Protein–RNA interactions for Protein: O54950

Prkag1, 5'-AMP-activated protein kinase subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkag1O54950 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC38,78■■■■□ 3,8
Prkag1O54950 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC35,77■■■■□ 3,32
Prkag1O54950 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,27■■■■□ 3,24
Prkag1O54950 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,45■■■■□ 3,11
Prkag1O54950 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC34,1■■■■□ 3,05
Prkag1O54950 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,7■■■□□ 2,99
Prkag1O54950 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC33,51■■■□□ 2,95
Prkag1O54950 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC33,37■■■□□ 2,93
Prkag1O54950 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,29■■■□□ 2,92
Prkag1O54950 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,98■■■□□ 2,87
Prkag1O54950 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,7■■■□□ 2,83
Prkag1O54950 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32,45■■■□□ 2,79
Prkag1O54950 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC32,4■■■□□ 2,78
Prkag1O54950 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,39■■■□□ 2,78
Prkag1O54950 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,22■■■□□ 2,75
Prkag1O54950 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32,01■■■□□ 2,72
Prkag1O54950 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31,8■■■□□ 2,68
Prkag1O54950 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,77■■■□□ 2,68
Prkag1O54950 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,74■■■□□ 2,67
Prkag1O54950 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,64■■■□□ 2,66
Prkag1O54950 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,63■■■□□ 2,65
Prkag1O54950 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,61■■■□□ 2,65
Prkag1O54950 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,48■■■□□ 2,63
Prkag1O54950 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,45■■■□□ 2,63
Prkag1O54950 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31,41■■■□□ 2,62
Prkag1O54950 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,34■■■□□ 2,61
Prkag1O54950 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC31,3■■■□□ 2,6
Prkag1O54950 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31,25■■■□□ 2,59
Prkag1O54950 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,21■■■□□ 2,59
Prkag1O54950 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC31,04■■■□□ 2,56
Prkag1O54950 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,84■■■□□ 2,53
Prkag1O54950 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30,8■■■□□ 2,52
Prkag1O54950 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,79■■■□□ 2,52
Prkag1O54950 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30,77■■■□□ 2,52
Prkag1O54950 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,66■■■□□ 2,5
Prkag1O54950 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,65■■■□□ 2,5
Prkag1O54950 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,61■■■□□ 2,49
Prkag1O54950 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,61■■■□□ 2,49
Prkag1O54950 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,55■■■□□ 2,48
Prkag1O54950 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC30,54■■■□□ 2,48
Prkag1O54950 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC30,47■■■□□ 2,47
Prkag1O54950 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,21■■■□□ 2,43
Prkag1O54950 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30,2■■■□□ 2,42
Prkag1O54950 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,19■■■□□ 2,42
Prkag1O54950 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,16■■■□□ 2,42
Prkag1O54950 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,11■■■□□ 2,41
Prkag1O54950 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,05■■■□□ 2,4
Prkag1O54950 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,03■■■□□ 2,4
Prkag1O54950 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29,99■■■□□ 2,39
Prkag1O54950 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29,93■■■□□ 2,38
Prkag1O54950 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29,92■■■□□ 2,38
Prkag1O54950 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29,9■■■□□ 2,38
Prkag1O54950 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,89■■■□□ 2,37
Prkag1O54950 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,81■■■□□ 2,36
Prkag1O54950 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29,79■■■□□ 2,36
Prkag1O54950 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC29,67■■■□□ 2,34
Prkag1O54950 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,67■■■□□ 2,34
Prkag1O54950 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29,64■■■□□ 2,34
Prkag1O54950 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,62■■■□□ 2,33
Prkag1O54950 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,59■■■□□ 2,33
Prkag1O54950 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC29,59■■■□□ 2,33
Prkag1O54950 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29,57■■■□□ 2,32
Prkag1O54950 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC29,54■■■□□ 2,32
Prkag1O54950 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,49■■■□□ 2,31
Prkag1O54950 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,48■■■□□ 2,31
Prkag1O54950 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,46■■■□□ 2,31
Prkag1O54950 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,44■■■□□ 2,3
Prkag1O54950 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,44■■■□□ 2,3
Prkag1O54950 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,43■■■□□ 2,3
Prkag1O54950 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
Prkag1O54950 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
Prkag1O54950 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29,36■■■□□ 2,29
Prkag1O54950 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,28■■■□□ 2,28
Prkag1O54950 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
Prkag1O54950 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC29,22■■■□□ 2,27
Prkag1O54950 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29,19■■■□□ 2,26
Prkag1O54950 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,15■■■□□ 2,26
Prkag1O54950 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC29,13■■■□□ 2,25
Prkag1O54950 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29,13■■■□□ 2,25
Prkag1O54950 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29,12■■■□□ 2,25
Prkag1O54950 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
Prkag1O54950 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC29,1■■■□□ 2,25
Prkag1O54950 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,24
Prkag1O54950 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
Prkag1O54950 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,22
Prkag1O54950 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28,91■■■□□ 2,22
Prkag1O54950 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28,85■■■□□ 2,21
Prkag1O54950 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,84■■■□□ 2,21
Prkag1O54950 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,83■■■□□ 2,21
Prkag1O54950 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28,79■■■□□ 2,2
Prkag1O54950 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28,78■■■□□ 2,2
Prkag1O54950 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28,76■■■□□ 2,19
Prkag1O54950 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,71■■■□□ 2,19
Prkag1O54950 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28,7■■■□□ 2,18
Prkag1O54950 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,67■■■□□ 2,18
Prkag1O54950 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,66■■■□□ 2,18
Prkag1O54950 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28,59■■■□□ 2,17
Prkag1O54950 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,59■■■□□ 2,17
Prkag1O54950 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,58■■■□□ 2,17
Prkag1O54950 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,2 ms