Protein–RNA interactions for Protein: Q80W54

Zmpste24, CAAX prenyl protease 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zmpste24Q80W54 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC38.08■■■■□ 3.69
Zmpste24Q80W54 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Zmpste24Q80W54 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Zmpste24Q80W54 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Zmpste24Q80W54 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Zmpste24Q80W54 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
Zmpste24Q80W54 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Zmpste24Q80W54 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
Zmpste24Q80W54 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
Zmpste24Q80W54 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Zmpste24Q80W54 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Zmpste24Q80W54 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Zmpste24Q80W54 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
Zmpste24Q80W54 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.89■■■□□ 2.69
Zmpste24Q80W54 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
Zmpste24Q80W54 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Zmpste24Q80W54 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Zmpste24Q80W54 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Zmpste24Q80W54 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Zmpste24Q80W54 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Zmpste24Q80W54 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Zmpste24Q80W54 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Zmpste24Q80W54 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Zmpste24Q80W54 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Zmpste24Q80W54 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Zmpste24Q80W54 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
Zmpste24Q80W54 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Zmpste24Q80W54 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Zmpste24Q80W54 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Zmpste24Q80W54 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Zmpste24Q80W54 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
Zmpste24Q80W54 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Zmpste24Q80W54 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Zmpste24Q80W54 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Zmpste24Q80W54 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Zmpste24Q80W54 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Zmpste24Q80W54 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Zmpste24Q80W54 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Zmpste24Q80W54 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Zmpste24Q80W54 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Zmpste24Q80W54 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Zmpste24Q80W54 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Zmpste24Q80W54 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Zmpste24Q80W54 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
Zmpste24Q80W54 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Zmpste24Q80W54 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Zmpste24Q80W54 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Zmpste24Q80W54 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Zmpste24Q80W54 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Zmpste24Q80W54 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Zmpste24Q80W54 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Zmpste24Q80W54 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Zmpste24Q80W54 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Zmpste24Q80W54 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Zmpste24Q80W54 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Zmpste24Q80W54 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Zmpste24Q80W54 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Zmpste24Q80W54 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Zmpste24Q80W54 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Zmpste24Q80W54 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Zmpste24Q80W54 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Zmpste24Q80W54 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Zmpste24Q80W54 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Zmpste24Q80W54 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Zmpste24Q80W54 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Zmpste24Q80W54 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Zmpste24Q80W54 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Zmpste24Q80W54 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Zmpste24Q80W54 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Zmpste24Q80W54 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Zmpste24Q80W54 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Zmpste24Q80W54 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Zmpste24Q80W54 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Zmpste24Q80W54 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Zmpste24Q80W54 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Zmpste24Q80W54 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Zmpste24Q80W54 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Zmpste24Q80W54 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Zmpste24Q80W54 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Zmpste24Q80W54 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Zmpste24Q80W54 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Zmpste24Q80W54 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Zmpste24Q80W54 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Zmpste24Q80W54 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Zmpste24Q80W54 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Zmpste24Q80W54 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Zmpste24Q80W54 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Zmpste24Q80W54 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Zmpste24Q80W54 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Zmpste24Q80W54 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Zmpste24Q80W54 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Zmpste24Q80W54 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Zmpste24Q80W54 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Zmpste24Q80W54 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Zmpste24Q80W54 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Zmpste24Q80W54 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Zmpste24Q80W54 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Zmpste24Q80W54 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Zmpste24Q80W54 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Zmpste24Q80W54 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms