Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC88

Vwa8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, mousemouse

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Length 1,905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa8Q8CC88 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC40,59■■■■■ 4,09
Vwa8Q8CC88 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC37,73■■■■□ 3,63
Vwa8Q8CC88 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,87■■■■□ 3,49
Vwa8Q8CC88 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC35,38■■■■□ 3,25
Vwa8Q8CC88 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC35,38■■■■□ 3,25
Vwa8Q8CC88 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC34,83■■■■□ 3,17
Vwa8Q8CC88 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,44■■■■□ 3,1
Vwa8Q8CC88 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,35■■■■□ 3,09
Vwa8Q8CC88 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,34■■■■□ 3,09
Vwa8Q8CC88 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33,98■■■■□ 3,03
Vwa8Q8CC88 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,9■■■■□ 3,02
Vwa8Q8CC88 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC33,79■■■■□ 3
Vwa8Q8CC88 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,74■■■□□ 2,99
Vwa8Q8CC88 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,26■■■□□ 2,91
Vwa8Q8CC88 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC32,94■■■□□ 2,86
Vwa8Q8CC88 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,89■■■□□ 2,85
Vwa8Q8CC88 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,69■■■□□ 2,82
Vwa8Q8CC88 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC32,63■■■□□ 2,81
Vwa8Q8CC88 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32,61■■■□□ 2,81
Vwa8Q8CC88 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,51■■■□□ 2,79
Vwa8Q8CC88 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC32,5■■■□□ 2,79
Vwa8Q8CC88 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32,43■■■□□ 2,78
Vwa8Q8CC88 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,4■■■□□ 2,78
Vwa8Q8CC88 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,31■■■□□ 2,76
Vwa8Q8CC88 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,3■■■□□ 2,76
Vwa8Q8CC88 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32,21■■■□□ 2,75
Vwa8Q8CC88 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,17■■■□□ 2,74
Vwa8Q8CC88 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,1■■■□□ 2,73
Vwa8Q8CC88 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,08■■■□□ 2,73
Vwa8Q8CC88 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC32,08■■■□□ 2,73
Vwa8Q8CC88 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC32,03■■■□□ 2,72
Vwa8Q8CC88 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,02■■■□□ 2,72
Vwa8Q8CC88 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC32,01■■■□□ 2,71
Vwa8Q8CC88 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,94■■■□□ 2,7
Vwa8Q8CC88 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,84■■■□□ 2,69
Vwa8Q8CC88 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31,83■■■□□ 2,69
Vwa8Q8CC88 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,7■■■□□ 2,67
Vwa8Q8CC88 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31,41■■■□□ 2,62
Vwa8Q8CC88 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31,35■■■□□ 2,61
Vwa8Q8CC88 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC31,29■■■□□ 2,6
Vwa8Q8CC88 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC31,2■■■□□ 2,58
Vwa8Q8CC88 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,07■■■□□ 2,56
Vwa8Q8CC88 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC31,02■■■□□ 2,56
Vwa8Q8CC88 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2,55
Vwa8Q8CC88 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,97■■■□□ 2,55
Vwa8Q8CC88 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30,97■■■□□ 2,55
Vwa8Q8CC88 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,89■■■□□ 2,54
Vwa8Q8CC88 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC30,8■■■□□ 2,52
Vwa8Q8CC88 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30,75■■■□□ 2,51
Vwa8Q8CC88 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,74■■■□□ 2,51
Vwa8Q8CC88 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,68■■■□□ 2,5
Vwa8Q8CC88 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,68■■■□□ 2,5
Vwa8Q8CC88 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,65■■■□□ 2,5
Vwa8Q8CC88 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,65■■■□□ 2,5
Vwa8Q8CC88 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC30,57■■■□□ 2,48
Vwa8Q8CC88 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC30,54■■■□□ 2,48
Vwa8Q8CC88 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30,5■■■□□ 2,47
Vwa8Q8CC88 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC30,41■■■□□ 2,46
Vwa8Q8CC88 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,41■■■□□ 2,46
Vwa8Q8CC88 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,31■■■□□ 2,44
Vwa8Q8CC88 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC30,31■■■□□ 2,44
Vwa8Q8CC88 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30,3■■■□□ 2,44
Vwa8Q8CC88 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30,29■■■□□ 2,44
Vwa8Q8CC88 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC30,27■■■□□ 2,44
Vwa8Q8CC88 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30,22■■■□□ 2,43
Vwa8Q8CC88 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,21■■■□□ 2,43
Vwa8Q8CC88 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,21■■■□□ 2,43
Vwa8Q8CC88 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC30,2■■■□□ 2,42
Vwa8Q8CC88 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC30,18■■■□□ 2,42
Vwa8Q8CC88 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC30,16■■■□□ 2,42
Vwa8Q8CC88 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,14■■■□□ 2,42
Vwa8Q8CC88 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC30,13■■■□□ 2,41
Vwa8Q8CC88 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,04■■■□□ 2,4
Vwa8Q8CC88 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC30,02■■■□□ 2,4
Vwa8Q8CC88 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2,39
Vwa8Q8CC88 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,95■■■□□ 2,38
Vwa8Q8CC88 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC29,94■■■□□ 2,38
Vwa8Q8CC88 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC29,94■■■□□ 2,38
Vwa8Q8CC88 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,91■■■□□ 2,38
Vwa8Q8CC88 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,9■■■□□ 2,38
Vwa8Q8CC88 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,85■■■□□ 2,37
Vwa8Q8CC88 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,83■■■□□ 2,37
Vwa8Q8CC88 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29,8■■■□□ 2,36
Vwa8Q8CC88 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC29,79■■■□□ 2,36
Vwa8Q8CC88 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,78■■■□□ 2,36
Vwa8Q8CC88 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,75■■■□□ 2,35
Vwa8Q8CC88 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,74■■■□□ 2,35
Vwa8Q8CC88 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,7■■■□□ 2,35
Vwa8Q8CC88 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,7■■■□□ 2,34
Vwa8Q8CC88 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC29,65■■■□□ 2,34
Vwa8Q8CC88 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29,65■■■□□ 2,34
Vwa8Q8CC88 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29,64■■■□□ 2,33
Vwa8Q8CC88 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,63■■■□□ 2,33
Vwa8Q8CC88 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC29,63■■■□□ 2,33
Vwa8Q8CC88 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,62■■■□□ 2,33
Vwa8Q8CC88 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
Vwa8Q8CC88 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC29,61■■■□□ 2,33
Vwa8Q8CC88 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,58■■■□□ 2,33
Vwa8Q8CC88 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,58■■■□□ 2,33
Vwa8Q8CC88 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29,57■■■□□ 2,32
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