RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000047793.5

Hoxd1-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd1, Length 1,862 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Man1a1P45700 655 aa20.46■□□□□ 0.87
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Aff3P51827 1254 aa20.46■□□□□ 0.87
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Pip5k1bP70181 539 aa20.46■□□□□ 0.87
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Jmjd8Q3TA59 316 aa20.46■□□□□ 0.87
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Dll1Q61483 722 aa20.46■□□□□ 0.87
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ddx51Q6P9R1 639 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Amigo1Q80ZD8 492 aa20.46■□□□□ 0.87
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 FgbQ8K0E8 481 aa20.46■□□□□ 0.87
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Capn8Q91VA3 703 aa20.46■□□□□ 0.87
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 St7Q99M96 577 aa20.46■□□□□ 0.87
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ifi44lQ9BDB7 447 aa20.46■□□□□ 0.87
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Spg21Q9CQC8 308 aa20.46■□□□□ 0.87
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 AasdhpptQ9CQF6 309 aa20.46■□□□□ 0.87
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cmtm6Q9CZ69 183 aa20.46■□□□□ 0.87
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cndp2Q9D1A2 475 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Snrnp48Q9D361 337 aa20.46■□□□□ 0.87
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Vmn2r65G3X931 845 aa20.45■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Vmn2r86G5E8Y4 848 aa20.45■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm6614M0QWR8 670 aa20.45■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Orm2P07361 207 aa20.45■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Slc19a1P41438 512 aa20.45■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Lman2lP59481 347 aa20.45■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cyp2c65Q148B1 490 aa20.45■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Fam71bQ5STT6 665 aa20.45■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ei24Q61070 340 aa20.45■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cyp4b1Q64462 511 aa20.45■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ubtd2Q6PGH0 234 aa20.45■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 BroxQ8K2Q7 411 aa20.45■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Txndc11Q8K2W3 948 aa20.45■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 BfarQ8R079 450 aa20.45■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 VitQ8VHI5 650 aa20.45■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Glod4Q9CPV4 298 aa20.45■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 PudpQ9D5U5 234 aa20.45■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 PgcQ9D7R7 392 aa20.45■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Wdr12Q9JJA4 423 aa20.45■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Adam23Q9R1V7 829 aa20.45■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm6370A0A0G2JGX9 315 aa20.45■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ankrd34aB2RW11 495 aa20.45■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm5930D3Z257 264 aa20.45■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm6309L7N481 315 aa20.45■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Kcnk4O88454 398 aa20.45■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cbx3P23198 183 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Wdr5P61965 334 aa20.45■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 AurkaP97477 395 aa20.45■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Fam109bQ14B98 259 aa20.45■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 HiraQ61666 1015 aa20.45■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ifit3Q64345 403 aa20.45■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Rbl1Q64701 1063 aa20.45■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Galnt10Q6P9S7 603 aa20.45■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Nod1Q8BHB0 953 aa20.45■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Dlgap2Q8BJ42 1059 aa20.45■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ifi44Q8BV66 422 aa20.45■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Angptl7Q8R1Q3 337 aa20.45■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gmpr2Q99L27 348 aa20.45■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Atoh8Q99NA2 322 aa20.45■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Anks3Q9CZK6 655 aa20.45■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ppil6Q9D6D8 278 aa20.45■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Q9DAD0 168 aa20.45■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tor1bQ9ER41 336 aa20.45■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Actl7aQ9QY84 440 aa20.45■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Vwa8Q8CC88 1905 aa20.44■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 L3mbtl1A2A5N8 826 aa20.44■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Mapkapk2P49138 386 aa20.44■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 TgfbiP82198 683 aa20.44■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Nfatc3P97305 1075 aa20.44■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 ItkQ03526 625 aa20.44■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Xrra1Q3U3V8 786 aa20.44■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Lrrc47Q505F5 581 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 AtminQ6P9S1 818 aa20.44■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Clec7aQ6QLQ4 244 aa20.44■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Smpd4Q6ZPR5 823 aa20.44■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Rps27lQ6ZWY3 84 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Dnajc15Q78YY6 149 aa20.44■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ppp1r1cQ8BKK4 108 aa20.44■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 UnkQ8BL48 810 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gpr21Q8BX79 349 aa20.44■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Acad9Q8JZN5 625 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Vmn1r188Q8K3N2 308 aa20.44■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Olfr854Q8VFF1 315 aa20.44■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Oas1dQ8VI95 361 aa20.44■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Rsph1Q8VIG3 301 aa20.44■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Q9CXL3 195 aa20.44■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Dcdc2cQ9D1B8 347 aa20.44■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Dnaaf1Q9D2H9 634 aa20.44■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cnbd2Q9D5U8 673 aa20.44■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Slc39a5Q9D856 535 aa20.44■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Thap11Q9JJD0 305 aa20.44■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1810010D01RikA0A1L1SR87 51 aa20.43■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ccdc120A2AEV7 629 aa20.43■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Nhsl2B1AXH1 854 aa20.43■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 TertO70372 1122 aa20.43■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cyp17a1P27786 507 aa20.43■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 InaP46660 501 aa20.43■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 PrkcgP63318 697 aa20.43■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Slc45a4Q0P5V9 785 aa20.43■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 IqcmQ149I8 489 aa20.43■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Bhlha9Q5RJB0 231 aa20.43■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Caprin1Q60865 707 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 TCAIMQ66JZ4 499 aa20.43■□□□□ 0.86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Taf1cQ6PDZ2 836 aa20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 36.7 ms