Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C1

Zmat1, Zinc finger matrin-type protein 1, mousemouse

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Length 714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zmat1Q3V0C1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34,99■■■■□ 3,19
Zmat1Q3V0C1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,35■■■□□ 2,77
Zmat1Q3V0C1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32,33■■■□□ 2,77
Zmat1Q3V0C1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,92■■■□□ 2,7
Zmat1Q3V0C1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,18■■■□□ 2,58
Zmat1Q3V0C1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,06■■■□□ 2,56
Zmat1Q3V0C1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30,62■■■□□ 2,49
Zmat1Q3V0C1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,46■■■□□ 2,47
Zmat1Q3V0C1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30,44■■■□□ 2,46
Zmat1Q3V0C1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30,28■■■□□ 2,44
Zmat1Q3V0C1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,99■■■□□ 2,39
Zmat1Q3V0C1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29,92■■■□□ 2,38
Zmat1Q3V0C1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,72■■■□□ 2,35
Zmat1Q3V0C1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,53■■■□□ 2,32
Zmat1Q3V0C1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,43■■■□□ 2,3
Zmat1Q3V0C1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
Zmat1Q3V0C1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,32■■■□□ 2,28
Zmat1Q3V0C1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29,25■■■□□ 2,27
Zmat1Q3V0C1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
Zmat1Q3V0C1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Zmat1Q3V0C1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,97■■■□□ 2,23
Zmat1Q3V0C1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,92■■■□□ 2,22
Zmat1Q3V0C1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,81■■■□□ 2,2
Zmat1Q3V0C1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,71■■■□□ 2,19
Zmat1Q3V0C1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,59■■■□□ 2,17
Zmat1Q3V0C1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
Zmat1Q3V0C1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,56■■■□□ 2,16
Zmat1Q3V0C1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28,35■■■□□ 2,13
Zmat1Q3V0C1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28,35■■■□□ 2,13
Zmat1Q3V0C1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
Zmat1Q3V0C1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28,27■■■□□ 2,12
Zmat1Q3V0C1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28,24■■■□□ 2,11
Zmat1Q3V0C1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28,24■■■□□ 2,11
Zmat1Q3V0C1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,15■■■□□ 2,1
Zmat1Q3V0C1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
Zmat1Q3V0C1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28,06■■■□□ 2,08
Zmat1Q3V0C1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,05■■■□□ 2,08
Zmat1Q3V0C1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,95■■■□□ 2,06
Zmat1Q3V0C1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,06
Zmat1Q3V0C1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
Zmat1Q3V0C1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
Zmat1Q3V0C1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,82■■■□□ 2,04
Zmat1Q3V0C1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,81■■■□□ 2,04
Zmat1Q3V0C1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,8■■■□□ 2,04
Zmat1Q3V0C1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27,75■■■□□ 2,03
Zmat1Q3V0C1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,71■■■□□ 2,03
Zmat1Q3V0C1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,71■■■□□ 2,03
Zmat1Q3V0C1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27,66■■■□□ 2,02
Zmat1Q3V0C1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,64■■■□□ 2,01
Zmat1Q3V0C1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27,61■■■□□ 2,01
Zmat1Q3V0C1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27,59■■■□□ 2,01
Zmat1Q3V0C1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2,01
Zmat1Q3V0C1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,49■■□□□ 1,99
Zmat1Q3V0C1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27,47■■□□□ 1,99
Zmat1Q3V0C1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27,4■■□□□ 1,98
Zmat1Q3V0C1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,37■■□□□ 1,97
Zmat1Q3V0C1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
Zmat1Q3V0C1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27,33■■□□□ 1,97
Zmat1Q3V0C1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
Zmat1Q3V0C1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27,27■■□□□ 1,96
Zmat1Q3V0C1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
Zmat1Q3V0C1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
Zmat1Q3V0C1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,18■■□□□ 1,94
Zmat1Q3V0C1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
Zmat1Q3V0C1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27,09■■□□□ 1,93
Zmat1Q3V0C1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,05■■□□□ 1,92
Zmat1Q3V0C1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,99■■□□□ 1,91
Zmat1Q3V0C1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Zmat1Q3V0C1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26,96■■□□□ 1,91
Zmat1Q3V0C1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
Zmat1Q3V0C1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26,88■■□□□ 1,89
Zmat1Q3V0C1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26,85■■□□□ 1,89
Zmat1Q3V0C1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26,83■■□□□ 1,89
Zmat1Q3V0C1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26,83■■□□□ 1,89
Zmat1Q3V0C1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,8■■□□□ 1,88
Zmat1Q3V0C1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26,77■■□□□ 1,88
Zmat1Q3V0C1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,71■■□□□ 1,87
Zmat1Q3V0C1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,71■■□□□ 1,87
Zmat1Q3V0C1 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26,69■■□□□ 1,86
Zmat1Q3V0C1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26,66■■□□□ 1,86
Zmat1Q3V0C1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,6■■□□□ 1,85
Zmat1Q3V0C1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,53■■□□□ 1,84
Zmat1Q3V0C1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,5■■□□□ 1,83
Zmat1Q3V0C1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26,48■■□□□ 1,83
Zmat1Q3V0C1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,46■■□□□ 1,83
Zmat1Q3V0C1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26,45■■□□□ 1,82
Zmat1Q3V0C1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,45■■□□□ 1,82
Zmat1Q3V0C1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,41■■□□□ 1,82
Zmat1Q3V0C1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,41■■□□□ 1,82
Zmat1Q3V0C1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,38■■□□□ 1,81
Zmat1Q3V0C1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,36■■□□□ 1,81
Zmat1Q3V0C1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,35■■□□□ 1,81
Zmat1Q3V0C1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26,33■■□□□ 1,81
Zmat1Q3V0C1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26,33■■□□□ 1,81
Zmat1Q3V0C1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,31■■□□□ 1,8
Zmat1Q3V0C1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,26■■□□□ 1,79
Zmat1Q3V0C1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26,25■■□□□ 1,79
Zmat1Q3V0C1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26,25■■□□□ 1,79
Zmat1Q3V0C1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,24■■□□□ 1,79
Zmat1Q3V0C1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,23■■□□□ 1,79
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