RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	CRY1	Q16526	586 aa		18.15	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	SMU1	Q2TAY7	513 aa		18.15	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	SLC8B1	Q6J4K2	584 aa		18.15	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	CXorf57	Q6NSI4	855 aa	Known RBP	18.15	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	PDPR	Q8NCN5	879 aa		18.15	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	OR8J3	Q8NGG0	315 aa		18.15	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	MAGEE2	Q8TD90	523 aa	Predicted RBP	18.15	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	GAB3	Q8WWW8	586 aa		18.15	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	LZIC	Q8WZA0	190 aa		18.15	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	RNF145	Q96MT1	663 aa		18.15	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	CDK15	Q96Q40	435 aa		18.15	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	CGREF1	Q99674	301 aa		18.15	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	CLPB	Q9H078	707 aa		18.15	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	SEC24D	O94855	1032 aa	Predicted RBP	18.14	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	G6PD	P11413	515 aa		18.14	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	SELP	P16109	830 aa		18.14	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	HMOX2	P30519	316 aa		18.14	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	SGSH	P51688	502 aa		18.14	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	MAD2L1	Q13257	205 aa	Predicted RBP	18.14	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	AP5B1	Q2VPB7	878 aa		18.14	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	FAM98B	Q52LJ0	330 aa	Known RBP	18.14	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	PTRHD1	Q6GMV3	140 aa	Known RBP	18.14	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	SBSN	Q6UWP8	590 aa		18.14	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	CLVS1	Q8IUQ0	354 aa	Predicted RBP	18.14	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	DRAXIN	Q8NBI3	349 aa	Predicted RBP	18.14	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF420	Q8TAQ5	688 aa	Predicted RBP	18.14	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	VPS50	Q96JG6	964 aa		18.14	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	ZBTB18	Q99592	522 aa		18.14	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	SEPHS2	Q99611	448 aa		18.14	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	C19orf43	Q9BQ61	176 aa		18.14	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	TSEN34	Q9BSV6	310 aa	Known RBP	18.14	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	THSD7B	Q9C0I4	1608 aa		18.14	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	FFAR2	O15552	330 aa		18.14	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	FZD6	O60353	706 aa		18.14	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	GLUD1	P00367	558 aa		18.14	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	RAP2A	P10114	183 aa		18.14	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	RPS3	P23396	243 aa	Known RBP eCLIP	18.14	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	OR4D2	P58180	307 aa		18.14	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	DHRS4L2	Q6PKH6	230 aa		18.14	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	PRSS55	Q6UWB4	352 aa	Predicted RBP	18.14	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	USP51	Q70EK9	711 aa		18.14	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	FKBP9P1	Q75LS8	142 aa		18.14	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	C16orf59	Q7L2K0	433 aa		18.14	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	RIMKLA	Q8IXN7	391 aa		18.14	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	LRRC43	Q8N309	656 aa		18.14	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	DCBLD1	Q8N8Z6	715 aa		18.14	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	SLC43A3	Q8NBI5	491 aa		18.14	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	OR4F6	Q8NGB9	312 aa		18.14	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	ISOC1	Q96CN7	298 aa		18.14	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	FBXL20	Q96IG2	436 aa		18.14	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	IPPK	Q9H8X2	491 aa		18.14	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	GNPTG	Q9UJJ9	305 aa		18.14	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	PCDHB9	Q9Y5E1	797 aa		18.14	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	OR7A17	O14581	309 aa		18.13	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	TSPAN3	O60637	253 aa		18.13	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	KCNH1	O95259	989 aa		18.13	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	CD160	O95971	181 aa		18.13	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	ALB	P02768	609 aa		18.13	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	ANXA6	P08133	673 aa		18.13	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	RHOA	P61586	193 aa		18.13	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	HABP4	Q5JVS0	413 aa	Known RBP	18.13	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	TAS1R1	Q7RTX1	841 aa		18.13	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	MILR1	Q7Z6M3	343 aa		18.13	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	NPAS4	Q8IUM7	802 aa		18.13	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	ITFG1	Q8TB96	612 aa		18.13	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	CCDC115	Q96NT0	180 aa		18.13	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	GKN1	Q9NS71	199 aa		18.13	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	LHX3	Q9UBR4	397 aa		18.13	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	EIF3L	Q9Y262	564 aa	Known RBP	18.13	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	IQCF5	A8MTL0	148 aa		18.13	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	NT5C1B-RDH14	C9J2C7	533 aa		18.13	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	ANKRD28	O15084	1053 aa		18.13	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	RGS14	O43566	566 aa		18.13	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	VARS	P26640	1264 aa	Known RBP	18.13	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	GATM	P50440	423 aa		18.13	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	ADARB1	P78563	741 aa	Known RBP	18.13	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	CCNYL2	Q5T2Q4	361 aa		18.13	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	METTL2B	Q6P1Q9	378 aa	Known RBP	18.13	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	LINGO4	Q6UY18	593 aa		18.13	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	RNF165	Q6ZSG1	346 aa		18.13	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	GPR180	Q86V85	440 aa		18.13	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	RBFA	Q8N0V3	343 aa		18.13	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	PPM1M	Q96MI6	270 aa		18.13	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	NPL	Q9BXD5	320 aa	Predicted RBP	18.13	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	FAM126A	Q9BYI3	521 aa	Predicted RBP	18.13	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	CIPC	Q9C0C6	399 aa		18.13	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	HIPK3	Q9H422	1215 aa		18.13	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	ACTL8	Q9H568	366 aa		18.13	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	MTRR	Q9UBK8	725 aa		18.13	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	AP3M1	Q9Y2T2	418 aa		18.13	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559		H0Y626	953 aa		18.12	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	PRSS23	O95084	383 aa		18.12	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	ALDH1A1	P00352	501 aa		18.12	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	DGKA	P23743	735 aa		18.12	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	RPL10	P27635	214 aa	Known RBP	18.12	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	HTR6	P50406	440 aa		18.12	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	AP1S1	P61966	158 aa		18.12	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	CHRNB3	Q05901	458 aa		18.12	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	TRAF3	Q13114	568 aa		18.12	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	ARMC12	Q5T9G4	340 aa		18.12	■□□□□ 0.49

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.2 ms