Pi4k2bQ8CBQ5 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Pi4k2bQ8CBQ5 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Pi4k2bQ8CBQ5 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Pi4k2bQ8CBQ5 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Pi4k2bQ8CBQ5 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Pi4k2bQ8CBQ5 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Pi4k2bQ8CBQ5 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Pi4k2bQ8CBQ5 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Pi4k2bQ8CBQ5 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Pi4k2bQ8CBQ5 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Pi4k2bQ8CBQ5 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Pi4k2bQ8CBQ5 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Pi4k2bQ8CBQ5 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Pi4k2bQ8CBQ5 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Pi4k2bQ8CBQ5 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Pi4k2bQ8CBQ5 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Pi4k2bQ8CBQ5 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Pi4k2bQ8CBQ5 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Pi4k2bQ8CBQ5 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Pi4k2bQ8CBQ5 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Pi4k2bQ8CBQ5 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Pi4k2bQ8CBQ5 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Pi4k2bQ8CBQ5 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Pi4k2bQ8CBQ5 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Pi4k2bQ8CBQ5 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Pi4k2bQ8CBQ5 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Pi4k2bQ8CBQ5 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Pi4k2bQ8CBQ5 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Pi4k2bQ8CBQ5 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Pi4k2bQ8CBQ5 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pi4k2bQ8CBQ5 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Pi4k2bQ8CBQ5 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pi4k2bQ8CBQ5 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Pi4k2bQ8CBQ5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pi4k2bQ8CBQ5 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Pi4k2bQ8CBQ5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Pi4k2bQ8CBQ5 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Pi4k2bQ8CBQ5 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Pi4k2bQ8CBQ5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Pi4k2bQ8CBQ5 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Pi4k2bQ8CBQ5 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Pi4k2bQ8CBQ5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Pi4k2bQ8CBQ5 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pi4k2bQ8CBQ5 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Pi4k2bQ8CBQ5 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Pi4k2bQ8CBQ5 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Pi4k2bQ8CBQ5 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Pi4k2bQ8CBQ5 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Pi4k2bQ8CBQ5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pi4k2bQ8CBQ5 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Pi4k2bQ8CBQ5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Pi4k2bQ8CBQ5 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Pi4k2bQ8CBQ5 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pi4k2bQ8CBQ5 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Pi4k2bQ8CBQ5 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Pi4k2bQ8CBQ5 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Pi4k2bQ8CBQ5 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pi4k2bQ8CBQ5 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pi4k2bQ8CBQ5 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pi4k2bQ8CBQ5 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Pi4k2bQ8CBQ5 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pi4k2bQ8CBQ5 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pi4k2bQ8CBQ5 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pi4k2bQ8CBQ5 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pi4k2bQ8CBQ5 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Pi4k2bQ8CBQ5 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Pi4k2bQ8CBQ5 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Pi4k2bQ8CBQ5 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Pi4k2bQ8CBQ5 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pi4k2bQ8CBQ5 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Pi4k2bQ8CBQ5 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pi4k2bQ8CBQ5 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pi4k2bQ8CBQ5 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pi4k2bQ8CBQ5 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pi4k2bQ8CBQ5 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pi4k2bQ8CBQ5 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Pi4k2bQ8CBQ5 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pi4k2bQ8CBQ5 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Pi4k2bQ8CBQ5 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pi4k2bQ8CBQ5 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pi4k2bQ8CBQ5 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pi4k2bQ8CBQ5 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms