Protein–RNA interactions for Protein: Q03526

Itk, Tyrosine-protein kinase ITK/TSK, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItkQ03526 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37.6■■■■□ 3.61
ItkQ03526 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
ItkQ03526 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
ItkQ03526 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
ItkQ03526 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
ItkQ03526 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
ItkQ03526 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
ItkQ03526 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
ItkQ03526 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
ItkQ03526 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
ItkQ03526 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
ItkQ03526 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
ItkQ03526 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
ItkQ03526 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
ItkQ03526 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
ItkQ03526 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
ItkQ03526 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
ItkQ03526 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
ItkQ03526 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
ItkQ03526 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
ItkQ03526 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
ItkQ03526 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
ItkQ03526 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
ItkQ03526 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
ItkQ03526 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ItkQ03526 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
ItkQ03526 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
ItkQ03526 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
ItkQ03526 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
ItkQ03526 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.64■■■□□ 2.5
ItkQ03526 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
ItkQ03526 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
ItkQ03526 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
ItkQ03526 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
ItkQ03526 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
ItkQ03526 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
ItkQ03526 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ItkQ03526 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ItkQ03526 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ItkQ03526 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ItkQ03526 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ItkQ03526 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ItkQ03526 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ItkQ03526 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
ItkQ03526 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ItkQ03526 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ItkQ03526 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ItkQ03526 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ItkQ03526 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
ItkQ03526 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
ItkQ03526 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ItkQ03526 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ItkQ03526 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ItkQ03526 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ItkQ03526 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ItkQ03526 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ItkQ03526 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
ItkQ03526 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ItkQ03526 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ItkQ03526 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
ItkQ03526 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ItkQ03526 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ItkQ03526 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ItkQ03526 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ItkQ03526 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
ItkQ03526 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ItkQ03526 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ItkQ03526 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ItkQ03526 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ItkQ03526 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ItkQ03526 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ItkQ03526 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ItkQ03526 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
ItkQ03526 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ItkQ03526 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ItkQ03526 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ItkQ03526 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ItkQ03526 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ItkQ03526 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ItkQ03526 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ItkQ03526 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ItkQ03526 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ItkQ03526 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ItkQ03526 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ItkQ03526 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ItkQ03526 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ItkQ03526 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
ItkQ03526 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ItkQ03526 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ItkQ03526 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ItkQ03526 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ItkQ03526 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ItkQ03526 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ItkQ03526 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ItkQ03526 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ItkQ03526 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ItkQ03526 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ItkQ03526 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ItkQ03526 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ItkQ03526 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms