Protein–RNA interactions for Protein: Q9JII2

Prl5a1, Prolactin-5A1, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prl5a1Q9JII2 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC39,37■■■■□ 3,89
Prl5a1Q9JII2 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC36,37■■■■□ 3,41
Prl5a1Q9JII2 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,81■■■■□ 3,32
Prl5a1Q9JII2 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC34,51■■■■□ 3,12
Prl5a1Q9JII2 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,49■■■■□ 3,11
Prl5a1Q9JII2 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC34,09■■■■□ 3,05
Prl5a1Q9JII2 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC33,81■■■■□ 3
Prl5a1Q9JII2 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,78■■■■□ 3
Prl5a1Q9JII2 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,38■■■□□ 2,93
Prl5a1Q9JII2 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,33■■■□□ 2,93
Prl5a1Q9JII2 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,21■■■□□ 2,91
Prl5a1Q9JII2 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32,89■■■□□ 2,86
Prl5a1Q9JII2 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC32,85■■■□□ 2,85
Prl5a1Q9JII2 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,7■■■□□ 2,83
Prl5a1Q9JII2 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,5■■■□□ 2,79
Prl5a1Q9JII2 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32,21■■■□□ 2,75
Prl5a1Q9JII2 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,17■■■□□ 2,74
Prl5a1Q9JII2 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,03■■■□□ 2,72
Prl5a1Q9JII2 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,92■■■□□ 2,7
Prl5a1Q9JII2 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31,8■■■□□ 2,68
Prl5a1Q9JII2 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31,8■■■□□ 2,68
Prl5a1Q9JII2 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,74■■■□□ 2,67
Prl5a1Q9JII2 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,74■■■□□ 2,67
Prl5a1Q9JII2 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC31,73■■■□□ 2,67
Prl5a1Q9JII2 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,71■■■□□ 2,67
Prl5a1Q9JII2 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,7■■■□□ 2,66
Prl5a1Q9JII2 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,6■■■□□ 2,65
Prl5a1Q9JII2 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC31,58■■■□□ 2,65
Prl5a1Q9JII2 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31,5■■■□□ 2,63
Prl5a1Q9JII2 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,36■■■□□ 2,61
Prl5a1Q9JII2 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31,33■■■□□ 2,61
Prl5a1Q9JII2 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,18■■■□□ 2,58
Prl5a1Q9JII2 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,17■■■□□ 2,58
Prl5a1Q9JII2 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,13■■■□□ 2,57
Prl5a1Q9JII2 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC31,06■■■□□ 2,56
Prl5a1Q9JII2 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30,94■■■□□ 2,54
Prl5a1Q9JII2 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC30,93■■■□□ 2,54
Prl5a1Q9JII2 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,84■■■□□ 2,53
Prl5a1Q9JII2 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,79■■■□□ 2,52
Prl5a1Q9JII2 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,76■■■□□ 2,51
Prl5a1Q9JII2 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,76■■■□□ 2,51
Prl5a1Q9JII2 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,58■■■□□ 2,49
Prl5a1Q9JII2 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,46■■■□□ 2,47
Prl5a1Q9JII2 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30,39■■■□□ 2,46
Prl5a1Q9JII2 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,36■■■□□ 2,45
Prl5a1Q9JII2 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,36■■■□□ 2,45
Prl5a1Q9JII2 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30,35■■■□□ 2,45
Prl5a1Q9JII2 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC30,34■■■□□ 2,45
Prl5a1Q9JII2 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC30,27■■■□□ 2,44
Prl5a1Q9JII2 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,23■■■□□ 2,43
Prl5a1Q9JII2 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30,2■■■□□ 2,42
Prl5a1Q9JII2 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC30,15■■■□□ 2,42
Prl5a1Q9JII2 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,05■■■□□ 2,4
Prl5a1Q9JII2 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC30,03■■■□□ 2,4
Prl5a1Q9JII2 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,97■■■□□ 2,39
Prl5a1Q9JII2 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29,94■■■□□ 2,38
Prl5a1Q9JII2 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC29,93■■■□□ 2,38
Prl5a1Q9JII2 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,93■■■□□ 2,38
Prl5a1Q9JII2 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29,91■■■□□ 2,38
Prl5a1Q9JII2 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,78■■■□□ 2,36
Prl5a1Q9JII2 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,74■■■□□ 2,35
Prl5a1Q9JII2 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,68■■■□□ 2,34
Prl5a1Q9JII2 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,67■■■□□ 2,34
Prl5a1Q9JII2 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,65■■■□□ 2,34
Prl5a1Q9JII2 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,64■■■□□ 2,34
Prl5a1Q9JII2 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29,62■■■□□ 2,33
Prl5a1Q9JII2 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC29,61■■■□□ 2,33
Prl5a1Q9JII2 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC29,61■■■□□ 2,33
Prl5a1Q9JII2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,6■■■□□ 2,33
Prl5a1Q9JII2 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
Prl5a1Q9JII2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,56■■■□□ 2,32
Prl5a1Q9JII2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,55■■■□□ 2,32
Prl5a1Q9JII2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29,54■■■□□ 2,32
Prl5a1Q9JII2 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,54■■■□□ 2,32
Prl5a1Q9JII2 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC29,5■■■□□ 2,31
Prl5a1Q9JII2 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
Prl5a1Q9JII2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,44■■■□□ 2,3
Prl5a1Q9JII2 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29,44■■■□□ 2,3
Prl5a1Q9JII2 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,3
Prl5a1Q9JII2 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
Prl5a1Q9JII2 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC29,33■■■□□ 2,29
Prl5a1Q9JII2 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC29,31■■■□□ 2,28
Prl5a1Q9JII2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29,3■■■□□ 2,28
Prl5a1Q9JII2 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29,29■■■□□ 2,28
Prl5a1Q9JII2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
Prl5a1Q9JII2 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
Prl5a1Q9JII2 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
Prl5a1Q9JII2 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,13■■■□□ 2,25
Prl5a1Q9JII2 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC29,12■■■□□ 2,25
Prl5a1Q9JII2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
Prl5a1Q9JII2 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC29,09■■■□□ 2,25
Prl5a1Q9JII2 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
Prl5a1Q9JII2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,07■■■□□ 2,24
Prl5a1Q9JII2 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
Prl5a1Q9JII2 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC29,03■■■□□ 2,24
Prl5a1Q9JII2 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,93■■■□□ 2,22
Prl5a1Q9JII2 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,9■■■□□ 2,22
Prl5a1Q9JII2 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28,86■■■□□ 2,21
Prl5a1Q9JII2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28,83■■■□□ 2,21
Prl5a1Q9JII2 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,9 ms