Protein–RNA interactions for Protein: Q61425

Hadh, Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HadhQ61425 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36.76■■■■□ 3.48
HadhQ61425 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
HadhQ61425 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
HadhQ61425 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
HadhQ61425 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
HadhQ61425 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
HadhQ61425 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
HadhQ61425 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32■■■□□ 2.71
HadhQ61425 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
HadhQ61425 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
HadhQ61425 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
HadhQ61425 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
HadhQ61425 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
HadhQ61425 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
HadhQ61425 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
HadhQ61425 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
HadhQ61425 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
HadhQ61425 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
HadhQ61425 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
HadhQ61425 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
HadhQ61425 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
HadhQ61425 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
HadhQ61425 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
HadhQ61425 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
HadhQ61425 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
HadhQ61425 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
HadhQ61425 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
HadhQ61425 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
HadhQ61425 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
HadhQ61425 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
HadhQ61425 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
HadhQ61425 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
HadhQ61425 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
HadhQ61425 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
HadhQ61425 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
HadhQ61425 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
HadhQ61425 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
HadhQ61425 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
HadhQ61425 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
HadhQ61425 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
HadhQ61425 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
HadhQ61425 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
HadhQ61425 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
HadhQ61425 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
HadhQ61425 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
HadhQ61425 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
HadhQ61425 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
HadhQ61425 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
HadhQ61425 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
HadhQ61425 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HadhQ61425 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
HadhQ61425 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
HadhQ61425 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
HadhQ61425 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
HadhQ61425 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
HadhQ61425 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
HadhQ61425 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HadhQ61425 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HadhQ61425 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
HadhQ61425 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
HadhQ61425 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
HadhQ61425 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
HadhQ61425 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
HadhQ61425 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
HadhQ61425 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
HadhQ61425 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HadhQ61425 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HadhQ61425 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
HadhQ61425 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
HadhQ61425 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
HadhQ61425 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
HadhQ61425 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
HadhQ61425 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
HadhQ61425 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HadhQ61425 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HadhQ61425 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HadhQ61425 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HadhQ61425 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HadhQ61425 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HadhQ61425 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
HadhQ61425 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
HadhQ61425 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
HadhQ61425 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HadhQ61425 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HadhQ61425 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HadhQ61425 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HadhQ61425 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HadhQ61425 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HadhQ61425 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HadhQ61425 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HadhQ61425 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HadhQ61425 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HadhQ61425 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HadhQ61425 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
HadhQ61425 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HadhQ61425 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HadhQ61425 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HadhQ61425 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HadhQ61425 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HadhQ61425 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms