Protein–RNA interactions for Protein: Q03526

Itk, Tyrosine-protein kinase ITK/TSK, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItkQ03526 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37,6■■■■□ 3,61
ItkQ03526 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34,58■■■■□ 3,13
ItkQ03526 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,51■■■■□ 3,12
ItkQ03526 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,19■■■■□ 3,06
ItkQ03526 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,65■■■□□ 2,98
ItkQ03526 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,35■■■□□ 2,93
ItkQ03526 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33,26■■■□□ 2,91
ItkQ03526 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32,55■■■□□ 2,8
ItkQ03526 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32,35■■■□□ 2,77
ItkQ03526 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,27■■■□□ 2,76
ItkQ03526 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,18■■■□□ 2,74
ItkQ03526 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31,97■■■□□ 2,71
ItkQ03526 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31,7■■■□□ 2,67
ItkQ03526 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,69■■■□□ 2,66
ItkQ03526 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,6■■■□□ 2,65
ItkQ03526 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,51■■■□□ 2,64
ItkQ03526 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31,5■■■□□ 2,63
ItkQ03526 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31,47■■■□□ 2,63
ItkQ03526 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,27■■■□□ 2,6
ItkQ03526 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,25■■■□□ 2,59
ItkQ03526 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,18■■■□□ 2,58
ItkQ03526 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,06■■■□□ 2,56
ItkQ03526 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,05■■■□□ 2,56
ItkQ03526 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,02■■■□□ 2,56
ItkQ03526 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,98■■■□□ 2,55
ItkQ03526 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,95■■■□□ 2,54
ItkQ03526 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,88■■■□□ 2,53
ItkQ03526 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30,85■■■□□ 2,53
ItkQ03526 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,84■■■□□ 2,53
ItkQ03526 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30,64■■■□□ 2,5
ItkQ03526 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,64■■■□□ 2,49
ItkQ03526 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30,6■■■□□ 2,49
ItkQ03526 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30,51■■■□□ 2,47
ItkQ03526 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,43■■■□□ 2,46
ItkQ03526 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,42■■■□□ 2,46
ItkQ03526 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,2■■■□□ 2,42
ItkQ03526 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,15■■■□□ 2,42
ItkQ03526 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,15■■■□□ 2,42
ItkQ03526 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,01■■■□□ 2,39
ItkQ03526 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29,97■■■□□ 2,39
ItkQ03526 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29,96■■■□□ 2,39
ItkQ03526 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
ItkQ03526 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,71■■■□□ 2,35
ItkQ03526 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,7■■■□□ 2,35
ItkQ03526 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,69■■■□□ 2,34
ItkQ03526 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29,68■■■□□ 2,34
ItkQ03526 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,65■■■□□ 2,34
ItkQ03526 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29,59■■■□□ 2,33
ItkQ03526 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29,56■■■□□ 2,32
ItkQ03526 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29,54■■■□□ 2,32
ItkQ03526 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,53■■■□□ 2,32
ItkQ03526 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29,5■■■□□ 2,31
ItkQ03526 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,49■■■□□ 2,31
ItkQ03526 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
ItkQ03526 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,44■■■□□ 2,3
ItkQ03526 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,43■■■□□ 2,3
ItkQ03526 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,29
ItkQ03526 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
ItkQ03526 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
ItkQ03526 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29,21■■■□□ 2,27
ItkQ03526 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,14■■■□□ 2,26
ItkQ03526 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29,13■■■□□ 2,25
ItkQ03526 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29,11■■■□□ 2,25
ItkQ03526 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,08■■■□□ 2,25
ItkQ03526 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29,06■■■□□ 2,24
ItkQ03526 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29,05■■■□□ 2,24
ItkQ03526 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29,04■■■□□ 2,24
ItkQ03526 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
ItkQ03526 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,23
ItkQ03526 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2,23
ItkQ03526 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
ItkQ03526 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28,97■■■□□ 2,23
ItkQ03526 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28,91■■■□□ 2,22
ItkQ03526 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,87■■■□□ 2,21
ItkQ03526 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,87■■■□□ 2,21
ItkQ03526 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,87■■■□□ 2,21
ItkQ03526 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28,75■■■□□ 2,19
ItkQ03526 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28,7■■■□□ 2,18
ItkQ03526 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28,68■■■□□ 2,18
ItkQ03526 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,65■■■□□ 2,18
ItkQ03526 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28,57■■■□□ 2,16
ItkQ03526 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,56■■■□□ 2,16
ItkQ03526 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28,53■■■□□ 2,16
ItkQ03526 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,15
ItkQ03526 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
ItkQ03526 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
ItkQ03526 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28,42■■■□□ 2,14
ItkQ03526 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,42■■■□□ 2,14
ItkQ03526 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
ItkQ03526 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
ItkQ03526 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
ItkQ03526 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
ItkQ03526 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,31■■■□□ 2,12
ItkQ03526 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
ItkQ03526 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28,28■■■□□ 2,12
ItkQ03526 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
ItkQ03526 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,2■■■□□ 2,1
ItkQ03526 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28,19■■■□□ 2,1
ItkQ03526 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
ItkQ03526 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28,16■■■□□ 2,1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21,4 ms