Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUQ2

Preb, Prolactin regulatory element-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrebQ9WUQ2 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC40.07■■■■■ 4.01
PrebQ9WUQ2 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
PrebQ9WUQ2 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
PrebQ9WUQ2 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
PrebQ9WUQ2 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
PrebQ9WUQ2 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
PrebQ9WUQ2 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
PrebQ9WUQ2 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
PrebQ9WUQ2 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
PrebQ9WUQ2 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
PrebQ9WUQ2 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
PrebQ9WUQ2 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
PrebQ9WUQ2 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
PrebQ9WUQ2 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
PrebQ9WUQ2 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
PrebQ9WUQ2 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PrebQ9WUQ2 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC32.35■■■□□ 2.77
PrebQ9WUQ2 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
PrebQ9WUQ2 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
PrebQ9WUQ2 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
PrebQ9WUQ2 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
PrebQ9WUQ2 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
PrebQ9WUQ2 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
PrebQ9WUQ2 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
PrebQ9WUQ2 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
PrebQ9WUQ2 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
PrebQ9WUQ2 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
PrebQ9WUQ2 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
PrebQ9WUQ2 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
PrebQ9WUQ2 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
PrebQ9WUQ2 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
PrebQ9WUQ2 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
PrebQ9WUQ2 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
PrebQ9WUQ2 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PrebQ9WUQ2 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PrebQ9WUQ2 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
PrebQ9WUQ2 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PrebQ9WUQ2 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
PrebQ9WUQ2 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
PrebQ9WUQ2 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PrebQ9WUQ2 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PrebQ9WUQ2 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PrebQ9WUQ2 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PrebQ9WUQ2 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
PrebQ9WUQ2 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
PrebQ9WUQ2 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
PrebQ9WUQ2 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
PrebQ9WUQ2 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PrebQ9WUQ2 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PrebQ9WUQ2 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PrebQ9WUQ2 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
PrebQ9WUQ2 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PrebQ9WUQ2 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
PrebQ9WUQ2 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PrebQ9WUQ2 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PrebQ9WUQ2 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PrebQ9WUQ2 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PrebQ9WUQ2 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PrebQ9WUQ2 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PrebQ9WUQ2 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
PrebQ9WUQ2 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PrebQ9WUQ2 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PrebQ9WUQ2 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PrebQ9WUQ2 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PrebQ9WUQ2 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PrebQ9WUQ2 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PrebQ9WUQ2 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PrebQ9WUQ2 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
PrebQ9WUQ2 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PrebQ9WUQ2 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PrebQ9WUQ2 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PrebQ9WUQ2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PrebQ9WUQ2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PrebQ9WUQ2 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PrebQ9WUQ2 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PrebQ9WUQ2 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PrebQ9WUQ2 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PrebQ9WUQ2 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PrebQ9WUQ2 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PrebQ9WUQ2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PrebQ9WUQ2 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PrebQ9WUQ2 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PrebQ9WUQ2 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
PrebQ9WUQ2 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
PrebQ9WUQ2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PrebQ9WUQ2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PrebQ9WUQ2 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PrebQ9WUQ2 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PrebQ9WUQ2 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PrebQ9WUQ2 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PrebQ9WUQ2 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PrebQ9WUQ2 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PrebQ9WUQ2 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PrebQ9WUQ2 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
PrebQ9WUQ2 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PrebQ9WUQ2 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PrebQ9WUQ2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
PrebQ9WUQ2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PrebQ9WUQ2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PrebQ9WUQ2 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 154.8 ms