RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285679.10

USP25-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 3,973 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-201ENST00000285679 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 NUAK2Q9H093 628 aa15.12■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 CRTAC1Q9NQ79 661 aa15.12■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 GDAP2Q9NXN4 497 aa15.12■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 CDH1P12830 882 aa15.12■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 FSHRP23945 695 aa15.12■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 HTR1BP28222 390 aa15.12■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 NUDT6P53370 316 aa15.12■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 SPPL2AQ8TCT8 520 aa15.12■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 IL12RB2Q99665 862 aa15.12■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP15.12■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 TMED5Q9Y3A6 229 aa15.12■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 A0A0U1RQS6 177 aa15.11■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 ELOVL7A1L3X0 281 aa15.11■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 MEIS3P2A8K0S8 358 aa15.11■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 E9PAM4 449 aa15.11■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 AQP9O43315 295 aa15.11■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 SEMG2Q02383 582 aa15.11■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 ZNF621Q6ZSS3 439 aa15.11■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 HIPK1Q86Z02 1210 aa15.11■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 SETD9Q8NE22 299 aa15.11■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 SLC9A7Q96T83 725 aa15.11■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 APOL4Q9BPW4 351 aa15.11■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 EFCAB9A8MZ26 197 aa15.11■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 VPS4BO75351 444 aa15.11■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 HSD17B1P14061 328 aa15.11■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 INPP1P49441 399 aa15.11■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 BEX3Q00994 111 aa15.11■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP15.11■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP15.11■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 TAB1Q15750 504 aa15.11■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 KCTD11Q693B1 232 aa15.11■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 OTULINQ96BN8 352 aa15.11■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 GPR63Q9BZJ6 419 aa15.11■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 FAM118AQ9NWS6 357 aa15.11■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP15.11■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 SLC12A8A0AV02 714 aa15.11■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 C2orf81A6NN90 581 aa15.11■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 CBX4O00257 560 aa15.11■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 HSPA7P48741 367 aa15.11■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP15.11■□□□□ 0.011e-9■■■■■ 33.5
USP25-201ENST00000285679 GPR153Q6NV75 609 aa15.11■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa15.11■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 OR52B6Q8NGF0 335 aa15.11■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP15.11■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 NSMCE3Q96MG7 304 aa15.11■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 GMIPQ9P107 970 aa15.11■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 PRKAB1Q9Y478 270 aa15.11■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP15.11■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 RGS10O43665 173 aa15.1■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 AIREO43918 545 aa15.1■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 ZNF24P17028 368 aa15.1■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 SELPLGQ14242 412 aa15.1■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP15.1■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 C14orf80Q86SX3 495 aa15.1■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa15.1■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 PIK3C3Q8NEB9 887 aa15.1■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 OR13F1Q8NGS4 319 aa15.1■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 NTAN1Q96AB6 310 aa15.1■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 URB1O60287 2271 aaKnown RBP15.1■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 CXCR6O00574 342 aa15.1■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 GJB3O75712 270 aa15.1■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 TCF3P15923 654 aa15.1■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 ARNTP27540 789 aa15.1■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 TBX4P57082 545 aa15.1■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 SIRPB2Q5JXA9 342 aa15.1■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 ARMC8Q8IUR7 673 aa15.1■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 TTC30BQ8N4P2 665 aa15.1■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 SVOPQ8N4V2 548 aa15.1■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 C17orf50Q8WW18 174 aa15.1■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 ALPK1Q96QP1 1244 aa15.1■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 SH3GL1Q99961 368 aa15.1■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 DCSTAMPQ9H295 470 aa15.1■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 BTBD3Q9Y2F9 522 aa15.1■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 TBX18O95935 607 aa15.1■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 TGFBR1P36897 503 aa15.1■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 GDF5P43026 501 aa15.1■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP15.1■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 OVOS1Q6IE37 1185 aa15.1■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 UGT3A1Q6NUS8 523 aa15.1■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 CYP20A1Q6UW02 462 aa15.1■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 SPATA19Q7Z5L4 167 aa15.1■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 TMEM151AQ8N4L1 468 aa15.1■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 OR52J3Q8NH60 311 aa15.1■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 STARD8Q92502 1023 aa15.1■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa15.1■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP15.1■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 RNF38Q9H0F5 515 aa15.1■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 SLC25A51Q9H1U9 297 aa15.1■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 KRT84Q9NSB2 600 aa15.1■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 DNAJB9Q9UBS3 223 aa15.1■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 I6L893 689 aaPredicted RBP15.09■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP15.09■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 SLC1A7O00341 560 aa15.09■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 NBNO60934 754 aa15.09■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 MLYCDO95822 493 aa15.09■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 COL6A1P12109 1028 aa15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.8 ms