Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
PudpQ9D5U5 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PudpQ9D5U5 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PudpQ9D5U5 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
PudpQ9D5U5 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PudpQ9D5U5 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PudpQ9D5U5 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
PudpQ9D5U5 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PudpQ9D5U5 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PudpQ9D5U5 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
PudpQ9D5U5 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
PudpQ9D5U5 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
PudpQ9D5U5 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PudpQ9D5U5 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PudpQ9D5U5 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PudpQ9D5U5 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
PudpQ9D5U5 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PudpQ9D5U5 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PudpQ9D5U5 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PudpQ9D5U5 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PudpQ9D5U5 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PudpQ9D5U5 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PudpQ9D5U5 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
PudpQ9D5U5 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PudpQ9D5U5 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PudpQ9D5U5 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PudpQ9D5U5 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PudpQ9D5U5 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PudpQ9D5U5 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PudpQ9D5U5 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PudpQ9D5U5 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PudpQ9D5U5 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PudpQ9D5U5 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PudpQ9D5U5 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PudpQ9D5U5 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PudpQ9D5U5 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PudpQ9D5U5 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PudpQ9D5U5 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
PudpQ9D5U5 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PudpQ9D5U5 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PudpQ9D5U5 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PudpQ9D5U5 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PudpQ9D5U5 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PudpQ9D5U5 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PudpQ9D5U5 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PudpQ9D5U5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PudpQ9D5U5 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PudpQ9D5U5 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PudpQ9D5U5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PudpQ9D5U5 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PudpQ9D5U5 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PudpQ9D5U5 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PudpQ9D5U5 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PudpQ9D5U5 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PudpQ9D5U5 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PudpQ9D5U5 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PudpQ9D5U5 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PudpQ9D5U5 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PudpQ9D5U5 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PudpQ9D5U5 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PudpQ9D5U5 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PudpQ9D5U5 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PudpQ9D5U5 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PudpQ9D5U5 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PudpQ9D5U5 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PudpQ9D5U5 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PudpQ9D5U5 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PudpQ9D5U5 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PudpQ9D5U5 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PudpQ9D5U5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PudpQ9D5U5 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PudpQ9D5U5 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PudpQ9D5U5 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PudpQ9D5U5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PudpQ9D5U5 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PudpQ9D5U5 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PudpQ9D5U5 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PudpQ9D5U5 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PudpQ9D5U5 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PudpQ9D5U5 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PudpQ9D5U5 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PudpQ9D5U5 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PudpQ9D5U5 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PudpQ9D5U5 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PudpQ9D5U5 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PudpQ9D5U5 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PudpQ9D5U5 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PudpQ9D5U5 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PudpQ9D5U5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PudpQ9D5U5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PudpQ9D5U5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PudpQ9D5U5 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PudpQ9D5U5 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PudpQ9D5U5 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PudpQ9D5U5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PudpQ9D5U5 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PudpQ9D5U5 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PudpQ9D5U5 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PudpQ9D5U5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PudpQ9D5U5 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.4 ms