Protein–RNA interactions for Protein: P46660

Ina, Alpha-internexin, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
InaP46660 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
InaP46660 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
InaP46660 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
InaP46660 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
InaP46660 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
InaP46660 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
InaP46660 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
InaP46660 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
InaP46660 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
InaP46660 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
InaP46660 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
InaP46660 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
InaP46660 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
InaP46660 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
InaP46660 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
InaP46660 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
InaP46660 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
InaP46660 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
InaP46660 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
InaP46660 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
InaP46660 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
InaP46660 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
InaP46660 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
InaP46660 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
InaP46660 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
InaP46660 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
InaP46660 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
InaP46660 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
InaP46660 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
InaP46660 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
InaP46660 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
InaP46660 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
InaP46660 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
InaP46660 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
InaP46660 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
InaP46660 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
InaP46660 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
InaP46660 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
InaP46660 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
InaP46660 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
InaP46660 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
InaP46660 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
InaP46660 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
InaP46660 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
InaP46660 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
InaP46660 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
InaP46660 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
InaP46660 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
InaP46660 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
InaP46660 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
InaP46660 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
InaP46660 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
InaP46660 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
InaP46660 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
InaP46660 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
InaP46660 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
InaP46660 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
InaP46660 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
InaP46660 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
InaP46660 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
InaP46660 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
InaP46660 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
InaP46660 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
InaP46660 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
InaP46660 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
InaP46660 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
InaP46660 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
InaP46660 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
InaP46660 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
InaP46660 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
InaP46660 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
InaP46660 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
InaP46660 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
InaP46660 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
InaP46660 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
InaP46660 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
InaP46660 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
InaP46660 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
InaP46660 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
InaP46660 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
InaP46660 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
InaP46660 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
InaP46660 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
InaP46660 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
InaP46660 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
InaP46660 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
InaP46660 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
InaP46660 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
InaP46660 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
InaP46660 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
InaP46660 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
InaP46660 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
InaP46660 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
InaP46660 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
InaP46660 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
InaP46660 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
InaP46660 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
InaP46660 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
InaP46660 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
InaP46660 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms