Protein–RNA interactions for Protein: Q9BDB7

Ifi44l, Interferon-induced protein 44-like, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi44lQ9BDB7 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
Ifi44lQ9BDB7 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Ifi44lQ9BDB7 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Ifi44lQ9BDB7 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Ifi44lQ9BDB7 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Ifi44lQ9BDB7 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Ifi44lQ9BDB7 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Ifi44lQ9BDB7 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
Ifi44lQ9BDB7 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
Ifi44lQ9BDB7 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Ifi44lQ9BDB7 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Ifi44lQ9BDB7 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Ifi44lQ9BDB7 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Ifi44lQ9BDB7 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ifi44lQ9BDB7 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ifi44lQ9BDB7 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ifi44lQ9BDB7 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ifi44lQ9BDB7 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ifi44lQ9BDB7 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Ifi44lQ9BDB7 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ifi44lQ9BDB7 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ifi44lQ9BDB7 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ifi44lQ9BDB7 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Ifi44lQ9BDB7 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ifi44lQ9BDB7 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ifi44lQ9BDB7 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ifi44lQ9BDB7 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ifi44lQ9BDB7 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ifi44lQ9BDB7 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ifi44lQ9BDB7 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ifi44lQ9BDB7 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ifi44lQ9BDB7 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ifi44lQ9BDB7 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ifi44lQ9BDB7 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ifi44lQ9BDB7 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ifi44lQ9BDB7 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ifi44lQ9BDB7 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ifi44lQ9BDB7 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Ifi44lQ9BDB7 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Ifi44lQ9BDB7 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ifi44lQ9BDB7 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ifi44lQ9BDB7 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ifi44lQ9BDB7 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ifi44lQ9BDB7 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ifi44lQ9BDB7 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ifi44lQ9BDB7 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ifi44lQ9BDB7 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ifi44lQ9BDB7 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ifi44lQ9BDB7 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Ifi44lQ9BDB7 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ifi44lQ9BDB7 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ifi44lQ9BDB7 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ifi44lQ9BDB7 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ifi44lQ9BDB7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ifi44lQ9BDB7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ifi44lQ9BDB7 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ifi44lQ9BDB7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Ifi44lQ9BDB7 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ifi44lQ9BDB7 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ifi44lQ9BDB7 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Ifi44lQ9BDB7 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ifi44lQ9BDB7 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ifi44lQ9BDB7 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ifi44lQ9BDB7 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ifi44lQ9BDB7 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ifi44lQ9BDB7 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ifi44lQ9BDB7 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ifi44lQ9BDB7 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ifi44lQ9BDB7 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ifi44lQ9BDB7 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ifi44lQ9BDB7 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ifi44lQ9BDB7 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ifi44lQ9BDB7 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ifi44lQ9BDB7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Ifi44lQ9BDB7 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ifi44lQ9BDB7 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ifi44lQ9BDB7 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ifi44lQ9BDB7 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ifi44lQ9BDB7 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ifi44lQ9BDB7 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ifi44lQ9BDB7 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ifi44lQ9BDB7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ifi44lQ9BDB7 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ifi44lQ9BDB7 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Ifi44lQ9BDB7 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ifi44lQ9BDB7 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ifi44lQ9BDB7 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ifi44lQ9BDB7 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ifi44lQ9BDB7 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ifi44lQ9BDB7 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ifi44lQ9BDB7 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ifi44lQ9BDB7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ifi44lQ9BDB7 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ifi44lQ9BDB7 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ifi44lQ9BDB7 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ifi44lQ9BDB7 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ifi44lQ9BDB7 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ifi44lQ9BDB7 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ifi44lQ9BDB7 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ifi44lQ9BDB7 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.1 ms